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Oncotarget ; 7(50): 83319-83329, 2016 Dec 13.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-27825111

RESUMO

As a part of an international study on the molecular analysis of Diffuse Large B-cell Lymphoma (DLBCL), a robust protocol for gene expression analysis from RNA extraction to qRT-PCR using Formalin Fixed Paraffin Embedded tissues was developed. Here a study was conducted to define a strategy to validate the previously reported 6-gene (LMO2, BCL6, FN1, CCND2, SCYA3 and BCL2) model as predictor of prognosis in DLBCL. To avoid variation, all samples were tested in a single centre and single platform. This study comprised 8 countries (Brazil, Chile, Hungary, India, Philippines, S. Korea, Thailand and Turkey). Using the Kaplan-Meier and log rank test on patients (n=162) and two mortality risk groups (with those above and below the mean representing high and low risk groups) confirmed that the 6-gene predictor score correlates significantly with overall survival (OS, p<0.01) but not with event free survival (EFS, p=0.18). Adding the International Prognostic Index (IPI) shows that the 6-gene predictor score correlates significantly with high IPI scores for OS (p<0.05), whereas those with low IPI scores show a trend not reaching significance (p=0.08). This study defined an effective and economical qRT-PCR strategy and validated the 6-gene score as a predictor of OS in an international setting.


Assuntos
Biomarcadores Tumorais/genética , Fixadores/química , Formaldeído/química , Perfilação da Expressão Gênica/métodos , Linfoma Difuso de Grandes Células B/genética , Inclusão em Parafina , Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa , Fixação de Tecidos/métodos , Transcriptoma , Idoso , Ásia , Biópsia , Intervalo Livre de Doença , Europa (Continente) , Feminino , Perfilação da Expressão Gênica/normas , Predisposição Genética para Doença , Humanos , Estimativa de Kaplan-Meier , Linfoma Difuso de Grandes Células B/tratamento farmacológico , Linfoma Difuso de Grandes Células B/mortalidade , Linfoma Difuso de Grandes Células B/patologia , Masculino , Pessoa de Meia-Idade , Fenótipo , Valor Preditivo dos Testes , Modelos de Riscos Proporcionais , Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real/normas , Reprodutibilidade dos Testes , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa/normas , América do Sul , Fatores de Tempo
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