RESUMO
The objective was to investigate gene and protein expression of myosin heavy chain (MyHC) in Nellore cattle slaughtered at different weights (BW) or degrees of meat tenderness. Ninety animals with initial BW 370 ± 37 kg, 24 months of age, were slaughtered after 95 days on feed. We evaluated shear force (SF), myofibrillar fragmentation index, ribeye area, backfat thickness, marbling, color, and cooking losses. Subsequently, 24 animals were selected and divided into four contrasting groups, in which light (BW = 504.58 ± 32.36 kg) versus heavy animals (BW = 604.83 ± 42.97 kg) and animals with tender (SF = 3.88 ± 0.57 kg) versus tough meat (SF = 7.95 ± 1.04 kg) were compared. The MYH7, MYH2 and MYH1 genes were analyzed by real-time PCR. The MyHC isoforms (MyHC-I, MyHC-IIa, and MyHC-IIx) were quantified by SDS-PAGE electrophoresis. We found lower expression of MYH2 and MYH1 genes in heavy compared to light animals and a higher amount of MyHC-I isoform in the tough meat group compared to the tender meat group. Protein expression of MyHC-IIa was higher in the tender meat group. A negative correlation was found of this protein and SF (tenderness), suggesting MyHC-IIa as a biomarker of meat quality.
Assuntos
Bovinos/crescimento & desenvolvimento , Bovinos/genética , Regulação da Expressão Gênica/fisiologia , Carne/normas , Cadeias Pesadas de Miosina/genética , Animais , Músculo Esquelético/metabolismoRESUMO
The main objectives of this study were to identify and functionally classify SNPs and indels by exome sequencing of animals of the racing line of Quarter Horses. Based on the individual genomic estimated breeding values (GEBVs) for maximum speed index (SImax) obtained for 349 animals, two groups of 20 extreme animals were formed. Of these individuals, 20 animals with high GEBVs for SImax and 19 with low GEBVs for SImax had their exons and 5' and 3' UTRs sequenced. Considering SNPs and indels, 105 182 variants were identified in the expressed regions of the Quarter Horse genome. Of these, 72 166 variants were already known and 33 016 are new variants and were deposited in a database. The analysis of the set of gene variants significantly related (Padjusted < 0.05) to extreme animals in conjunction with the predicted impact of the changes and the physiological role of protein product pointed to two candidate genes potentially related to racing performance: SLC3A1 on ECA15 and CCN6 on ECA10.
Assuntos
Exoma/genética , Cavalos/fisiologia , Mutação INDEL/genética , Condicionamento Físico Animal , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Animais , Cruzamento , Cavalos/genéticaRESUMO
Genetic improvement, without control of inbreeding, can go to loss of genetic variability, reducing the potential for genetic gains in the domestic populations. The aim of this study was to analyze the population structure and the inbreeding depression in Campolina horses. Phenotype information from 43 465 individuals was analyzed, data provided by the Campolina Breeders Association. A pedigree file containing 107 951 horses was used to connected the phenotyped individuals. The inbreeding coefficient was performed by use of the diagonal of the relationship matrix and the genealogical parameters were computed using proper softwares. The effective population size was estimated based on the rate of inbreeding and census information, and the stratification of the population was verified by the average relationship coefficient between animals born in different regions of Brazil. The effects of inbreeding on morphological traits were made by the use of inbreeding coefficient as a covariate in the model of random regression. The inbreeding coefficient increased from 1990 on, impacting effective population size and, consequently, shrinking genetic variability. The paternal inbreeding was greater than maternal, which may be attributed to the preference for inbred animals in reproduction. The average genetic relationship coefficient of animals born in different states was lower than individuals born within the same state. The increase in the inbreeding coefficient was negatively associated with all studied traits, showing the importance to avoid genetic losses in the long term. Although results do not indicate a severe narrowing of the population until the present date, the average relationship coefficient shows signs of increase, which could cause a drastic reduction in genetic variability if inbred mating is not successfully controlled in the Campolina horse population.
RESUMO
The objective of the present study was to estimate genetic parameters for skin thickness (ST) and postweaning weight gain (PWG550) in Nellore cattle. Records were obtained from 152,392 Nellore animals born between 2001 and 2011. ST was measured in the posterior region of the animal's scapula with a millimeter caliper. The animals were assigned to different contemporary groups, formed on the basis of farm, year, sex, feeding regimen at weaning, date of weaning, feeding regimen at 450 days of age, and date of weighing at 450 days of age. The genetic parameters were estimated by Bayesian analysis using the GIBBS1F90 program. The mean ST and PWG550 observed were 7.71 ± 2.04 mm and 115.95 ± 36.17 kg, respectively. The posterior mean estimates of heritability (h2) were 0.12 ± 0.02 and 0.29 ± 0.02 for ST and PWG550, respectively. The posterior mean estimates of the phenotypic, genetic, and environmental correlations between the traits were 0.16 ± 0.0, 0.17 ± 0.02, and 0.17 ± 0.09, respectively. The traits ST and PWG550 showed sufficient additive genetic variance to be used as selection criteria in breeding programs. The low genetic correlation obtained indicates that genes favoring the expression of one trait may not influence the other. Consequently, a selection favoring ST would be less efficient in increasing PWG550.
Assuntos
Bovinos/genética , Modelos Genéticos , Característica Quantitativa Herdável , Pele/anatomia & histologia , Aumento de Peso/genética , Animais , Teorema de Bayes , Cruzamento , Bovinos/anatomia & histologia , Bovinos/fisiologia , Feminino , Interação Gene-Ambiente , MasculinoRESUMO
Este estudo foi realizado com o objetivo de determinar a concentração de lactato sanguíneo durante o período de confinamento e após o abate, e verificar sua influência em peso corporal e características de qualidade da carne de bovinos Nelore terminados em confinamento. Foram utilizados 90 animais machos não castrados da raça Nelore, com peso médio inicial de 390 ± 37 kg e idade próxima de 24 meses. A concentração de lactato no sangue foi medida por espectrofotometria nos dias 1 (Lac01), 14 (Lac14), 27 (Lac27) e 69 (Lac69) do período de confinamento e imediatamente após o abate (Lac96). Foram coletadas amostras de carne in natura do músculo Longissimus thoracis para determinação de luminosidade, intensidade de coloração vermelha (a*) e amarela (b*), força de cisalhamento e pH da carne sem maturação e com maturação de sete dias. As concentrações de lactato foram analisadas pelo PROC MIXED do programa SAS, considerando no modelo os efeitos de baia e dia da coleta da amostra de sangue. Correlações simples entre as variáveis estudadas foram estimadas utilizando-se o procedimento CORR do programa SAS. O lactato se manteve estável durante o período do confinamento, com médias iguais a 4,83 ± 0,30 mMol/L; 5,68 ± 0,29 mMol/L; 5,03 ± 0,29 mMol/L e 4,15 ± 0,31 mMol/L para Lac01, Lac14, Lac27 e Lac69, respectivamente. A maior média da concentração de lactato foi obtida no dia do abate (Lac96: 10,77 ± 0,27 mMol/L). Foi detectada associação significativa entre os parâmetros de cor a* e b* da carne não maturada e a concentração de lactato no dia do abate (Lac96). Não há associação entre a concentração sanguínea de lactato no dia do abate e o peso corporal de animais Nelore terminados em confinamento..
The objective of this study was to determine blood lactate concentration during the finishing period and after slaughter and to verify its influence on body weight and meat quality traits of Nellore bulls feedlot finished. Ninety Nellore males were used, with a mean initial body weight of 390 ± 37 kg and age of 24 months. Lactate concentration in the blood was measured by spectrophotometry on days 1 (Lac01), 14 (Lac14), 27 (Lac27) and 69 (Lac69) of the feedlot period and immediately after slaughter (Lac96). Fresh meat samples were collected from the Longissimus thoracis muscle for determination of luminosity, red (a *) and yellow (b *) intensity, shear force and pH of unaged meat and aged for seven days. Lactate concentrations were analyzed by the PROC MIXED of the SAS program, considering in the model the effects of pen and day of blood samples collection. Simple correlations between the studied variables were estimated using the procedure CORR of the program SAS. The lactate was stable during the confinement period, with mean values equal to 4.83 ± 0.30 mMol/L; 5.68 ± 0.29 mMol/L; 5.03 ± 0.29 mMol/L and 4.15 ± 0.31 mMol/L for Lac01, Lac14, Lac27 and Lac69, respectively. The highest mean lactate concentration was obtained on the day of slaughter (Lac96: 10.77 ± 0.27 mMol/L). Significant association was detected between a * and b * color parameters of the unaged meat and the lactate concentration at the day of slaughter (Lac96). There is no association between blood lactate concentration at the day of slaughter and body weight of Nellore animals feedlot finished. Blood lactate concentration on the day of slaughter is associated with the coloring of the meat and is independent of other measures of meat quality in Nellore animals feedlot finished...
Assuntos
Masculino , Animais , Bovinos , Abate de Animais/métodos , Carne , Comportamento Animal , Qualidade dos Alimentos , Bovinos/classificaçãoRESUMO
Este estudo foi realizado com o objetivo de determinar a concentração de lactato sanguíneo durante o período de confinamento e após o abate, e verificar sua influência em peso corporal e características de qualidade da carne de bovinos Nelore terminados em confinamento. Foram utilizados 90 animais machos não castrados da raça Nelore, com peso médio inicial de 390 ± 37 kg e idade próxima de 24 meses. A concentração de lactato no sangue foi medida por espectrofotometria nos dias 1 (Lac01), 14 (Lac14), 27 (Lac27) e 69 (Lac69) do período de confinamento e imediatamente após o abate (Lac96). Foram coletadas amostras de carne in natura do músculo Longissimus thoracis para determinação de luminosidade, intensidade de coloração vermelha (a*) e amarela (b*), força de cisalhamento e pH da carne sem maturação e com maturação de sete dias. As concentrações de lactato foram analisadas pelo PROC MIXED do programa SAS, considerando no modelo os efeitos de baia e dia da coleta da amostra de sangue. Correlações simples entre as variáveis estudadas foram estimadas utilizando-se o procedimento CORR do programa SAS. O lactato se manteve estável durante o período do confinamento, com médias iguais a 4,83 ± 0,30 mMol/L; 5,68 ± 0,29 mMol/L; 5,03 ± 0,29 mMol/L e 4,15 ± 0,31 mMol/L para Lac01, Lac14, Lac27 e Lac69, respectivamente. A maior média da concentração de lactato foi obtida no dia do abate (Lac96: 10,77 ± 0,27 mMol/L). Foi detectada associação significativa entre os parâmetros de cor a* e b* da carne não maturada e a concentração de lactato no dia do abate (Lac96). Não há associação entre a concentração sanguínea de lactato no dia do abate e o peso corporal de animais Nelore terminados em confinamento..(AU)
The objective of this study was to determine blood lactate concentration during the finishing period and after slaughter and to verify its influence on body weight and meat quality traits of Nellore bulls feedlot finished. Ninety Nellore males were used, with a mean initial body weight of 390 ± 37 kg and age of 24 months. Lactate concentration in the blood was measured by spectrophotometry on days 1 (Lac01), 14 (Lac14), 27 (Lac27) and 69 (Lac69) of the feedlot period and immediately after slaughter (Lac96). Fresh meat samples were collected from the Longissimus thoracis muscle for determination of luminosity, red (a *) and yellow (b *) intensity, shear force and pH of unaged meat and aged for seven days. Lactate concentrations were analyzed by the PROC MIXED of the SAS program, considering in the model the effects of pen and day of blood samples collection. Simple correlations between the studied variables were estimated using the procedure CORR of the program SAS. The lactate was stable during the confinement period, with mean values equal to 4.83 ± 0.30 mMol/L; 5.68 ± 0.29 mMol/L; 5.03 ± 0.29 mMol/L and 4.15 ± 0.31 mMol/L for Lac01, Lac14, Lac27 and Lac69, respectively. The highest mean lactate concentration was obtained on the day of slaughter (Lac96: 10.77 ± 0.27 mMol/L). Significant association was detected between a * and b * color parameters of the unaged meat and the lactate concentration at the day of slaughter (Lac96). There is no association between blood lactate concentration at the day of slaughter and body weight of Nellore animals feedlot finished. Blood lactate concentration on the day of slaughter is associated with the coloring of the meat and is independent of other measures of meat quality in Nellore animals feedlot finished...(AU)
Assuntos
Animais , Masculino , Bovinos , Carne , Comportamento Animal , Abate de Animais/métodos , Qualidade dos Alimentos , Bovinos/classificaçãoRESUMO
The objective of this study was to evaluate the effect of backfat thickness (BFT) on the meat quality of feedlot-finished Nellore bulls (Bos indicus). Seventy-two animals were feedlot finished for about 100 days. For this study, 24 animals were sampled according to BFT in the longissimus thoracis muscle after slaughter: 12 animals with BFT up to 3.0 mm (class BFT-3) and 12 animals with BFT > 6.0 mm (class BFT-6). Chemical (myofibrillar fragmentation index, intramuscular fat content, and unsaturated and saturated fatty acids) and physical (cold carcass weight, rib eye area, and marbling score) characteristics of the meat were evaluated. Additionally, shear force and sensory characteristics (aroma, flavor, tenderness, chewiness, and juiciness) were analyzed. Marbling score and intramuscular fat content were considered low for the two BFT classes. The mean values of the characteristics studied did not differ (P>0.05) between BFT classes, except for fatty acids, with the observation of higher unsaturated fatty acid levels in the BFT-6 class. There was no difference (P>0.05) in sensory characteristics between BFT classes. The most consistent relationship was observed between the myofibrillar fragmentation index and tenderness, measured as shear force, in animals with greater BFT (BFT-6 class) compared to animals with lower BFT (BFT-3 class), suggesting possible tenderness problems in animals with a leaner carcass. The observation of a higher concentration of unsaturated fatty acids in animals with greater BFT suggests an increase in the sensory perception of meat, especially flavor...(AU)
O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da espessura de gordura subcutânea (EGS) na qualidade da carne de bovinos machos Nelore (Bos indicus), inteiros, terminados em confinamento. Setenta e dois animais foram terminados em confinamento por cerca de 100 dias. Para o presente estudo, 24 animais foram amostrados de acordo com a EGS obtida no longissimus thoracis, após o abate: 12 animais com EGS até 3,0 mm (classe EGS-3) e 12 animais com EGS maior que 6,0 mm (classe EGS-6). Foram avaliadas características químicas da carne (índice de fragmentação miofibrilar, conteúdo de lipídeos intramusculares e ácidos graxos insaturados e saturados), e características físicas da carcaça (peso da carcaça resfriada, área de olho de lombo e escore de marmorização). Adicionalmente, foram avaliadas em amostras maturadas por 21 dias, a força de cisalhamento e características sensoriais (aroma, sabor, maciez, mastigabilidade e suculência). Os valores de escore de marmorização e de conteúdo de lipídeos intramusculares foram considerados baixos para ambas as classes de EGS. As médias das características avaliadas não diferiram (P>0,05) entre as classes de EGS, com exceção dos ácidos graxos, que foi superior para o insaturado na classe EGS-6. As características sensoriais não diferiram (P>0,05) entre as classes de EGS. Foi verificado relação mais consistente entre índice de fragmentação miofibrilar e maciez, medida pela força de cisalhamento, em animais com maior EGS (classe EGS-6), comparativamente a animais com menor EGS (classe EGS-3), o que sugere possível problema de maciez em animais de carcaça mais magra. A observação de maior concentração de ácidos graxos insaturados em animais com maior EGS sugere aumento da percepção sensorial da carne, especialmente do sabor...(AU)
Assuntos
Animais , Bovinos , Bovinos/classificação , Gordura Subcutânea/fisiologia , Carne , Crescimento e DesenvolvimentoRESUMO
Objetivou-se com o trabalho verificar o efeito da heterozigose individual no peso aos 365 dias (P365) e peso aos 550 dias (P550) de idade, assim como estimar a herdabilidade das características em estudo e os valores genéticos de animais de diferentes composições raciais envolvendo a raça Angus e zebuínos, a fim de observar a possibilidade do uso destas características como critérios de seleção em programas de cruzamento e melhoramento genético. Foram utilizados registros de 5.629 animais mestiços Angus x Zebu, nascidos no período de 1995 a 2004. Foram realizadas análises univariadas e bivariadas das características por meio de modelo animal e inferência bayesiana. Os efeitos incluídos no modelo foram grupo contemporâneo, heterozigose individual, idade do animal na pesagem, efeito aleatório genético direto do animal e resíduo. O tamanho da cadeia solicitado, bem como o período e o intervalo amostral, foram suficientes para obter convergência das estimativas a posteriori dos parâmetros genéticos. As estimativas de herdabilidade obtidas nas análises univariadas e na análise bivariada foram 0,38 e 0,30, e 0,32 e 0,30, respectivamente para P365 e P550. A estimativa de correlação genética entre as características foi 0,98. Ao comparar a classificação dos 10 melhores touros com base nos valores genéticos para P365 e P550, observou-se pequena diferença nas classificações para as características estudadas. O efeito da heterozigose tem importância nos cruzamentos e na obtenção de maiores pesos pós desmama, indicando que a utilização de animais com heterozigose individual máxima é vantajosa. As características P365 e P550 apresentaram-se como apropriados critérios de seleção, sugerindo que devam ser incluídas em programas de melhoramento de bovinos cruzados Angus x Zebu...(AU)
The objective of this study was to verify the effect of individual heterozygosity on weights at 365 (W365) and 550 (W550) days of age, and to estimate the heritability of these traits and the breeding values of animals of different breed compositions involving Angus and Zebu breeds in order to evaluate the possible use of these traits as selection criteria in crossbreeding and genetic improvement programs. Records from 5,629 crossbred Angus x Zebu animals born between 1995 and 2004 were used. Univariate and bivariate analyses of the traits were performed using an animal model and Bayesian inference. The effects included in the model were contemporary group, individual heterozygosis, age of animal at recording, and random direct genetic effect of the animal and residual. The size of the chain requested, as well as the burn-in period and thinning interval, was sufficient to obtain convergence of the posterior estimates of the genetic parameters. The heritability estimates obtained in univariate and bivariate analysis were 0.38 and 0.30 for W365 and 0.32 and 0.30 for W550, respectively. The genetic correlation between traits was 0.98. Comparison of the rank of the 10 best sires based on the breeding values for W365 and W550 showed a small difference between the traits studied. The effect of heterozygosity has importance for crossings and for obtaining higher postweaning weights, indicating that the use of animals with maximum individual heterozygosity is advantageous. W365 and W550 were found to be appropriate selection criteria and should be included in breeding programs of crossbred Angus x Zebu cattle...(AU)
Assuntos
Animais , Bovinos , Bovinos/classificação , Cruzamentos Genéticos , Crescimento/genética , Hereditariedade/genéticaRESUMO
Objetivou-se com o trabalho verificar o efeito da heterozigose individual no peso aos 365 dias (P365) e peso aos 550 dias (P550) de idade, assim como estimar a herdabilidade das características em estudo e os valores genéticos de animais de diferentes composições raciais envolvendo a raça Angus e zebuínos, a fim de observar a possibilidade do uso destas características como critérios de seleção em programas de cruzamento e melhoramento genético. Foram utilizados registros de 5.629 animais mestiços Angus x Zebu, nascidos no período de 1995 a 2004. Foram realizadas análises univariadas e bivariadas das características por meio de modelo animal e inferência bayesiana. Os efeitos incluídos no modelo foram grupo contemporâneo, heterozigose individual, idade do animal na pesagem, efeito aleatório genético direto do animal e resíduo. O tamanho da cadeia solicitado, bem como o período e o intervalo amostral, foram suficientes para obter convergência das estimativas a posteriori dos parâmetros genéticos. As estimativas de herdabilidade obtidas nas análises univariadas e na análise bivariada foram 0,38 e 0,30, e 0,32 e 0,30, respectivamente para P365 e P550. A estimativa de correlação genética entre as características foi 0,98. Ao comparar a classificação dos 10 melhores touros com base nos valores genéticos para P365 e P550, observou-se pequena diferença nas classificações para as características estudadas. O efeito da heterozigose tem importância nos cruzamentos e na obtenção de maiores pesos pós desmama, indicando que a utilização de animais com heterozigose individual máxima é vantajosa. As características P365 e P550 apresentaram-se como apropriados critérios de seleção, sugerindo que devam ser incluídas em programas de melhoramento de bovinos cruzados Angus x Zebu...
The objective of this study was to verify the effect of individual heterozygosity on weights at 365 (W365) and 550 (W550) days of age, and to estimate the heritability of these traits and the breeding values of animals of different breed compositions involving Angus and Zebu breeds in order to evaluate the possible use of these traits as selection criteria in crossbreeding and genetic improvement programs. Records from 5,629 crossbred Angus x Zebu animals born between 1995 and 2004 were used. Univariate and bivariate analyses of the traits were performed using an animal model and Bayesian inference. The effects included in the model were contemporary group, individual heterozygosis, age of animal at recording, and random direct genetic effect of the animal and residual. The size of the chain requested, as well as the burn-in period and thinning interval, was sufficient to obtain convergence of the posterior estimates of the genetic parameters. The heritability estimates obtained in univariate and bivariate analysis were 0.38 and 0.30 for W365 and 0.32 and 0.30 for W550, respectively. The genetic correlation between traits was 0.98. Comparison of the rank of the 10 best sires based on the breeding values for W365 and W550 showed a small difference between the traits studied. The effect of heterozygosity has importance for crossings and for obtaining higher postweaning weights, indicating that the use of animals with maximum individual heterozygosity is advantageous. W365 and W550 were found to be appropriate selection criteria and should be included in breeding programs of crossbred Angus x Zebu cattle...
Assuntos
Animais , Bovinos , Bovinos/classificação , Crescimento/genética , Cruzamentos Genéticos , Hereditariedade/genéticaRESUMO
The objective of this study was to evaluate the effect of backfat thickness (BFT) on the meat quality of feedlot-finished Nellore bulls (Bos indicus). Seventy-two animals were feedlot finished for about 100 days. For this study, 24 animals were sampled according to BFT in the longissimus thoracis muscle after slaughter: 12 animals with BFT up to 3.0 mm (class BFT-3) and 12 animals with BFT > 6.0 mm (class BFT-6). Chemical (myofibrillar fragmentation index, intramuscular fat content, and unsaturated and saturated fatty acids) and physical (cold carcass weight, rib eye area, and marbling score) characteristics of the meat were evaluated. Additionally, shear force and sensory characteristics (aroma, flavor, tenderness, chewiness, and juiciness) were analyzed. Marbling score and intramuscular fat content were considered low for the two BFT classes. The mean values of the characteristics studied did not differ (P>0.05) between BFT classes, except for fatty acids, with the observation of higher unsaturated fatty acid levels in the BFT-6 class. There was no difference (P>0.05) in sensory characteristics between BFT classes. The most consistent relationship was observed between the myofibrillar fragmentation index and tenderness, measured as shear force, in animals with greater BFT (BFT-6 class) compared to animals with lower BFT (BFT-3 class), suggesting possible tenderness problems in animals with a leaner carcass. The observation of a higher concentration of unsaturated fatty acids in animals with greater BFT suggests an increase in the sensory perception of meat, especially flavor...
O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da espessura de gordura subcutânea (EGS) na qualidade da carne de bovinos machos Nelore (Bos indicus), inteiros, terminados em confinamento. Setenta e dois animais foram terminados em confinamento por cerca de 100 dias. Para o presente estudo, 24 animais foram amostrados de acordo com a EGS obtida no longissimus thoracis, após o abate: 12 animais com EGS até 3,0 mm (classe EGS-3) e 12 animais com EGS maior que 6,0 mm (classe EGS-6). Foram avaliadas características químicas da carne (índice de fragmentação miofibrilar, conteúdo de lipídeos intramusculares e ácidos graxos insaturados e saturados), e características físicas da carcaça (peso da carcaça resfriada, área de olho de lombo e escore de marmorização). Adicionalmente, foram avaliadas em amostras maturadas por 21 dias, a força de cisalhamento e características sensoriais (aroma, sabor, maciez, mastigabilidade e suculência). Os valores de escore de marmorização e de conteúdo de lipídeos intramusculares foram considerados baixos para ambas as classes de EGS. As médias das características avaliadas não diferiram (P>0,05) entre as classes de EGS, com exceção dos ácidos graxos, que foi superior para o insaturado na classe EGS-6. As características sensoriais não diferiram (P>0,05) entre as classes de EGS. Foi verificado relação mais consistente entre índice de fragmentação miofibrilar e maciez, medida pela força de cisalhamento, em animais com maior EGS (classe EGS-6), comparativamente a animais com menor EGS (classe EGS-3), o que sugere possível problema de maciez em animais de carcaça mais magra. A observação de maior concentração de ácidos graxos insaturados em animais com maior EGS sugere aumento da percepção sensorial da carne, especialmente do sabor...
Assuntos
Animais , Bovinos , Bovinos/classificação , Carne , Gordura Subcutânea/fisiologia , Crescimento e DesenvolvimentoRESUMO
In this study, we estimated the heritability (h(2)) of earnings in the Quarter Horse in order to evaluate the inclusion of this trait in breeding programs. Records from 14,754 races of 2443 horses from 1978-2009 were provided by Sorocaba Hippodrome, São Paulo, Brazil. All ancestors of the registered horses were included in the pedigree file until the 4th generation. Log-transformed performance measures (LPM) were analyzed for animals aged 2, 3, and 4 years and during their entire career. The h(2) estimates were obtained using a multi-trait model and Gibbs sampling that included the effects of sex, year of race, and animal in all analyses. Five analyses were performed: 1 in which LPM was divided by the number of prizes, 1 in which LPM was divided by the number of race starts, and 3 analyses that included the number of prizes, number of race starts, and both (LPM_cNPS) as covariates. Analysis was performed with and without inclusion of the maternal effect. Models were compared based on the deviance information criterion and LPM_cNPS including maternal effects was found to be the best model. The h(2) estimates and standard deviation obtained using model LPM_cNPS were 0.19 ± 0.08, 0.21 ± 0.08, 0.22 ± 0.09, and 0.21 ± 0.07 for earnings at 2, 3, and 4 years of age and total career, respectively. Our analyses indicate that earnings are subject to selection and can be included in breeding programs to improve the racing performance of Quarter Horses.
Assuntos
Característica Quantitativa Herdável , Corrida , Fatores Etários , Animais , Brasil , Cruzamento , Estudos de Associação Genética , Cavalos , Modelos EstatísticosRESUMO
Selection of Quarter Horses for different purposes has led to the formation of lines, including racing and cutting horses. The objective of this study was to identify genomic regions divergently selected in racing line of Quarter Horses in relation to cutting line applying relative extended haplotype homozygosity (REHH) analysis, an extension of extended haplotype homozygosity (EHH) analysis, and the fixation index (F ST) statistic. A total of 188 horses of both sexes, born between 1985 and 2009 and registered at the Brazilian Association of Quarter Horse Breeders, including 120 of the racing line and 68 of the cutting line, were genotyped using single nucleotide polymorphism arrays. On the basis of 27 genomic regions identified as selection signatures by REHH and F ST statistics, functional annotations of genes were made in order to identify those that could have been important during formation of the racing line and that could be used subsequently for the development of selection tools. Genes involved in muscle growth (n=8), skeletal growth (n=10), muscle energy metabolism (n=15), cardiovascular system (n=14) and nervous system (n=23) were identified, including the FKTN, INSR, GYS1, CLCN1, MYLK, SYK, ANG, CNTFR and HTR2B.
Assuntos
Genoma , Haplótipos , Cavalos/genética , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Seleção Genética , Animais , Brasil , Feminino , Cavalos/fisiologia , Masculino , Anotação de Sequência Molecular , Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos , CorridaRESUMO
Desde que a possibilidade de determinar a sequência nucleotídica de genomas surgiu em 1975, muitos foram os avanços da genômica. Na década de noventa teve início o sequenciamento do genoma humano, viabilizado em grande parte pelos avanços nos métodos computacionais. Nos últimos dez anos, o advento de tecnologias de sequenciamento de nova geração permitiu o sequenciamento de milhões de bases a baixo custo e em curto espaço de tempo quando comparadas às técnicas de sequenciamento anteriores. Após a conclusão do projeto genoma humano, muitas iniciativas foram tomadas para a realização do sequenciamento de diversas espécies domésticas, gerando grande volume de dados, e redirecionando os estudos genéticos. Esta revisão teve como objetivo descrever o estado atual do sequenciamento das principais espécies de animais domésticos de interesse econômico, bem como de expor as ferramentas mais utilizadas no acesso às informações genômicas.(AU)
There has been a lot of advance in genomics since 1975 when the possibility to determine the nucleotide sequence of a genome was described. In the 90s the human genome sequencing was started and it was greatly favored by advances in computer technologies. In the last ten years the development of next generation sequencing technologies allowed the sequencing of millions of bases at low cost and in a shorter time compared to the previous technologies. After the conclusion of the human genome project, several initiatives to sequence the genome of domestic animal species were taken, resulting in a large amount of data that is redirecting the goals of genetic studies in domestic animals. The aim of this review was to describe the present situation of the sequencing initiatives on the main domestic animal species of economical interest as well as to list the most important tools available to access the genomic information.(AU)
Assuntos
Animais , Genoma/ética , Genoma/genética , Criação de Animais Domésticos/educação , Criação de Animais Domésticos/estatística & dados numéricos , Criação de Animais Domésticos/tendênciasRESUMO
Desde que a possibilidade de determinar a sequência nucleotídica de genomas surgiu em 1975, muitos foram os avanços da genômica. Na década de noventa teve início o sequenciamento do genoma humano, viabilizado em grande parte pelos avanços nos métodos computacionais. Nos últimos dez anos, o advento de tecnologias de sequenciamento de nova geração permitiu o sequenciamento de milhões de bases a baixo custo e em curto espaço de tempo quando comparadas às técnicas de sequenciamento anteriores. Após a conclusão do projeto genoma humano, muitas iniciativas foram tomadas para a realização do sequenciamento de diversas espécies domésticas, gerando grande volume de dados, e redirecionando os estudos genéticos. Esta revisão teve como objetivo descrever o estado atual do sequenciamento das principais espécies de animais domésticos de interesse econômico, bem como de expor as ferramentas mais utilizadas no acesso às informações genômicas. SUMMARY There has been a lot of advance in genomics since 1975 when the possibility to determine the nucleotide seq
RESUMO
Desde que a possibilidade de determinar a sequência nucleotídica de genomas surgiu em 1975, muitos foram os avanços da genômica. Na década de noventa teve início o sequenciamento do genoma humano, viabilizado em grande parte pelos avanços nos métodos computacionais. Nos últimos dez anos, o advento de tecnologias de sequenciamento de nova geração permitiu o sequenciamento de milhões de bases a baixo custo e em curto espaço de tempo quando comparadas às técnicas de sequenciamento anteriores. Após a conclusão do projeto genoma humano, muitas iniciativas foram tomadas para a realização do sequenciamento de diversas espécies domésticas, gerando grande volume de dados, e redirecionando os estudos genéticos. Esta revisão teve como objetivo descrever o estado atual do sequenciamento das principais espécies de animais domésticos de interesse econômico, bem como de expor as ferramentas mais utilizadas no acesso às informações genômicas.
There has been a lot of advance in genomics since 1975 when the possibility to determine the nucleotide sequence of a genome was described. In the 90s the human genome sequencing was started and it was greatly favored by advances in computer technologies. In the last ten years the development of next generation sequencing technologies allowed the sequencing of millions of bases at low cost and in a shorter time compared to the previous technologies. After the conclusion of the human genome project, several initiatives to sequence the genome of domestic animal species were taken, resulting in a large amount of data that is redirecting the goals of genetic studies in domestic animals. The aim of this review was to describe the present situation of the sequencing initiatives on the main domestic animal species of economical interest as well as to list the most important tools available to access the genomic information.
Assuntos
Animais , Criação de Animais Domésticos/educação , Criação de Animais Domésticos/estatística & dados numéricos , Criação de Animais Domésticos/tendências , Genoma/ética , Genoma/genéticaRESUMO
Desde que a possibilidade de determinar a sequência nucleotídica de genomas surgiu em 1975, muitos foram os avanços da genômica. Na década de noventa teve início o sequenciamento do genoma humano, viabilizado em grande parte pelos avanços nos métodos computacionais. Nos últimos dez anos, o advento de tecnologias de sequenciamento de nova geração permitiu o sequenciamento de milhões de bases a baixo custo e em curto espaço de tempo quando comparadas às técnicas de sequenciamento anteriores. Após a conclusão do projeto genoma humano, muitas iniciativas foram tomadas para a realização do sequenciamento de diversas espécies domésticas, gerando grande volume de dados, e redirecionando os estudos genéticos. Esta revisão teve como objetivo descrever o estado atual do sequenciamento das principais espécies de animais domésticos de interesse econômico, bem como de expor as ferramentas mais utilizadas no acesso às informações genômicas. SUMMARY There has been a lot of advance in genomics since 1975 when the possibility to determine the nucleotide seq
RESUMO
The objectives of this study were to standardize a PCR-RFLP genotyping method for the AY_731081:g.1900T>C SNP of the equine CD14 gene, and to characterize this SNP and two other polymorphisms (AY_005808: c.1530A>G of the TLR4 gene and AX_463789: g.133T>C of the Cε gene) in Mangalarga horses, in order to contribute to future studies investigating the association between DNA markers and traits related to immune system physiology in this breed. A total of 151 Mangalarga horses of both sexes and variable ages, representative of the population of São Paulo State, were used. PCR-RFLP was found to be adequate for genotyping of the AY_731081: g.1900T>C SNP of the equine CD14 gene. However, this polymorphism is probably not present in Mangalarga horses, thus impairing association studies using this marker in the breed. The population genetic parameters obtained for the TLR4 AY_005808:c.1530A>G and Cε AX_463789:g.133T>C polymorphisms suggest the use of these markers in association studies with immune system-related traits in Mangalarga horses.
Os objetivos deste trabalho foram a padronização da metodologia PCR-RFLP para genotipagem do SNP AY_731081:g.1900T>C do gene CD14 equino, bem como a caracterização em equinos da raça brasileira Mangalarga deste e de outros dois polimorfismos, o AY_005808: c.1530A>G do TLR4 e o AX_463789: g.133T>C do Cε, a fim de promover o embasamento necessário para futuras pesquisas visando à associação entre marcadores de DNA e características relacionadas à fisiologia do sistema imune na raça. Para tanto, foram utilizados 151 animais Mangalarga, de ambos os sexos e de idades variadas, representativos da população do estado de São Paulo. O método de PCR-RFLP mostrou-se adequado para a genotipagem do SNP AY_731081: g.1900T>C do gene CD14 equino. Entretanto, tal polimorfismo provavelmente não ocorre em equinos Mangalarga, impossibilitando estudos de associação com o marcador na raça. Os parâmetros genético-populacionais obtidos para os polimorfismos AY_005808:c.1530A>G do gene TLR4 e o AX_463789:g.133T>C do gene Cε demonstraram a possibilidade de realização de pesquisas.
Assuntos
Animais , Cavalos/genética , Polimorfismo Genético , Técnicas de Genotipagem/veterinária , Anotação de Sequência Molecular/métodos , Reação em Cadeia da Polimerase/veterináriaRESUMO
The objectives of this study were to standardize a PCR-RFLP genotyping method for the AY_731081:g.1900T>C SNP of the equine CD14 gene, and to characterize this SNP and two other polymorphisms (AY_005808: c.1530A>G of the TLR4 gene and AX_463789: g.133T>C of the Cε gene) in Mangalarga horses, in order to contribute to future studies investigating the association between DNA markers and traits related to immune system physiology in this breed. A total of 151 Mangalarga horses of both sexes and variable ages, representative of the population of São Paulo State, were used. PCR-RFLP was found to be adequate for genotyping of the AY_731081: g.1900T>C SNP of the equine CD14 gene. However, this polymorphism is probably not present in Mangalarga horses, thus impairing association studies using this marker in the breed. The population genetic parameters obtained for the TLR4 AY_005808:c.1530A>G and Cε AX_463789:g.133T>C polymorphisms suggest the use of these markers in association studies with immune system-related traits in Mangalarga horses.(AU)
Os objetivos deste trabalho foram a padronização da metodologia PCR-RFLP para genotipagem do SNP AY_731081:g.1900T>C do gene CD14 equino, bem como a caracterização em equinos da raça brasileira Mangalarga deste e de outros dois polimorfismos, o AY_005808: c.1530A>G do TLR4 e o AX_463789: g.133T>C do Cε, a fim de promover o embasamento necessário para futuras pesquisas visando à associação entre marcadores de DNA e características relacionadas à fisiologia do sistema imune na raça. Para tanto, foram utilizados 151 animais Mangalarga, de ambos os sexos e de idades variadas, representativos da população do estado de São Paulo. O método de PCR-RFLP mostrou-se adequado para a genotipagem do SNP AY_731081: g.1900T>C do gene CD14 equino. Entretanto, tal polimorfismo provavelmente não ocorre em equinos Mangalarga, impossibilitando estudos de associação com o marcador na raça. Os parâmetros genético-populacionais obtidos para os polimorfismos AY_005808:c.1530A>G do gene TLR4 e o AX_463789:g.133T>C do gene Cε demonstraram a possibilidade de realização de pesquisas.(AU)
Assuntos
Animais , Cavalos/genética , Técnicas de Genotipagem/veterinária , Polimorfismo Genético , Anotação de Sequência Molecular/métodos , Reação em Cadeia da Polimerase/veterináriaRESUMO
The Duffy antigen is the only receptor for Plasmodium vivax, a hemoparasite of the phylum Apicomplexa and the cause of vivax malaria in humans. Resistance to this parasite in the majority of black African individuals and their descendents is due to a mutation in the gene promoter region, which blocks its transcription on erythrocytes. Regarding bovine babesiosis, it is known that taurine breeds are more susceptible to parasite infection than zebuine breeds. In order to verify whether the same human resistance occurs in bovine, the 5' flanking region of the DARC gene was isolated and characterized in Bos indicus and Bos taurus. Four single nucleotide polymorphisms were identified and genotyped (SNP1: EF_647729.1:g.91C>T; SNP2: EF_647729.1:g.405C>T; SNP3: EF_647729.1: g.433A>G and SNP4: EF_647729.1:g.588A>G), which showed significant frequency differences among 99 bovines of each species (n=198). Characterization of the isolated region revealed the presence of 6 putative haplotypes, 14 genotypes, which are formed by haplotypes, and numerous putative transcription factor binding sites. Only the thymine presence on SNPs 1 and 2, more common in B. indicus, was observed to alter some of the sites in this region. Despite this fact, analyses through real-time PCR on bovines that present the most common homozygote genotypes of each species, which contrast for all the polymorphism, revealed no difference on the DARC gene transcription. Thus, in principle, it was concluded that the polymorphisms identified would not be useful as molecular markers in an improvement program for resistance to babesiosis.
Assuntos
Bovinos/genética , Bovinos/imunologia , Sistema do Grupo Sanguíneo Duffy/genética , Receptores de Quimiocinas/genética , Região 5'-Flanqueadora , Alelos , Animais , Babesia/imunologia , Babesia/patogenicidade , Babesiose/genética , Babesiose/imunologia , Babesiose/veterinária , Sequência de Bases , Bovinos/sangue , Doenças dos Bovinos/genética , Doenças dos Bovinos/imunologia , Primers do DNA/genética , Frequência do Gene , Haplótipos , Humanos , Dados de Sequência Molecular , Plasmodium vivax/imunologia , Plasmodium vivax/patogenicidade , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Regiões Promotoras Genéticas , Especificidade da Espécie , Transcrição GênicaRESUMO
The objectives of this work were to study the segregation of single nucleotide polymorphisms of the calpain 1, large subunit (CAPN1) and calpastatin (CAST) genes in Nellore (Bos indicus) and Nellore xBos taurus beef cattle, as well as to evaluate their effects on meat traits. For this, 300 animals, including 114 Nellore, 67 Angus x Nellore, 44 Rubia Gallega x Nellore, 41 Canchim, 19 Brangus three-way crosses and 15 Braunvieh three-way crosses, were genotyped for the CAPN4751 [AF_248054.2:g.6545C>T (GenBank accession AF248054.2)] and CAST/DdeI [AF_159246.1:g.2959A>G (GenBank accession AF159246.1)] polymorphisms and phenotyped for Ribeye Area, Backfat Thickness, Intramuscular Fat, Shear Force (SF) and Myofibrillar Fragmentation Index (MFI). In relation to the CAPN4751 polymorphism, a frequency of 10.5% was observed for the C allele in the Nellore breed. In the total sample of studied animals, a significant association was found between genotypes and meat tenderness, assessed by SF (P = 0.005) and MFI (P = 0.008), with genotype CT being more favourable than TT. For the CAST/DdeI polymorphism, a frequency of 55.7% was found for the A allele in the Nellore breed. In the total sample, a significant association was observed between genotypes and meat tenderness - SF (P = 0.004) and MFI (P = 0.006), with genotype AA being more favourable than AG. The relationship between genotypes and aged meat tenderness in confluence with the distribution of favourable alleles shows great potential for application of the CAPN4751 and CAST/DdeI polymorphisms in the genetic improvement of the Nellore breed, whilst contributing to the validation, in this breed and in its crosses with B. taurus, of the association results previously described in the literature.