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1.
Semina ciênc. agrar ; 42(3): 1323-1334, mai.-jun. 2021. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1371305

RESUMO

Studies on genetic composition in fish populations contribute to conservationist practices and inbreeding control in fish stocks. To this end, molecular tools such as microsatellite markers (SSRs) are often used, but they are expensive and time-consuming to develop. A species-specific heterologous marker emerges as an alternative, which can be used in taxonomically related species in a fast way. Our goal was to test SSRs markers of Brachyplatystoma rousseauxi and Pseudoplatystoma punctifer in P. reticulatum in an unprecedented way. For this purpose, DNA was extracted from fragments of the caudal fin of 222 P. reticulatum adults, using a NaCl-based method. Then, DNA samples were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) using six markers, four from B. rousseauxi (BR38, 47, 51, and 61) and two from P. punctifer (PPU13 and PPU15). Two primers showed non-specific amplification and were disregarded (BR38 and PPU13). In the remaining four primers, the number of alleles per locus varied between two (BR47) to sixteen (BR51), and the average size of alleles was between 142 and 400 bp. Mean effective number of alleles per locus ranged from 10,650 (BR51) to 1,784 (BR47), with null or low-frequency alleles in all studied loci. Observed heterozygosity ranged from 0.299 (BR47) to 0.640 (BR51) and was always lower than the expected heterozygosity. Hardy-Weinberg balance was significant (p < 0.05) in all loci, and inbreeding coefficient (FIS) was always positive. Polymorphic Information Content (PIC) confirmed the efficiency of the markers since they had moderate (BR47) to high levels of information (BR51, BR61, and PPU15). Transferability test showed that the heterologous microsatellite molecular markers, originally for B. rousseauxi and P. punctifer, were efficient in P. reticulatum, producing three primers with high information content. Therefore, these markers can be safely used in future population studies of this species.(AU)


Estudos acerca da composição genética de populações de peixes contribuem para a elaboração de práticas conservacionista, bem como para controle da consanguinidade em estoques de piscicultura. Neste sentido, ferramentas moleculares como os marcadores microssatélites (SSR's) são comumente utilizados, contudo, seu desenvolvimento corresponde a um processo caro e demorado. Surge como alternativa a utilização dos marcadores heterólogos, originalmente desenvolvidos para uma espécie, mas que podem ser utilizados de maneira rápida em outras taxonomicamente relacionadas. O objetivo desta pesquisa foi testar de maneira inédita a utilização de marcadores SSR's de Brachyplatystoma rousseauxi e Pseudoplatystoma punctifer em P. reticulatum. Para tanto, foram extraídas amostras de DNA a partir de fragmentos de nadadeira caudal de 222 indivíduos adultos de P. reticulatum por metodologia a base de NaCl. As amostras foram então amplificadas por Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) utilizandose seis marcadores, quatro de B. rousseauxi (BR38, 47, 51 e 61) e dois de P. punctifer (PPU13 e PPU15). Dois primers apresentaram amplificação inespecífica e foram desconsiderados (BR38 e PPU13). Entre os quatro restantes, o número de alelos por locus variou entre dois (BR47) a dezesseis (BR51), com tamanho médio de alelos entre 142 e 400 pb. O número efetivo médio de alelos por locus variou de 10,650 (BR51) à 1,784 (BR47), com alelos nulos ou de baixa frequência presentes em todos os loci estudados. Os valores de heterozigosidade observada variaram de 0,299 (BR47) à 0,640 (BR51), e foram sempre menores que os de heterozigosidade esperada. O Equilíbrio de Hardy-Weinberg foi significativo (P < 0,05) em todos os locus e o coeficiente de endogamia Fis sempre apresentou valores positivos. Os valores de Conteúdo de Informação Polimórfica (PIC) confirmaram a eficiência dos marcadores utilizados, já que possuíram de moderado (BR47) a alto nível de informação (BR51, BR61 e PPU15). O teste de transferibilidade de marcadores moleculares microssatélites heterólogos, originalmente desenvolvidos para B. rousseauxi e P. punctifer em P. reticulatum se mostrou eficiente, produzindo três primers com alto nível de informação, fato que garante sua utilização segura em estudos populacionais futuros voltados à esta espécie.(AU)


Assuntos
Reação em Cadeia da Polimerase , Repetições de Microssatélites , Genética , Peixes-Gato/genética , Endogamia
2.
Semina Ci. agr. ; 40(1): 503-510, Jan.-Feb. 2019. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-19428

RESUMO

In recent years, anthropogenic factors such as pollution, overfishing, and construction of hydroelectric plants have significantly impacted natural fish populations. Research focusing on genetically evaluation of these impacts is necessary to objectively target conservation programs. The aim of this study was to evaluate the genetic diversity of Curimba (Prochilodus lineatus), Pacu (Piaractus mesopotamicus), and Piracanjuba (Brycon orbignyanus) populations from the Água Vermelha Reservoir, Rio Grande-SP. Microsatellite loci were amplified, producing 56, 24, and 26 alleles for the populations of the three species, respectively. The number of alleles per locus ranged from three to ten for P. lineatus, two to five for P. mesopotamicus, and two to four for B. orbignyanus. The observed heterozygosity (Ho) was higher in the P. lineatus population (0.547), relative to the P. mesopotamicus and B. orbignyanus populations (0.473 and 0.527, respectively). The mean values of Ho were lower than the average expected heterozygosity (He) in the three species, being corroborated by the positive inbreeding coefficient (Fis). Deviations from the Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) were found in five, three, and two loci for P. lineatus, P. mesopotamicus, and B. orbignyanus, respectively. Wilcoxon tests revealed recent bottlenecks in the three species, evidenced by a significant excess of heterozygotes (p < 0.05) detected only in the Infinite Allele Model (IAM). In conclusion, adequate genetic variability was observed in the three populations with the presence of heterozygous deficits.(AU)


Nos últimos anos, fatores antrópicos como poluição, sobrepesca e construção de hidrelétricas têm impactado significativamente as populações naturais de peixes. Pesquisas que permitam avaliar geneticamente esse impacto são necessárias para orientar objetivamente programas de conservação. O objetivo do presente estudo foi avaliar a diversidade genética de populações de Curimba (Prochilodus lineatus), Pacu (Piaractus mesopotamicus) e Piracanjuba (Brycon orbignyanus) provenientes do reservatório de Água Vermelha, Rio Grande-SP. Foram amplificados loci microssatélites que produziram 56, 24 e 26 alelos para as populações das três espécies, respectivamente. O número de alelos por locus variou de três a dez para P. lineatus, dois a cinco para P. mesopotamicus e dois a quatro para B. orbignianus. A heterozigosidade observada (Ho) foi mais elevada na população de P. lineatus (0,547) em relação às populações de P. mesopotamicus e B. orbignyanus (0,473 e 0,527, respectivamente). A média dos valores de Ho foram inferiores à média de He nas três espécies sendo corroborado pelo Fis positivo observado. Foi encontrado desvio do equilíbrio de Hardy-Weinberg (HWE) em cinco loci para P. lineatus, três loci para P. mesopotamicus e dois em B. orbignyanus. A análise de bottleneck revelou excesso de heterozigotos (p<0,05) pelo teste de Wilcoxon nas três espécies apenas no modelo Infinite Allele Model (IAM). Foi observada adequada variabilidade genética nas três populações com a presença de déficit de heterozigotos.(AU)


Assuntos
Animais , Caraciformes/genética , Variação Genética , Frequência do Gene , Alelos , Triagem de Portadores Genéticos , Migração Animal , Reação em Cadeia da Polimerase/veterinária , Repetições de Microssatélites
3.
PLoS One ; 14(1): e0210742, 2019.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30645627

RESUMO

The objective of this study was to evaluate the effect of oxidative stress on the instrumental and sensory quality of Nile tilapia fillets. The experiment was conducted in a 2x2 factorial arrangement, evaluating densities (60 and 300 kg m-3) and depuration times (1 and 24 hours) in a total of four treatments. The serum levels of cortisol and gene expression levels of catalase (CAT), glutathione peroxidase (GPx) and 70 kDa heat shock protein (HSP70) as well as the pH, color, tenderness, water-holding capacity and sensory analysis of the fillets were evaluated. High density (300 kg m-3) resulted in higher mean cortisol levels, lower expression of CAT and GPx enzymes as well as higher expression of HSP70. Fish under this treatment also exhibited fillets with greater tenderness, higher lightness, lower redness and lower sensory acceptance. The longer depuration time (24 hours) resulted in lower expression of the CAT and GPx enzymes and fillets with higher lightness. The water-holding capacity was not affected by the different treatments. Therefore, low density and longer depuration times are recommended for decreased stress and improved quality of fillets.


Assuntos
Tilápia/metabolismo , Tilápia/fisiologia , Animais , Catalase/metabolismo , Glutationa Peroxidase/metabolismo , Proteínas de Choque Térmico HSP70/metabolismo , Oxirredução , Estresse Oxidativo
4.
Semina ciênc. agrar ; 40(1): 503-510, 2019. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1501337

RESUMO

In recent years, anthropogenic factors such as pollution, overfishing, and construction of hydroelectric plants have significantly impacted natural fish populations. Research focusing on genetically evaluation of these impacts is necessary to objectively target conservation programs. The aim of this study was to evaluate the genetic diversity of Curimba (Prochilodus lineatus), Pacu (Piaractus mesopotamicus), and Piracanjuba (Brycon orbignyanus) populations from the Água Vermelha Reservoir, Rio Grande-SP. Microsatellite loci were amplified, producing 56, 24, and 26 alleles for the populations of the three species, respectively. The number of alleles per locus ranged from three to ten for P. lineatus, two to five for P. mesopotamicus, and two to four for B. orbignyanus. The observed heterozygosity (Ho) was higher in the P. lineatus population (0.547), relative to the P. mesopotamicus and B. orbignyanus populations (0.473 and 0.527, respectively). The mean values of Ho were lower than the average expected heterozygosity (He) in the three species, being corroborated by the positive inbreeding coefficient (Fis). Deviations from the Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) were found in five, three, and two loci for P. lineatus, P. mesopotamicus, and B. orbignyanus, respectively. Wilcoxon tests revealed recent bottlenecks in the three species, evidenced by a significant excess of heterozygotes (p < 0.05) detected only in the Infinite Allele Model (IAM). In conclusion, adequate genetic variability was observed in the three populations with the presence of heterozygous deficits.


Nos últimos anos, fatores antrópicos como poluição, sobrepesca e construção de hidrelétricas têm impactado significativamente as populações naturais de peixes. Pesquisas que permitam avaliar geneticamente esse impacto são necessárias para orientar objetivamente programas de conservação. O objetivo do presente estudo foi avaliar a diversidade genética de populações de Curimba (Prochilodus lineatus), Pacu (Piaractus mesopotamicus) e Piracanjuba (Brycon orbignyanus) provenientes do reservatório de Água Vermelha, Rio Grande-SP. Foram amplificados loci microssatélites que produziram 56, 24 e 26 alelos para as populações das três espécies, respectivamente. O número de alelos por locus variou de três a dez para P. lineatus, dois a cinco para P. mesopotamicus e dois a quatro para B. orbignianus. A heterozigosidade observada (Ho) foi mais elevada na população de P. lineatus (0,547) em relação às populações de P. mesopotamicus e B. orbignyanus (0,473 e 0,527, respectivamente). A média dos valores de Ho foram inferiores à média de He nas três espécies sendo corroborado pelo Fis positivo observado. Foi encontrado desvio do equilíbrio de Hardy-Weinberg (HWE) em cinco loci para P. lineatus, três loci para P. mesopotamicus e dois em B. orbignyanus. A análise de bottleneck revelou excesso de heterozigotos (p<0,05) pelo teste de Wilcoxon nas três espécies apenas no modelo Infinite Allele Model (IAM). Foi observada adequada variabilidade genética nas três populações com a presença de déficit de heterozigotos.


Assuntos
Animais , Alelos , Caraciformes/genética , Frequência do Gene , Triagem de Portadores Genéticos , Variação Genética , Migração Animal , Reação em Cadeia da Polimerase/veterinária , Repetições de Microssatélites
5.
Sci. agric. ; 75(4): 321-328, jul.-ago. 2018. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-728762

RESUMO

This study evaluated pre-slaughter stress and its influence on the stress indicators, quality characteristics and sensory characteristics of Nile tilapia fillets. To this end, two experiments were conducted: (1) two transportation times (60 and 240 min), with a density of 200 kg m−3, were compared to control treatment fish (in which the fish were removed from the net cage and immediately euthanized); and (2) two transportation densities (100 and 400 kg m−3), transported for 180 min, compared with control treatment fish. In experiment 1, the transportation time of 60 min resulted in higher levels of serum cortisol and plasma glucose compared to the transportation time of 240 min and the control. Fish fillets transported for 240 min had higher water-holding capacity, less water loss by pressure and higher levels of juiciness compared to fish transported for 60 min. Color, pH and water loss during cooking were not affected by transportation time. In experiment 2, transportation densities of 100 and 400 kg m−3 did not significantly affect the stress indicators nor the instrumental quality parameters of the fillets, but fish transported at 400 kg m−3 showed better visual acceptance by panellists.(AU)


Assuntos
Animais , Ciclídeos , Estresse Psicológico , Qualidade dos Alimentos , Abate de Animais , Colorimetria/veterinária
6.
B. Inst. Pesca ; 44(1): 74-79, jan.-mar. 2018. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-736341

RESUMO

The knowledge of appropriate reproductive managements is fundamental for the management and orientation of activities in restocking centers. The aim of the present study was to evaluate the influence of artificial and semi-natural reproductive systems and sex ratios on parental contribution progeny of Prochilodus lineatus. Samples of caudal fins from 25 breeders subjected to the artificial reproductive system and 10 breeders subjected to the semi-natural reproductive system were collected in different sex ratios (1♂:1♀ and 2♂:1♀, and 1♂:1♀, respectively). Two hundred and eight fingerlings from these matings were evaluated. Breeding mortality was recorded shortly after reproductive procedures. For paternity analysis, 10 microsatellite loci were amplified. Three breeders died in the artificial reproductive system (two in the 1:1 ratio and one in the 2:1 ratio). In the 1:1 ratio in the artificial reproductive system, one male (M1.4) had a higher contribution in the progeny formation (41.8%), whereas in the 2:1 ratio, four males contributed from 14.5 to 21.7%. Lower reproductive dominance was identified in the semi-natural reproductive system, with values ranging from 22.86 to 25.71% for four males. In the formation of families, both systems demonstrated a reproductive dominance of some couples. So, the semi-natural reproductive system allowed greater homogeneity in the contribution of progeny without losses due to mortality.(AU)


O conhecimento de manejos apropriados para a reprodução é fundamental para a gestão e direcionamento das atividades em centrais de repovoamento. O objetivo deste estudo foi avaliar a influência dos sistemas reprodutivos por extrusão e seminatural e da proporção de sexo na contribuição parental de progênies de P. lineatus. Amostras de nadadeiras caudais de 25 reprodutores submetidos ao sistema reprodutivo por extrusão e 10 reprodutores submetidos ao sistema reprodutivo seminatural foram coletados em diferentes proporções de sexo (1♂:1♀ e 2♂:1♀, e 1♂:1♀, respectivamente). Duzentos e oito alevinos oriundos desses acasalamentos foram avaliados. A mortalidade dos reprodutores foi registrada logo após os procedimentos reprodutivos. Para a análise de paternidade, foram amplificados 10 loci microssatélites. Três reprodutores foram a óbito no sistema extrusão (dois na proporção 1:1 e um na proporção 2:1). No sistema extrusão 1:1 observou-se que um macho (M1.4) obteve maior contribuição na formação progênie (41,8%), enquanto que na proporção 2:1, quatro machos contribuíram entre 14,5 a 21,7%. A menor dominância reprodutiva foi identificada no sistema seminatural, com valores variando de 22,86% a 25,71% para quatro machos. Na formação das famílias, foi observada dominância reprodutiva de alguns casais em ambos os sistemas. Conclui-se que o sistema seminatural permitiu maior homogeneidade na contribuição na progênie sem perdas por mortalidade.(AU)


Assuntos
Animais , Técnicas Reprodutivas/veterinária , Técnicas Reprodutivas/mortalidade , Cruzamento/métodos , Caraciformes , Tamanho da Ninhada
7.
Bol. Inst. Pesca (Impr.) ; 44(1): 74-79, jan.-mar. 2018. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1465328

RESUMO

The knowledge of appropriate reproductive managements is fundamental for the management and orientation of activities in restocking centers. The aim of the present study was to evaluate the influence of artificial and semi-natural reproductive systems and sex ratios on parental contribution progeny of Prochilodus lineatus. Samples of caudal fins from 25 breeders subjected to the artificial reproductive system and 10 breeders subjected to the semi-natural reproductive system were collected in different sex ratios (1♂:1♀ and 2♂:1♀, and 1♂:1♀, respectively). Two hundred and eight fingerlings from these matings were evaluated. Breeding mortality was recorded shortly after reproductive procedures. For paternity analysis, 10 microsatellite loci were amplified. Three breeders died in the artificial reproductive system (two in the 1:1 ratio and one in the 2:1 ratio). In the 1:1 ratio in the artificial reproductive system, one male (M1.4) had a higher contribution in the progeny formation (41.8%), whereas in the 2:1 ratio, four males contributed from 14.5 to 21.7%. Lower reproductive dominance was identified in the semi-natural reproductive system, with values ranging from 22.86 to 25.71% for four males. In the formation of families, both systems demonstrated a reproductive dominance of some couples. So, the semi-natural reproductive system allowed greater homogeneity in the contribution of progeny without losses due to mortality.


O conhecimento de manejos apropriados para a reprodução é fundamental para a gestão e direcionamento das atividades em centrais de repovoamento. O objetivo deste estudo foi avaliar a influência dos sistemas reprodutivos por extrusão e seminatural e da proporção de sexo na contribuição parental de progênies de P. lineatus. Amostras de nadadeiras caudais de 25 reprodutores submetidos ao sistema reprodutivo por extrusão e 10 reprodutores submetidos ao sistema reprodutivo seminatural foram coletados em diferentes proporções de sexo (1♂:1♀ e 2♂:1♀, e 1♂:1♀, respectivamente). Duzentos e oito alevinos oriundos desses acasalamentos foram avaliados. A mortalidade dos reprodutores foi registrada logo após os procedimentos reprodutivos. Para a análise de paternidade, foram amplificados 10 loci microssatélites. Três reprodutores foram a óbito no sistema extrusão (dois na proporção 1:1 e um na proporção 2:1). No sistema extrusão 1:1 observou-se que um macho (M1.4) obteve maior contribuição na formação progênie (41,8%), enquanto que na proporção 2:1, quatro machos contribuíram entre 14,5 a 21,7%. A menor dominância reprodutiva foi identificada no sistema seminatural, com valores variando de 22,86% a 25,71% para quatro machos. Na formação das famílias, foi observada dominância reprodutiva de alguns casais em ambos os sistemas. Conclui-se que o sistema seminatural permitiu maior homogeneidade na contribuição na progênie sem perdas por mortalidade.


Assuntos
Animais , Caraciformes , Cruzamento/métodos , Técnicas Reprodutivas/mortalidade , Técnicas Reprodutivas/veterinária , Tamanho da Ninhada
8.
Ci. Rural ; 47(12): 1-6, dez. 2017. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-21324

RESUMO

Brycon orbignyanus, popularly known in Brazil as piracanjuba, is a fish with great economic value but whose natural population drastically decreased in number during the last years. In this context, genetic variability studies of natural stocks and in restocking programs are fundamental for the adoption of conservation measures. Current analysis verifies the cross-amplification of heterologous primers in B. orbignyanus. Fifty-two primers of the species Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus were tested. Primers with the best reproducibility were applied to a sample of 20 individuals and the genetic parameters were calculated. Nine primers provided good results for cross-amplification with B. orbignyanus, involving (BoM5 and BoM13) of Brycon opalinus, (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 and Bh16) of Brycon hilarii, (Bc48-10) of Brycon insignis and (Par80) of Prochilodus argenteus. Primers of Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus failed to provide amplification or provided non-specificity. Results demonstrated the possibility of using primers of different species and genera of B. orbignyanus, facilitating genetic studies on the species.(AU)


A piracanjuba (Brycon orbignyanus) é um peixe de grande valor econômico que nos últimos anos tem apresentado uma redução drástica em suas populações naturais. Nesse contexto, estudos de variabilidade genética dos estoques naturais e nos programas de repovoamento são fundamentais para adoção de medidas conservacionistas. O objetivo do presente trabalho foi verificar a amplificação cruzada de primers heterologos em B. orbignyanus. Foram avaliados um total de 52 primers das espécies Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus. Os primers com melhor reprodutibilidade foram aplicados a uma amostra de 20 indivíduos e os parâmetros genéticos foram calculados. Nove primers apresentaram resultados satisfatórios de amplificação cruzada com B. orbignyanus, sendo das espécies Brycon opalinus (BoM5 e BoM13), Brycon hilarii (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 e Bh16), Brycon insignis (Bc48-10) e Prochilodus argenteus (Par80). Os primers de Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus não apresentaram amplificação ou apresentaram inespecificidade. Os resultados revelaram a possibilidade da utilização de primers de diferentes espécies e gênero em B. orbignyanus, o que facilita a realização de estudos genéticos nessa espécie.(AU)


Assuntos
Animais , Peixes , Primers do DNA , Genética
9.
Ciênc. rural (Online) ; 47(12): 1-6, Dec. 2017. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1479829

RESUMO

Brycon orbignyanus, popularly known in Brazil as piracanjuba, is a fish with great economic value but whose natural population drastically decreased in number during the last years. In this context, genetic variability studies of natural stocks and in restocking programs are fundamental for the adoption of conservation measures. Current analysis verifies the cross-amplification of heterologous primers in B. orbignyanus. Fifty-two primers of the species Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus were tested. Primers with the best reproducibility were applied to a sample of 20 individuals and the genetic parameters were calculated. Nine primers provided good results for cross-amplification with B. orbignyanus, involving (BoM5 and BoM13) of Brycon opalinus, (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 and Bh16) of Brycon hilarii, (Bc48-10) of Brycon insignis and (Par80) of Prochilodus argenteus. Primers of Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus failed to provide amplification or provided non-specificity. Results demonstrated the possibility of using primers of different species and genera of B. orbignyanus, facilitating genetic studies on the species.


A piracanjuba (Brycon orbignyanus) é um peixe de grande valor econômico que nos últimos anos tem apresentado uma redução drástica em suas populações naturais. Nesse contexto, estudos de variabilidade genética dos estoques naturais e nos programas de repovoamento são fundamentais para adoção de medidas conservacionistas. O objetivo do presente trabalho foi verificar a amplificação cruzada de primers heterologos em B. orbignyanus. Foram avaliados um total de 52 primers das espécies Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus. Os primers com melhor reprodutibilidade foram aplicados a uma amostra de 20 indivíduos e os parâmetros genéticos foram calculados. Nove primers apresentaram resultados satisfatórios de amplificação cruzada com B. orbignyanus, sendo das espécies Brycon opalinus (BoM5 e BoM13), Brycon hilarii (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 e Bh16), Brycon insignis (Bc48-10) e Prochilodus argenteus (Par80). Os primers de Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus não apresentaram amplificação ou apresentaram inespecificidade. Os resultados revelaram a possibilidade da utilização de primers de diferentes espécies e gênero em B. orbignyanus, o que facilita a realização de estudos genéticos nessa espécie.


Assuntos
Animais , Genética , Peixes , Primers do DNA
10.
Ciênc. rural (Online) ; 47(12): e20170374, Dec. 2017. tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1044935

RESUMO

ABSTRACT: Brycon orbignyanus, popularly known in Brazil as piracanjuba, is a fish with great economic value but whose natural population drastically decreased in number during the last years. In this context, genetic variability studies of natural stocks and in restocking programs are fundamental for the adoption of conservation measures. Current analysis verifies the cross-amplification of heterologous primers in B. orbignyanus. Fifty-two primers of the species Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus were tested. Primers with the best reproducibility were applied to a sample of 20 individuals and the genetic parameters were calculated. Nine primers provided good results for cross-amplification with B. orbignyanus, involving (BoM5 and BoM13) of Brycon opalinus, (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 and Bh16) of Brycon hilarii, (Bc48-10) of Brycon insignis and (Par80) of Prochilodus argenteus. Primers of Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus failed to provide amplification or provided non-specificity. Results demonstrated the possibility of using primers of different species and genera of B. orbignyanus, facilitating genetic studies on the species.


RESUMO: A piracanjuba (Brycon orbignyanus) é um peixe de grande valor econômico que nos últimos anos tem apresentado uma redução drástica em suas populações naturais. Nesse contexto, estudos de variabilidade genética dos estoques naturais e nos programas de repovoamento são fundamentais para adoção de medidas conservacionistas. O objetivo do presente trabalho foi verificar a amplificação cruzada de primers heterologos em B. orbignyanus. Foram avaliados um total de 52 primers das espécies Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus. Os primers com melhor reprodutibilidade foram aplicados a uma amostra de 20 indivíduos e os parâmetros genéticos foram calculados. Nove primers apresentaram resultados satisfatórios de amplificação cruzada com B. orbignyanus, sendo das espécies Brycon opalinus (BoM5 e BoM13), Brycon hilarii (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 e Bh16), Brycon insignis (Bc48-10) e Prochilodus argenteus (Par80). Os primers de Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus não apresentaram amplificação ou apresentaram inespecificidade. Os resultados revelaram a possibilidade da utilização de primers de diferentes espécies e gênero em B. orbignyanus, o que facilita a realização de estudos genéticos nessa espécie.

11.
Food Sci. Technol (SBCTA, Impr.) ; Food Sci. Technol (SBCTA, Impr.);37(1): 52-58, Jan.-Mar. 2017. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-892195

RESUMO

Abstract The study was carried out with the objective of evaluating the influence of pre-slaughter stress on meat quality of Nile tilapia (O. niloticus) for 10 days of storage in ice. 75 whole fish were used eviscerated, with average weight and length of 825.75 ± 101.59 g and 28.25 ± 0.81 cm, respectively. The treatments consisted of time in which the animals underwent pre-slaughter hypoxia, being 0, 3 and 6 minutes. Rigor mortis and muscle pH were assessed besides the application of the Quality Index Method and analysis of total protein and blood glucose. Rigor mortis did not differ among treatments during the storage period, and after three hours all animals were in rigor stage. The muscle pH values varied widely during the study period, observing higher values on the third day of storage. Sensory analysis showed that after 10 days the tilapia from the different treatments did not differ in the evaluated quality parameters similarly, there was no difference regarding the evaluated blood biochemical parameters Thus, hypoxia of 6 minutes pre-slaughter does not influence the rigor mortis, muscle pH, qualitative perception of the meat quality, total protein and blood glucose of Nile tilapia.

12.
Theriogenology ; 88: 254-263.e3, 2017 Jan 15.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-27814913

RESUMO

This study evaluated the reproductive parameters and genetic variability of offspring of Rhamdia quelen from mating by natural spawning and by controlled fertilization with fresh and cryopreserved semen. After hormonal manipulation, three R quelen pairs were used for natural spawning in high-flow tanks, three pairs were used for mating with fresh semen, and another three pairs were used with cryopreserved semen. Matings were performed in triplicate. For matings with fresh and cryopreserved semen, semen from each male was used to individually fertilize oocytes from each female. Pools of semen and oocytes were made, and aliquots of these gametes were taken for fertilization. No differences (P > 0.05) were detected for absolute or relative fecundity, fertilization rate, or egg hatching rate. The use of fresh semen led to a higher (P < 0.01) percentage of normal larvae. The use of fresh semen in pooled mating resulted in a greater effective number of alleles and a higher expected heterozygosity. Offspring from natural spawning presented higher observed heterozygosity and a lower inbreeding coefficient. The highest inbreeding coefficient was found in offspring from individual matings using fresh semen. Regarding paternal contributions, a single male dominated in matings with fresh semen, whereas two males dominated in natural spawning and matings using cryopreserved semen. The use of gamete pools for mating and natural spawning resulted in higher genetic variability of offspring, and mating using cryopreserved semen found no effects on genetic variability of offspring but did reduce the percentage of normal larvae. Other reproductive parameters were not influenced by spawning strategies.


Assuntos
Peixes-Gato/fisiologia , Criopreservação/veterinária , Variação Genética , Reprodução/fisiologia , Preservação do Sêmen/veterinária , Animais , Peixes-Gato/genética , Feminino , Masculino
13.
Semina Ci. agr. ; 37(4, supl.1): 2427-2436, jul.-ago. 2016. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-29235

RESUMO

Most of the electricity used in Brazil comes from hydroelectric plants, mainly due to the great availability of its water resources. However, the construction of these plants denotes serious problems related to migration of native fish and the genetic conservation of stocks. Current study evaluates two wild population of Leporinus elongatus (piapara) located downstream (Population A - PopA) and upstream (Population B - PopB) of the Cachoeira Branca before the construction of the São Domingos hydroelectric plant (HPP) in the Mato Grosso do Sul State, Brazil. Thirty samples from caudal fins were collected and analyzed for each population. Eighty-nine fragments, including 72 polymorphic ones (80.9%), were analyzed. Low fragments (less than 0.100) in both populations (PopA = 2 and PopB = 3) were identified. Nine fixed fragments (frequency 1.000) (PopA = 3 and PopB = 6), and four exclusive fragments (PopA = 3 and PopB = 1) were also reported. The genetic variability within populations, calculated by Shannon Index and by percentage of polymorphic fragments, indicated high rates of intrapopulation variability (PopA = 0.309 and 61.80% and PopB = 0.392 and 71.90%, respectively). Genetic distance and identity rates (0.089 and 0.915, respectively) were different between populations, whilst AMOVA showed that most variations lie within the populations and not between them. Fst and Nm rates...(AU)


A maior parte da energia elétrica utilizada no Brasil provém de usinas hidrelétricas, devido principalmente à grande disponibilidade de recursos hídricos. Contudo, a construção dessas usinas pode representar graves problemas relacionados com a migração de peixes nativos e com a conservação genética dessas populações. O objetivo do presente trabalho foi avaliar duas populações naturais de Piapara (Leporinus elongatus) localizadas à jusante (População A - PopA) e montante (População B - PopB) da Cachoeira Branca no período anterior à construção da usina hidrelétrica (UHE) São Domingos, Mato Grosso do Sul - Brasil. Trinta amostras de nadadeira caudal foram coletadas e analisadas para cada população. No total, foram observados 89 fragmentos dos quais 72 foram polimórficos (80,9%). Foram identificados fragmentos de baixa frequência (menor que 0,100) em ambas as populações (PopA = 2 e PopB = 3). Nove fragmentos fixados (frequência de 1,000) (PopA = 6 e PopB = 3) e quatro fragmentos exclusivos (PopA = 3 e PopB = 1) também foram observados. A variabilidade genética dentro das populações, calculada através do índice de Shannon e pela porcentagem de fragmentos polimórficos mostrou altos valores de variabilidade intra-populacional (PopA= 0,309 e 61,80% e PopB = 0,392 e 71,90%, respectivamente). Os valores de distância e a identidade genética (0,089 e 0,915, respectivamente) mostraram dife...(AU)


Assuntos
Animais , Peixes/genética , Variação Genética , Centrais Hidrelétricas/análise
14.
Semina ciênc. agrar ; 37(4, supl.1): 2427-2436, jul.-ago. 2016. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1500494

RESUMO

Most of the electricity used in Brazil comes from hydroelectric plants, mainly due to the great availability of its water resources. However, the construction of these plants denotes serious problems related to migration of native fish and the genetic conservation of stocks. Current study evaluates two wild population of Leporinus elongatus (piapara) located downstream (Population A - PopA) and upstream (Population B - PopB) of the Cachoeira Branca before the construction of the São Domingos hydroelectric plant (HPP) in the Mato Grosso do Sul State, Brazil. Thirty samples from caudal fins were collected and analyzed for each population. Eighty-nine fragments, including 72 polymorphic ones (80.9%), were analyzed. Low fragments (less than 0.100) in both populations (PopA = 2 and PopB = 3) were identified. Nine fixed fragments (frequency 1.000) (PopA = 3 and PopB = 6), and four exclusive fragments (PopA = 3 and PopB = 1) were also reported. The genetic variability within populations, calculated by Shannon Index and by percentage of polymorphic fragments, indicated high rates of intrapopulation variability (PopA = 0.309 and 61.80% and PopB = 0.392 and 71.90%, respectively). Genetic distance and identity rates (0.089 and 0.915, respectively) were different between populations, whilst AMOVA showed that most variations lie within the populations and not between them. Fst and Nm rates...


A maior parte da energia elétrica utilizada no Brasil provém de usinas hidrelétricas, devido principalmente à grande disponibilidade de recursos hídricos. Contudo, a construção dessas usinas pode representar graves problemas relacionados com a migração de peixes nativos e com a conservação genética dessas populações. O objetivo do presente trabalho foi avaliar duas populações naturais de Piapara (Leporinus elongatus) localizadas à jusante (População A - PopA) e montante (População B - PopB) da Cachoeira Branca no período anterior à construção da usina hidrelétrica (UHE) São Domingos, Mato Grosso do Sul - Brasil. Trinta amostras de nadadeira caudal foram coletadas e analisadas para cada população. No total, foram observados 89 fragmentos dos quais 72 foram polimórficos (80,9%). Foram identificados fragmentos de baixa frequência (menor que 0,100) em ambas as populações (PopA = 2 e PopB = 3). Nove fragmentos fixados (frequência de 1,000) (PopA = 6 e PopB = 3) e quatro fragmentos exclusivos (PopA = 3 e PopB = 1) também foram observados. A variabilidade genética dentro das populações, calculada através do índice de Shannon e pela porcentagem de fragmentos polimórficos mostrou altos valores de variabilidade intra-populacional (PopA= 0,309 e 61,80% e PopB = 0,392 e 71,90%, respectivamente). Os valores de distância e a identidade genética (0,089 e 0,915, respectivamente) mostraram dife...


Assuntos
Animais , Centrais Hidrelétricas/análise , Peixes/genética , Variação Genética
15.
Semina Ci. agr. ; 37(1): 507-516, jan.-fev. 2016. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-23169

RESUMO

Although hydroelectric power plants generate most electricity in Brazil, the dams provide environmental barriers which also include the interruption of fish migration. Current study, conducted prior to the construction of São Domingos HPP on the shaft of the Cachoeira Branca (waterfall) on the Verde river, state of Mato Grosso do Sul, Brazil, evaluated the genetic diversity of two natural populations of dourado (Salminus brasiliensis) located downstream (Population A - PopA) and upstream (Population B - PopB) the waterfall. Eight primers were employed to analyze 56 specimens (PopA: 26; PopB: 30) and observed in 102 fragments, of which 86 were polymorphic (84.3%). Low frequency fragments (PopA: 2; PopB: 1), three limiting fragments (PopA) and three exclusive fragments (PopB) were identified. The intra-population genetic variability calculated the Shannon index, whilst the percentage of polymorphic fragments showed high rate variability within each population (PopA: 0.300 and 60.80% and PopB: 0.411 and 79.40%, respectively). The distance and genetic identity revealed high genetic differentiation (0.076 and 0.927, respectively). Results reveal that populations have high intra-population genetic variability and genetic differentiation between them, with low gene flow.(AU)


As usinas hidrelétricas são responsáveis por gerar a maioria da energia elétrica utilizada no Brasil, entretanto, suas construções podem gerar entraves ambientais, entre eles a interrupção da migração de peixes. O presente estudo foi realizado no período anterior a construção da UHE São Domingos sobre o eixo da cachoeira Branca, no rio Verde Mato Grosso do Sul (Brazil), e teve como objetivo avaliar a diversidade genética de duas populações naturais de dourado (Salminus brasiliensis) localizadas à jusante (População A - PopA) e montante (População B - PopB) da cachoeira. Foram utilizados oito iniciadores para analisar 56 indivíduos (PopA: 26; PopB: 30). Observaram-se um total de 102 fragmentos, dos quais 86 foram polimórficos (84,3%). Foram identificados fragmentos de baixa frequência (PopA: 2;  PopB: 1), três fragmentos limitantes (PopA) e três fragmentos exclusivos (PopB). A variabilidade genética intra-populacional calculada com o índice de Shannon e pela porcentagem de fragmentos polimórficos mostrou altos valores de variabilidade dentro de cada população (PopA: 0,300 e 60,80% e PopB: 0,411 e 79,40%, respectivamente). A distância e identidade genética mostraram uma alta diferenciação genética (0,076 e 0,927, respectivamente). As duas populações apresentaram alta variabilidade genética intra-populacional e alta diferenciação e distância genética entre si, com baixo fluxo gênico.(AU)


Assuntos
Animais , Caraciformes/genética , Genética Populacional , Variação Biológica da População/genética
16.
Semina Ci. agr. ; 37(1): 517-524, jan.-fev. 2016. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-23112

RESUMO

Native fish species in Brazil are an asset in fish farming, but their natural stocks have been significantly reduced in recent years. To mitigate this negative impact, studies on fish conservation are being conducted and genetic tools for the discrimination of population parameters are increasingly achieving great importance. Current analysis evaluates a set of microsatellite heterologous primers in the jundiá (Rhamdia quelen) and in the piapara (Leporinus elongatus). Samples from the caudal fin of 15 broodstock from each species were analyzed. DNA extraction was performed with NaCl protocol and the integrity of the extracted DNA was checked with agarose gel 1%. Twenty primers developed for Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum, Prochilodus lineatus, Brycon opalinus and Oreochromis niloticus were evaluated. Cross amplification of four primers of the B. opalinus and P. lineatus species (BoM12, Pli43 and Pli60 in R. quelen and BoM2, Pli43 and Pli60 in L. elongatus) was assessed. Primers of P. mesopotamicus, C. macropomum and O. niloticus showed no cross amplification in the two species analyzed. Results revealed the possibility of using the four amplified heterologous primers in genetic studies for R. quelen and L. elongatus.(AU)


As espécies nativas de peixes no Brasil tem alto potencial para utilização dentro da piscicultura, porém, seus estoques naturais vêm sofrendo redução nos últimos anos. Para diminuir esse impacto negativo, estudos voltados à conservação estão sendo realizados e cada vez mais, a obtenção de ferramentas genéticas que permitam a discriminação de parâmetros populacionais toma maior importância. Objetivou-se através do presente estudo avaliar um conjunto de primers microssatélites heterólogos em jundiá (Rhamdia quelen) e piapara (Leporinus elongatus). Foram analisadas amostras de nadadeira caudal de 15 reprodutores de cada espécie. A extração de DNA foi realizada utilizando o protocolo com NaCl. A integridade do DNA extraído foi checada em gel de agarose 1%. Foram avaliados 20 primers desenvolvidos para as espécies: Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum, Prochilodus lineatus, Brycon opalinus e Oreochromis niloticus. Foi observada amplificação cruzada de quatro primers das espécies B. opalinus e P. lineatus (BoM12, Pli43 e Pli60 em R. quelen e BoM2, Pli43 e Pli60 em L. elongatus). Os primers de P. mesopotamicus, C. macropomum e O. niloticus não mostraram amplificação cruzada nas duas espécies analisadas. Os resultados indicaram a possibilidade de uso dos três primers heterólogos amplificados em estudos genéticos em R. quelen e L. elongatus.(AU)


Assuntos
Animais , Pesqueiros , Caraciformes/genética , Peixes-Gato/genética , Primers do DNA/análise , Genética Populacional
17.
Semina ciênc. agrar ; 37(1): 517-524, 2016. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1500276

RESUMO

Native fish species in Brazil are an asset in fish farming, but their natural stocks have been significantly reduced in recent years. To mitigate this negative impact, studies on fish conservation are being conducted and genetic tools for the discrimination of population parameters are increasingly achieving great importance. Current analysis evaluates a set of microsatellite heterologous primers in the jundiá (Rhamdia quelen) and in the piapara (Leporinus elongatus). Samples from the caudal fin of 15 broodstock from each species were analyzed. DNA extraction was performed with NaCl protocol and the integrity of the extracted DNA was checked with agarose gel 1%. Twenty primers developed for Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum, Prochilodus lineatus, Brycon opalinus and Oreochromis niloticus were evaluated. Cross amplification of four primers of the B. opalinus and P. lineatus species (BoM12, Pli43 and Pli60 in R. quelen and BoM2, Pli43 and Pli60 in L. elongatus) was assessed. Primers of P. mesopotamicus, C. macropomum and O. niloticus showed no cross amplification in the two species analyzed. Results revealed the possibility of using the four amplified heterologous primers in genetic studies for R. quelen and L. elongatus.


As espécies nativas de peixes no Brasil tem alto potencial para utilização dentro da piscicultura, porém, seus estoques naturais vêm sofrendo redução nos últimos anos. Para diminuir esse impacto negativo, estudos voltados à conservação estão sendo realizados e cada vez mais, a obtenção de ferramentas genéticas que permitam a discriminação de parâmetros populacionais toma maior importância. Objetivou-se através do presente estudo avaliar um conjunto de primers microssatélites heterólogos em jundiá (Rhamdia quelen) e piapara (Leporinus elongatus). Foram analisadas amostras de nadadeira caudal de 15 reprodutores de cada espécie. A extração de DNA foi realizada utilizando o protocolo com NaCl. A integridade do DNA extraído foi checada em gel de agarose 1%. Foram avaliados 20 primers desenvolvidos para as espécies: Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum, Prochilodus lineatus, Brycon opalinus e Oreochromis niloticus. Foi observada amplificação cruzada de quatro primers das espécies B. opalinus e P. lineatus (BoM12, Pli43 e Pli60 em R. quelen e BoM2, Pli43 e Pli60 em L. elongatus). Os primers de P. mesopotamicus, C. macropomum e O. niloticus não mostraram amplificação cruzada nas duas espécies analisadas. Os resultados indicaram a possibilidade de uso dos três primers heterólogos amplificados em estudos genéticos em R. quelen e L. elongatus.


Assuntos
Animais , Caraciformes/genética , Genética Populacional , Peixes-Gato/genética , Pesqueiros , Primers do DNA/análise
18.
Semina ciênc. agrar ; 37(1): 507-516, 2016. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1500287

RESUMO

Although hydroelectric power plants generate most electricity in Brazil, the dams provide environmental barriers which also include the interruption of fish migration. Current study, conducted prior to the construction of São Domingos HPP on the shaft of the Cachoeira Branca (waterfall) on the Verde river, state of Mato Grosso do Sul, Brazil, evaluated the genetic diversity of two natural populations of dourado (Salminus brasiliensis) located downstream (Population A - PopA) and upstream (Population B - PopB) the waterfall. Eight primers were employed to analyze 56 specimens (PopA: 26; PopB: 30) and observed in 102 fragments, of which 86 were polymorphic (84.3%). Low frequency fragments (PopA: 2; PopB: 1), three limiting fragments (PopA) and three exclusive fragments (PopB) were identified. The intra-population genetic variability calculated the Shannon index, whilst the percentage of polymorphic fragments showed high rate variability within each population (PopA: 0.300 and 60.80% and PopB: 0.411 and 79.40%, respectively). The distance and genetic identity revealed high genetic differentiation (0.076 and 0.927, respectively). Results reveal that populations have high intra-population genetic variability and genetic differentiation between them, with low gene flow.


As usinas hidrelétricas são responsáveis por gerar a maioria da energia elétrica utilizada no Brasil, entretanto, suas construções podem gerar entraves ambientais, entre eles a interrupção da migração de peixes. O presente estudo foi realizado no período anterior a construção da UHE São Domingos sobre o eixo da cachoeira Branca, no rio Verde Mato Grosso do Sul (Brazil), e teve como objetivo avaliar a diversidade genética de duas populações naturais de dourado (Salminus brasiliensis) localizadas à jusante (População A - PopA) e montante (População B - PopB) da cachoeira. Foram utilizados oito iniciadores para analisar 56 indivíduos (PopA: 26; PopB: 30). Observaram-se um total de 102 fragmentos, dos quais 86 foram polimórficos (84,3%). Foram identificados fragmentos de baixa frequência (PopA: 2;  PopB: 1), três fragmentos limitantes (PopA) e três fragmentos exclusivos (PopB). A variabilidade genética intra-populacional calculada com o índice de Shannon e pela porcentagem de fragmentos polimórficos mostrou altos valores de variabilidade dentro de cada população (PopA: 0,300 e 60,80% e PopB: 0,411 e 79,40%, respectivamente). A distância e identidade genética mostraram uma alta diferenciação genética (0,076 e 0,927, respectivamente). As duas populações apresentaram alta variabilidade genética intra-populacional e alta diferenciação e distância genética entre si, com baixo fluxo gênico.


Assuntos
Animais , Caraciformes/genética , Genética Populacional , Variação Biológica da População/genética
19.
Semina Ci. agr. ; 36(6): 3807-3826, nov.-dez. 2015. mapas, tab, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-30380

RESUMO

Piaractus mesopotamicus is a tropical fish under threat because of declines in the number of wild populations. Restocking programs have been developed as a conservation method, and the genetic monitoring of populations and broodstocks is important to ensure the viability of such programs. The objective of the current, unprecedented experiment was to evaluate the genetic diversity of P. mesopotamicus wild populations (WPs) and broodstocks (BSs) using microsatellites markers for supplying the restocking programs in the Tietê and Grande rivers. Six microsatellite loci were amplified using the DNA obtained from the caudal fin of 279 adult fish. The observed intrapopulation genetic variability was high with mean heterozygosity ranging from 0.203 to 0.833. The number of alleles per locus ranged from three (loci Pme28 and Pme32) to thirteen (loci Pme4, Pme5 and Pme14), and there were allele differences between WPsxWPs and WPsxBSs. This differentiation was confirmed by the dendrogram analysis that showed three specific clusters. Four alleles were shared in the WPs2012xBSs. Positive FIS values indicated the presence of endogamy in seven out of ten samples obtained from the WPs. The AMOVA analysis and FST values indicated moderate and high genetic differences in WPsxWPs and high genetic differences in WPsxBSs. The genetic distance and genetic identity values and number of migrants...(AU)


Piaractus mesopotamicus é um peixe tropical que nos últimos anos tem apresentado uma diminuição no número de populações naturais. Programas de repovoamento vêm sendo utilizados como método de conservação, entretanto, o monitoramento genético das populações e dos estoques de reprodutores é importante para conferir a viabilidade desse tipo de programas. O objetivo do presente estudo foi avaliar de forma inédita a diversidade genética de populações selvagens (WPs) e estoques de reprodutores (BSs) de P. mesopotamicus utilizados em programas de repovoamento dos rios Tietê e Grande, através de marcadores microssatélite. Seis loci microssatélite foram amplificados usando DNA extraído de nadadeira caudal de 279 indivíduos adultos. Foi observada alta variabilidade genética intra-populacional, com medias de heterozigosidade observada entre 0.203 e 0.833. O número de alelos por locus foi de três (locus Pme28 e Pme32) a 13 (locus Pme4, Pme5 e Pme14) e houve diferenciação de alelos entre WPsxWPs e WPsxBSs. Essa diferenciação foi confirmada pela análise do dendrograma que mostrou a formação de três agrupamentos específicos. Observaram-se quatro alelos compartilhados entre WPs2012xBSs. Valores positivos de FIS mostraram a presença de endogamia em sete das 10 coletas realizadas nas WPs. A análise de AMOVA e do FST indicou moderada e muito alta diferenciação genética entre WPsxWPs...(AU)


Assuntos
Animais , Variação Genética , Peixes/genética , Rios , Biodiversidade , Repetições de Microssatélites
20.
Semina ciênc. agrar ; 36(6): 3807-3826, 2015. map, tab, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1500154

RESUMO

Piaractus mesopotamicus is a tropical fish under threat because of declines in the number of wild populations. Restocking programs have been developed as a conservation method, and the genetic monitoring of populations and broodstocks is important to ensure the viability of such programs. The objective of the current, unprecedented experiment was to evaluate the genetic diversity of P. mesopotamicus wild populations (WPs) and broodstocks (BSs) using microsatellites markers for supplying the restocking programs in the Tietê and Grande rivers. Six microsatellite loci were amplified using the DNA obtained from the caudal fin of 279 adult fish. The observed intrapopulation genetic variability was high with mean heterozygosity ranging from 0.203 to 0.833. The number of alleles per locus ranged from three (loci Pme28 and Pme32) to thirteen (loci Pme4, Pme5 and Pme14), and there were allele differences between WPsxWPs and WPsxBSs. This differentiation was confirmed by the dendrogram analysis that showed three specific clusters. Four alleles were shared in the WPs2012xBSs. Positive FIS values indicated the presence of endogamy in seven out of ten samples obtained from the WPs. The AMOVA analysis and FST values indicated moderate and high genetic differences in WPsxWPs and high genetic differences in WPsxBSs. The genetic distance and genetic identity values and number of migrants...


Piaractus mesopotamicus é um peixe tropical que nos últimos anos tem apresentado uma diminuição no número de populações naturais. Programas de repovoamento vêm sendo utilizados como método de conservação, entretanto, o monitoramento genético das populações e dos estoques de reprodutores é importante para conferir a viabilidade desse tipo de programas. O objetivo do presente estudo foi avaliar de forma inédita a diversidade genética de populações selvagens (WPs) e estoques de reprodutores (BSs) de P. mesopotamicus utilizados em programas de repovoamento dos rios Tietê e Grande, através de marcadores microssatélite. Seis loci microssatélite foram amplificados usando DNA extraído de nadadeira caudal de 279 indivíduos adultos. Foi observada alta variabilidade genética intra-populacional, com medias de heterozigosidade observada entre 0.203 e 0.833. O número de alelos por locus foi de três (locus Pme28 e Pme32) a 13 (locus Pme4, Pme5 e Pme14) e houve diferenciação de alelos entre WPsxWPs e WPsxBSs. Essa diferenciação foi confirmada pela análise do dendrograma que mostrou a formação de três agrupamentos específicos. Observaram-se quatro alelos compartilhados entre WPs2012xBSs. Valores positivos de FIS mostraram a presença de endogamia em sete das 10 coletas realizadas nas WPs. A análise de AMOVA e do FST indicou moderada e muito alta diferenciação genética entre WPsxWPs...


Assuntos
Animais , Biodiversidade , Peixes/genética , Repetições de Microssatélites , Rios , Variação Genética
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