RESUMO
Characterized by the incomplete development of the germinal epithelium of the seminiferous tubules, Testicular hypoplasia (TH) leads to decreased sperm concentration, increased morphological changes in sperm and azoospermia. Economic losses resulting from the disposal of affected bulls reduce the efficiency of meat production systems. A genome-wide association study and functional analysis were performed to identify genomic windows and the underlying positional candidate genes associated with TH in Nellore cattle. Phenotypic and pedigree data from 207,195 animals and genotypes (461,057 single nucleotide polymorphism, SNP) from 17,326 sires were used in this study. TH was evaluated as a binary trait measured at 18 months of age. A possible correlated response on TH resulting from the selection for scrotal circumference was evaluated by using a two-trait analysis. Thus, estimated breeding values were calculated by fitting a linear-threshold animal model in a Bayesian approach. The SNP effects were estimated using the weighted single-step genomic BLUP method. Twelve non-overlapping windows of 20 adjacent SNP that explained more than 1% of the additive genetic variance were selected for candidate gene annotation. Functional and gene prioritization analysis of the candidate genes identified genes (KHDRBS3, GPX5, STAR, ERLIN2), which might play an important role in the expression of TH due to their known roles in the spermatogenesis process, synthesis of steroids and lipid metabolism.
Assuntos
Estudo de Associação Genômica Ampla , Sêmen , Bovinos/genética , Masculino , Animais , Estudo de Associação Genômica Ampla/veterinária , Teorema de Bayes , Sêmen/fisiologia , Espermatozoides , Genótipo , Fenótipo , Polimorfismo de Nucleotídeo ÚnicoRESUMO
The aim of this study was to identify differentially expressed genes (DEG) in the Longissimus thoracis muscle of Nelore cattle related to fatty acid (FA) profile through RNA sequencing and principal component analysis (PCA). Two groups of 10 animals each were selected containing PC1 and PC2 extreme DEG values (HIGH × LOW) for each FA group. The intramuscular fat (IMF) was compared between cluster groups by ANOVA, and only the sum of monounsaturated FA (MUFA) and ω3 showed significant differences (p < .05). Interestingly, the highest percentage (95%) of phenotypic variation explained by the sum of the first two PC was observed for ω3, which also displayed the lowest number of DEG (n = 1). The lowest percentage (59%) was observed for MUFA, which also revealed the largest number of DEG (n = 66). Since only MUFA and ω3 exhibited significant differences between cluster groups, we can conclude that the differences observed for the remaining groups are not due to the percentage of IMF. Several genes that have been previously associated with meat quality and FA traits were identified as DEG in this study. The functional analysis revealed one KEGG pathway and eight GO terms as significant (p < .05), in which we highlighted the purine metabolism, glycolytic process, adenosine triphosphate binding and bone development. These results strongly contribute to the knowledge of the biological mechanisms involved in meat FA profile of Nelore cattle.
Assuntos
Músculo Esquelético , Carne Vermelha , Animais , Bovinos , Ácidos Graxos , Fenótipo , RNA-Seq/veterináriaRESUMO
Anti-Müllerian Hormone (AMH) is a protein expressed in the gonads and related to ovarian follicular development. The aim of this study was to investigate the presence of polymorphisms in the AMH gene in a Nelore herd to analyze the genetic constitution of this population and to perform association studies with early pregnancy occurrence (EPO) and age at first calving (AFC). Phenotypic data consisted of verification of early pregnancy and age at first calving of 197 unrelated heifers exposed to the mating season and aged between 15 and 17 months (precocious group) and 24 months (non-precocious group). The precocious group consisted of 67 heifers with age at first calving of 26.5 ± 0.59 months, and the non-precocious group was composed of 130 heifers with age at first calving of 36.4 ± 0.99 months. All five exons of the AMH gene were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) and sequenced. A total of three SNPs were identified in this study, all of them located in exon 5 (rs527023314, rs722016629, and rs134387246), the latter one positioned in the stop codon. All three SNPs identified in exon 5 characterized synonymous mutations. Only SNP rs134387246 exhibited a significant value (P ≤ 0.10) for EPO and AFC. The association study of SNP rs134387246 revealed an over-dominance effect (P = 0.056), and no additive effect was observed (P = 0.67). A reduction of 2.5 months (75 days) in the age at first calving of heterozygous heifers for the SNP rs134387246 was observed. For the first time, polymorphisms of the AMH gene were described in Nelore heifers and associated with sexual precocity traits.(AU)
O hormônio Anti-Mülleriano (AMH) é uma proteína expressa nas gônadas e está relacionada ao desenvolvimento folicular ovariano. O objetivo desse trabalho foi investigar a presença de polimorfismos do gene AMH em um rebanho Nelore, analisar a constituição genética da população para o gene e estudar a associação entre os polimorfismos e as características ocorrência de prenhez precoce (OPP) e idade ao primeiro parto (IPP). Os dados fenotípicos consistiram da verificação da prenhez precoce e idade ao primeiro parto de 197 novilhas, não aparentadas, expostas à estação de monta com idade entre 15 e 17 meses (grupo precoce) ou 24 meses (grupo não precoce). O grupo denominado precoce foi composto por 67 novilhas com idade ao primeiro parto de 26.5±0.59 meses, e o segundo denominado não precoce composto por 130 novilhas com idade ao primeiro parto de 36.4±0.99 meses. Os cinco éxons do gene AMH foram amplificados por meio da técnica de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) e sequenciados. Um total de três SNPs foram identificados nesse estudo, todos localizados no éxon 5 (rs527023314, rs722016629 and rs134387246), sendo o último posicionado stop codon. Os três SNPs identificados caracterizaram mutações sinônimas. Somente o SNP rs134387246 exibiu associação significante (P ≤ 0.10) para ambas características (OPP e IPP). O estudo de associação do SNP rs134387246 revelou um efeito de sobre dominância (P=0,056), e ausência de ação gênica aditiva (P=0,67). Foi observada redução de 2,5 meses (75 dias) na idade ao primeiro parto de novilhas heterozigotas para o SNP rs134387246. Pela primeira vez na literatura, polimorfismos do gene AMH foram descritos em novilhas da raça Nelore e associados a características indicadoras de precocidade sexual.(AU)
Assuntos
Animais , Feminino , Adulto Jovem , Bovinos , Hormônio Antimülleriano/genética , Hormônio Antimülleriano/análise , Polimorfismo Genético , Prenhez/genética , Parto , Reprodução/genética , Reação em Cadeia da Polimerase/veterinária , Reação em Cadeia da Polimerase/métodosRESUMO
Anti-Müllerian Hormone (AMH) is a protein expressed in the gonads and related to ovarian follicular development. The aim of this study was to investigate the presence of polymorphisms in the AMH gene in a Nelore herd to analyze the genetic constitution of this population and to perform association studies with early pregnancy occurrence (EPO) and age at first calving (AFC). Phenotypic data consisted of verification of early pregnancy and age at first calving of 197 unrelated heifers exposed to the mating season and aged between 15 and 17 months (precocious group) and 24 months (non-precocious group). The precocious group consisted of 67 heifers with age at first calving of 26.5 ± 0.59 months, and the non-precocious group was composed of 130 heifers with age at first calving of 36.4 ± 0.99 months. All five exons of the AMH gene were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) and sequenced. A total of three SNPs were identified in this study, all of them located in exon 5 (rs527023314, rs722016629, and rs134387246), the latter one positioned in the stop codon. All three SNPs identified in exon 5 characterized synonymous mutations. Only SNP rs134387246 exhibited a significant value (P ≤ 0.10) for EPO and AFC. The association study of SNP rs134387246 revealed an over-dominance effect (P = 0.056), and no additive effect was observed (P = 0.67). A reduction of 2.5 months (75 days) in the age at first calving of heterozygous heifers for the SNP rs134387246 was observed. For the first time, polymorphisms of the AMH gene were described in Nelore heifers and associated with sexual precocity traits.
O hormônio Anti-Mülleriano (AMH) é uma proteína expressa nas gônadas e está relacionada ao desenvolvimento folicular ovariano. O objetivo desse trabalho foi investigar a presença de polimorfismos do gene AMH em um rebanho Nelore, analisar a constituição genética da população para o gene e estudar a associação entre os polimorfismos e as características ocorrência de prenhez precoce (OPP) e idade ao primeiro parto (IPP). Os dados fenotípicos consistiram da verificação da prenhez precoce e idade ao primeiro parto de 197 novilhas, não aparentadas, expostas à estação de monta com idade entre 15 e 17 meses (grupo precoce) ou 24 meses (grupo não precoce). O grupo denominado precoce foi composto por 67 novilhas com idade ao primeiro parto de 26.5±0.59 meses, e o segundo denominado não precoce composto por 130 novilhas com idade ao primeiro parto de 36.4±0.99 meses. Os cinco éxons do gene AMH foram amplificados por meio da técnica de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) e sequenciados. Um total de três SNPs foram identificados nesse estudo, todos localizados no éxon 5 (rs527023314, rs722016629 and rs134387246), sendo o último posicionado stop codon. Os três SNPs identificados caracterizaram mutações sinônimas. Somente o SNP rs134387246 exibiu associação significante (P ≤ 0.10) para ambas características (OPP e IPP). O estudo de associação do SNP rs134387246 revelou um efeito de sobre dominância (P=0,056), e ausência de ação gênica aditiva (P=0,67). Foi observada redução de 2,5 meses (75 dias) na idade ao primeiro parto de novilhas heterozigotas para o SNP rs134387246. Pela primeira vez na literatura, polimorfismos do gene AMH foram descritos em novilhas da raça Nelore e associados a características indicadoras de precocidade sexual.
Assuntos
Feminino , Animais , Adulto Jovem , Bovinos , Hormônio Antimülleriano/análise , Hormônio Antimülleriano/genética , Parto , Polimorfismo Genético , Prenhez/genética , Reprodução/genética , Reação em Cadeia da Polimerase/métodos , Reação em Cadeia da Polimerase/veterináriaRESUMO
The main definition for meat quality should include factors that affect consumer appreciation of the product. Physical laboratory analyses are necessary to identify factors that affect meat quality and specific equipment is used for this purpose, which is expensive and destructive, and the analyses are usually time consuming. An alternative method to performing several beef analyses is near-infrared reflectance spectroscopy (NIRS), which permits to reduce costs and to obtain faster, simpler, and nondestructive measurements. The objective of this study was to evaluate the feasibility of NIRS to predict shear force [Warner-Bratzler shear force (WBSF)], marbling, and color (*a = redness; b* = yellowness; and L* = lightness) in meat samples of uncastrated male Nelore cattle, that were approximately 2-yr-old. Samples of longissimus thoracis (n = 644) were collected and spectra were obtained prior to meat quality analysis. Multivariate calibration was performed by partial least squares regression. Several preprocessing techniques were evaluated alone and in combination: raw data, reduction of spectral range, multiplicative scatter correction, and 1st derivative. Accuracies of the calibration models were evaluated using the root mean square error of calibration (RMSEC), root mean square error of prediction (RMSEP), coefficient of determination in the calibration (R2C), and prediction (R2P) groups. Among the different preprocessing techniques, the reduction of spectral range provided the best prediction accuracy for all traits. The NIRS showed a better performance to predict WBSF (RMSEP = 1.42 kg, R2P = 0.40) and b* color (RMSEP = 1.21, R2P = 0.44), while its ability to accurately predict L* (RMSEP = 1.98, R2P = 0.16) and a* (RMSEP = 1.42, R2P = 0.17) was limited. NIRS was unsuitable to predict subjective meat quality traits such as marbling in Nelore cattle.
Assuntos
Bovinos/fisiologia , Carne Vermelha/normas , Espectroscopia de Luz Próxima ao Infravermelho/veterinária , Animais , Calibragem , Bovinos/crescimento & desenvolvimento , Cor , Estudos de Viabilidade , Análise dos Mínimos Quadrados , Masculino , FenótipoRESUMO
The objective of this study was to compare SNP-BLUP, BayesCπ, BayesC and Bayesian Lasso methodologies to predict the direct genomic value for saturated, monounsaturated, and polyunsaturated fatty acid profile, omega 3 and 6 in the Longissimus thoracis muscle of Nellore cattle finished in feedlot. A total of 963 Nellore bulls with phenotype for fatty acid profiles, were genotyped using the Illumina BovineHD BeadChip (Illumina, San Diego, CA) with 777,962 SNP. The predictive ability was evaluated using cross validation. To compare the methodologies, the correlation between DGV and pseudo-phenotypes was calculated. The accuracy varied from -0.40 to 0.62. Our results indicate that none of the methods excelled in terms of accuracy, however, the SNP-BLUP method allows obtaining less biased genomic evaluations, thereby; this method is more feasible when taking into account the analyses' operating cost. Despite the lowest bias observed for EBV, the adjusted phenotype is the preferred pseudophenotype considering the genomic prediction accuracies regarding the context of the present study.
Assuntos
Ácidos Graxos/análise , Genômica/métodos , Carne/análise , Modelos Genéticos , Proteínas Musculares/genética , Músculo Esquelético/metabolismo , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Animais , Animais Endogâmicos , Teorema de Bayes , Brasil , Bovinos , Ácidos Graxos/metabolismo , Ácidos Graxos Monoinsaturados/metabolismo , Ácidos Graxos Ômega-3/metabolismo , Ácidos Graxos Ômega-6/metabolismo , Estudos de Viabilidade , Humanos , Masculino , Proteínas Musculares/metabolismo , Músculo Esquelético/crescimento & desenvolvimento , Valor Nutritivo , Seleção GenéticaRESUMO
Foram utilizadas 3.202 primeiras lactações de vacas da raça Holandesa de quatro fazendas da região Sudeste, para verificar a influência da estrutura de dados de produção de leite sobre os parâmetros genéticos. Foram testados quatro arquivos com diferentes estruturas: controles semanais (CS), arquivo mensal (CM), bimestral (CB) e trimestral (CT), com 122.842, 30.883, 15.837 e 12.702 controles, respectivamente. Um modelo de regressão aleatória foi empregado nas análises, considerando os efeitos genético aditivo e o de ambiente permanente de animal, como aleatórios. Os efeitos fixos, grupos de contemporâneos (GC) foram comuns para todos os arquivos de dados e foram compostos por fazenda, mês e ano do controle, além da co-variável idade da vaca ao parto (regressão linear e quadrática). As estimativas de herdabilidade apresentaram tendências mais semelhantes entre os arquivos de dados CS, CM e CB. O arquivo de dados CB apresentou estimativas de parâmetros genéticos com as mesmas tendências e magnitudes que os arquivos CS e CM, permitindo afirmar que não houve influência da estrutura dos dados sobre as estimativas dos componentes de (co)variância e que o controle leiteiro poderia ser realizado em uma estrutura CB.
A total of 3.035 lactations of Holstein cows from four farms in the Southeast, to check the influence of data structure of milk yield on the genetic parameters. Four dataset with different structures were tested, weekly controls (CW) with 122.842 controls, monthly controls (CM) 30.883, bimonthly controls (CB) with 15,837 and quarterly controls (CQ) with 12,702. The random regression model was used and was considered as random additive genetic and permanent environment effects, fixed effects of the contemporary groups (herd-year-month of test-day) and age of cow (linear and quadratic effects). Heritability estimates showed similar trends among the data files analyzed, with the greatest similarity between dataset CS, CM and CB. The dataset submitted all the CB estimates of genetic parameters analyzed with the same trend and similar magnitude to the CS and CM dataset, allowing the claim that there was no influence of the data structure on estimates of covariance components for the dataset CS, CM and CB. Thus, milk recording could be accomplished in a CB structure.
RESUMO
Foram utilizadas 3.202 primeiras lactações de vacas da raça Holandesa de quatro fazendas da região Sudeste, para verificar a influência da estrutura de dados de produção de leite sobre os parâmetros genéticos. Foram testados quatro arquivos com diferentes estruturas: controles semanais (CS), arquivo mensal (CM), bimestral (CB) e trimestral (CT), com 122.842, 30.883, 15.837 e 12.702 controles, respectivamente. Um modelo de regressão aleatória foi empregado nas análises, considerando os efeitos genético aditivo e o de ambiente permanente de animal, como aleatórios. Os efeitos fixos, grupos de contemporâneos (GC) foram comuns para todos os arquivos de dados e foram compostos por fazenda, mês e ano do controle, além da co-variável idade da vaca ao parto (regressão linear e quadrática). As estimativas de herdabilidade apresentaram tendências mais semelhantes entre os arquivos de dados CS, CM e CB. O arquivo de dados CB apresentou estimativas de parâmetros genéticos com as mesmas tendências e magnitudes que os arquivos CS e CM, permitindo afirmar que não houve influência da estrutura dos dados sobre as estimativas dos componentes de (co)variância e que o controle leiteiro poderia ser realizado em uma estrutura CB.(AU)
A total of 3.035 lactations of Holstein cows from four farms in the Southeast, to check the influence of data structure of milk yield on the genetic parameters. Four dataset with different structures were tested, weekly controls (CW) with 122.842 controls, monthly controls (CM) 30.883, bimonthly controls (CB) with 15,837 and quarterly controls (CQ) with 12,702. The random regression model was used and was considered as random additive genetic and permanent environment effects, fixed effects of the contemporary groups (herd-year-month of test-day) and age of cow (linear and quadratic effects). Heritability estimates showed similar trends among the data files analyzed, with the greatest similarity between dataset CS, CM and CB. The dataset submitted all the CB estimates of genetic parameters analyzed with the same trend and similar magnitude to the CS and CM dataset, allowing the claim that there was no influence of the data structure on estimates of covariance components for the dataset CS, CM and CB. Thus, milk recording could be accomplished in a CB structure.(AU)
Assuntos
Animais , Feminino , Bovinos , Análise de Regressão , Perfil Genético , Leite , Análise de DadosRESUMO
Com o objetivo de estudar o desenvolvimento de características de carcaça obtidas por ultrassom, peso vivo, perímetro torácico e altura do posterior, dados longitudinais foram analisados por diferentes estruturas de (co)variâncias residuais que consideram homogeneidade ou heterogeneidade de (co)variâncias, para melhor representar a variabilidade entre observações e dentro de indivíduo, ao longo do tempo. As medidas foram obtidas em 120 novilhas, sendo 60 ½ Braunvieh x » Santa Gertrudes » x Nelore e 60 ½ Santa Gertrudes x ½ Nelore. As características foram avaliadas em intervalos de 28 dias, totalizando até cinco medidas em cada grupo. Foram comparados diversos modelos com o intuito de identificar estruturas de (co)variâncias residuais adequadas para melhor representar a variação das medidas dentro de indivíduos, com base no critério Schwarzs Bayesian Criterion. Posteriormente, avaliou-se o modelo mais adequado para regredir as características em função da idade, usando polinômios ordinários e verificando a necessidade de diferentes curvas para cada grupo genético. Diferentes estruturas de (co)variância residual devem ser consideradas em análise de dados longitunais, visando melhor representar a variabilidade entre observações e dentro de indivíduo. Os grupos genéticos estudados diferem entre si, ao longo do tempo, para as características peso, altura do posterior, perímetro torácico e área de olho de lombo.(AU)`ipt
The aim of this paper was to study the development of carcass traits obtained by ultrasound, weight, chest circumference and hip height by longitudinal data of two genetic groups of heifers. These data were analyzed by different structures of residual (co)variance consider homogeneity or heterogeneity of (co)variances to better represent the variability between and within individual observations over the time. The traits were obtained in 60 animals ½ Braunvieh x » Santa Gertrudes x » Nelore and 60 animals ½ Santa Gertrudes x ½ Nelore. The traits were evaluated at intervals of 28 days. The comparison was done with several models, based on the criterion SBC (Schwarzs Bayesian Criterion) with the goal of identifying structures of residual (co) variance more appropriate to best represent the variation of the measures within individuals. Later, as the animals were measured at different ages, it was evaluated the most appropriate model to regress these traits as a function of age, using ordinary polynomials and verifying the need for different curves for each genetic group. The results indicated that it should consider different structures of residual (co)variance to better represent the variability between and within individual observations. For weight, hip height, chest circumference and longissimus muscle area traits there are differences in the genetic group over the time.(AU)
Assuntos
Animais , Carne/análise , Ovinos/classificação , Criação de Animais Domésticos , UltrassonografiaRESUMO
Com o objetivo de estudar o desenvolvimento de características de carcaça obtidas por ultrassom, peso vivo, perímetro torácico e altura do posterior, dados longitudinais foram analisados por diferentes estruturas de (co)variâncias residuais que consideram homogeneidade ou heterogeneidade de (co)variâncias, para melhor representar a variabilidade entre observações e dentro de indivíduo, ao longo do tempo. As medidas foram obtidas em 120 novilhas, sendo 60 ½ Braunvieh x » Santa Gertrudes » x Nelore e 60 ½ Santa Gertrudes x ½ Nelore. As características foram avaliadas em intervalos de 28 dias, totalizando até cinco medidas em cada grupo. Foram comparados diversos modelos com o intuito de identificar estruturas de (co)variâncias residuais adequadas para melhor representar a variação das medidas dentro de indivíduos, com base no critério Schwarzs Bayesian Criterion. Posteriormente, avaliou-se o modelo mais adequado para regredir as características em função da idade, usando polinômios ordinários e verificando a necessidade de diferentes curvas para cada grupo genético. Diferentes estruturas de (co)variância residual devem ser consideradas em análise de dados longitunais, visando melhor representar a variabilidade entre observações e dentro de indivíduo. Os grupos genéticos estudados diferem entre si, ao longo do tempo, para as características peso, altura do posterior, perímetro torácico e área de olho de lombo.`ipt
The aim of this paper was to study the development of carcass traits obtained by ultrasound, weight, chest circumference and hip height by longitudinal data of two genetic groups of heifers. These data were analyzed by different structures of residual (co)variance consider homogeneity or heterogeneity of (co)variances to better represent the variability between and within individual observations over the time. The traits were obtained in 60 animals ½ Braunvieh x » Santa Gertrudes x » Nelore and 60 animals ½ Santa Gertrudes x ½ Nelore. The traits were evaluated at intervals of 28 days. The comparison was done with several models, based on the criterion SBC (Schwarzs Bayesian Criterion) with the goal of identifying structures of residual (co) variance more appropriate to best represent the variation of the measures within individuals. Later, as the animals were measured at different ages, it was evaluated the most appropriate model to regress these traits as a function of age, using ordinary polynomials and verifying the need for different curves for each genetic group. The results indicated that it should consider different structures of residual (co)variance to better represent the variability between and within individual observations. For weight, hip height, chest circumference and longissimus muscle area traits there are differences in the genetic group over the time.
Assuntos
Animais , Carne/análise , Criação de Animais Domésticos , Ovinos/classificação , UltrassonografiaRESUMO
O presente estudo foi desenvolvido com o objetivo de estimar herdabilidade e repetibilidade para diferentes medidas de eficiência produtiva de vacas e determinar a melhor maneira de calcular as relações de peso, visando a sua utilização como critério de seleção em rebanhos da raça Nelore. Os dados analisados são de animais da raça Nelore, pertencentes ao Projeto de Seleção das Raças Zebuínas e Caracu do Centro APTA Bovinos de Corte, do Instituto de Zootecnia de Sertãozinho. Os animais são selecionados para maior peso ao sobreano (rebanhos NeS e NeT, analisados como um único rebanho) e para peso ao sobreano próximo da média (NeC) do grupo de contemporâneos, desde 1980. As características utilizadas no estudo foram: 1) RPN = relação de peso ao nascer do bezerro / peso da vaca ao parto; 2) RPN2 = relação do peso ao nascer do bezerro / peso metabólico da vaca ao parto; 3) RPD = relação de peso à desmama do bezerro / peso da vaca à desmama; e 4) RPD2 = relação do peso à desmama do bezerro / peso metabólico da vaca à desmama. Os parâmetros genéticos foram estimados considerando dois arquivos: vacas com bezerros (CB) e vacas com e sem bezerros (SB). A RPN e a RPN2 foram calculadas somente no arquivo CB, enquanto que RPD e RPD2 foram calculadas em ambos os arquivos (CB e SB). Os parâmetros genéticos foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita. As estimativas de herdabilidade para as características RPN; RPN2; RPD_CB; RPD2_CB; RPD_SB e RPD2_SB foram: 0,17±0,02; 0,16±0,02; 0,22±0,04; 0,19±0,03; 0,20±0,01 e 0,16±0,01, respectivamente. As repetibilidades estimadas variaram de 0,22 a 0,68. A utilização das relações de peso como critério de seleção deve promover, a longo prazo, melhorias na eficiência produtiva das vacas. As relações de peso têm sido consideradas apenas como informações para o descarte de vacas em alguns programas de seleção, mas poderiam ser incluídas em índices de seleção, principalmente quando calculada considerando o peso metabólico da vaca à desmama, incluindo tanto as vacas que desmamaram um bezerro, quanto aquelas que falharam em desmamar.
The objective of this study was to estimate heritability and repeatability for different measures of cows' productive efficiency and determine the best way to calculate the weight ratios, in order to use as selection criteria in Nelore herds. Data of Nelore animals from Centro APTA Bovinos de Corte-Sertãozinho, Instituto de Zootecnia were analyzed. The animals are selected for higher yearling weight (NeS and NeT herds, considered as a single herd in this paper) and, for mean yearling weight (NeC) within contemporary group, since 1980. The traits used in this study were: 1) RPN = ratio of birth weight of the calf / cow weight at calving; 2) RPN2 = ratio of birth weight of the calf / metabolic cow weight at calving; 3) RPD = ratio of weaning weight of the calf / cow weight at weaning and, 4) RPD2 = ratio of weaning weight of calf / metabolic cow weaning weight. For estimate genetic and phenotypic parameters, were considered two files: cows with calves (CB) or with and without calves (SB). The RPN and RPN2 were calculated only on CB file, and RPD and RPD2 were calculated in both files (CB and SB). Genetic parameters were estimated by restricted maximum likelihood. Estimates of heritability for traits RPN; RPN2; RPD_CB; RPD2_CB; RPD_SB and RPD2_SB were: 0.17±0.02, 0.16±0.02, 0.22±0.04, 0.19±0.03, 0.20±0.01 and 0.16±0.01, respectively. The repeatability estimates ranged from 0.22 to 0.68. The use of weight ratios as selection criteria should promote, at long-term, improvements in production efficiency. In some breeding programs, weight ratios have been considered only as information for disposal of cows, but could be included in selection indices, especially if it is calculated considering the metabolic weight of cow at weaning from both cows, that weaned a calf as those that failed to wean.
RESUMO
Este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de estudar a evolução das características de crescimento e carcaça em função da idade em bovinos da raça Hereford, utilizando modelos não-lineares. Foram utilizados dados de 240 bovinos machos (castrados) da raça Hereford, pertencentes à fazenda Experimental "La Estanzuela" do INIA, Colonia, Uruguai. As características começaram a ser mensuradas a partir da desmama de animais com aproximadamente seis meses de idade, até o abate (dois anos de idade). As medições de peso foram realizadas a cada 15±3 dias durante todo o período e sem jejum prévio. As mensurações de área de olho de lombo, obtidas por ultrassom, e altura dos animais foram obtidas a cada 90 dias, sendo que as medidas de ultrassom foram tomadas entre a 12ª e 13ª costelas. Os modelos não-lineares utilizados foram os modelos de Brody, Gompertz, Logístico e Von Bertalanffy. Para as características peso, altura e área de olho de lombo, todos os modelos avaliados atingiram a convergência. Para descrever a evolução dos dados de peso e área de olho de lombo em função da idade, o modelo de Von Bertalanffy foi o mais indicado, e os modelos de Brody e Logístico mostraram o pior ajuste, respectivamente. A evolução da altura dos animais desde o desmame até os dois anos de idade pode ser modelada através de qualquer um dos modelos não-lineares considerados neste estudo.
The objective of this research was to study the evolution of growth and carcass traits as a function of age in Hereford cattle using nonlinear models. Records from 240 Hereford steers (castrated), belonging to the experimental station "La Estanzuela" of INIA Uruguay, were utilized. The animals were measured from weaning, approximately at 6 months of age, to slaughter (two years of age). The animals were weighed, without fasting, every 15±3 days throughout the period. The measurements of ribeye loin area (between the 12th and 13th rib) were obtained by ultrasound every 90 days. The height of the animals was obtained every 90 days. The Brody, Gompertz, Logistic and Von Bertalanffy nonlinear models were applied to describe the trajectory of weight, height and ribeye loin area along the age. For height, weight and ribeye loin area, all the models reached the convergence. To describe the evolution of weight and ribeye loin area, the Von Bertalanffy nonlinear model was the most suitable. For weight and ribeye loin area, the Brody and Logistic nonlinear models have shown the worst fit, respectively. The height trajectory from weaning until two years of age can be modeled by any of the nonlinear models considered in this research.
RESUMO
Records from 106,212 Nellore animals, born between 1998 and 2006, were used to estimate (co)variance components and genetic parameters for birth weight (BW), average weight gains from birth to weaning (GBW), average weight gains from weaning to after yearling (GWAY), weaning hip height (WHH), postweaning hip height (PHH) and scrotal circumferences at 9 (SC9), 12 (SC12) and 15 (SC15) months of age. (Co)variance components were estimated by an animal model using multi-trait analysis. Heritability estimates for BW, GBW, GWAY, WHH, PHH, SC9, SC12 and SC15 were 0.31 ± 0.01; 0.25 ± 0.02; 0.30 ± 0.04; 0.51 ± 0.04; 0.54 ± 0.04; 0.39 ± 0.01; 0.41 ± 0.01 and 0.44 ± 0.02, respectively. Genetic correlations between growth traits ranged from 0.09 ± 0.01 to 0.88 ± 0.01, thereby implying that, at any age, selection to increase average weight gains will also increase stature. Genetic correlations between BW and average weight gains with scrotal circumferences were all positive and moderate (0.15 ± 0.03 to 0.38 ± 0.01). On the other hand, positive and low genetic associations were estimated between hip height and scrotal circumference at different ages (0.09 ± 0.01 to 0.17 ± 0.02). The results of this study pointed out that selection to larger scrotal circumferences in males will promote changes in average weight gains. In order to obtain Nellore cattle with the stature and size suitable for the production system, both weight gain and hip height should be included in a selection index.
RESUMO
The objectives of this study were to estimate the genetic parameters for milk yield unadjusted and adjusted for days in milk and, subsequently, to assess the influence of adjusting for days in milk on sire rank. Complete lactations from 90 or 150 days of lactation to 270 or 350 days in milk were considered in these analyses. Milk yield was adjusted for days in milk by multiplicative correction factors, or by including lactation length as a covariable in the model. Milk yields adjusted by different procedures were considered as different traits. Heritability estimates varied from 0.17 to 0.28. Genetic correlation estimates between milk yields unadjusted and adjusted for days in milk were greater than 0.82. Adjusting for days in milk affected the parameter estimates. Multiplicative correction factors produced the highest heritability estimates. More reliable breeding value estimates can be expected by including short length lactation records in the analyses and adjusting the milk yields for days in milk, regardless of the method used for the adjustment. High selection intensity coupled to the inclusion of short length lactations and adjustment with multiplicative factors can change the sire rank..
RESUMO
The objective was to evaluate the interactions of genotype-environment effects on the components of (co)variance estimates and the prediction of breeding values for weaning weight in Nelore cattle, using a Bayesian approach. Records of 16,644 weaning weights were used from cattle distributed in ten ranches across six Brazilian states. The genetic parameters were estimated under an animal model considering Bayesian statistics. To verify genotype-environment interaction effects, we analyzed the following matrix model: without the inclusion of genotype-environment interaction effects, and with the inclusion of genotype-environment interaction effects, which considered the effect of sire-year, sire-herd, and both effects. In general, the results suggest that the inclusion of genotype-environment interaction in genetic analysis for weight at weaning tends to alter the estimates of genetic and environment (co)variances. The Spearman correlations between the breeding values were above 97%, indicating practically no change in the classification of animals evaluated. It can be inferred that the interaction effects of sire-year and sire-herd do not change the animals rank, and if not included in the genetic evaluation, the selection based on predictions of breeding values for weaning weight will not be affected.
Objetivou-se avaliar os efeitos das interações genótipo-ambiente sobre as estimativas de componentes de (co)variâncias e predição dos valores genéticos para o peso ao desmame de bovinos Nelore, sob enfoque bayesiano. Foram utilizados 16.644 registros de pesos ao desmame de bovinos provenientes de dez rebanhos participantes do Programa Nelore Brasil. Os parâmetros genéticos foram estimados sob modelo animal, considerando a estatística bayesiana. Para verificar o efeito da interação genótipo-ambiente, foram analisados os seguintes modelos matriciais: sem a inclusão dos efeitos de interação genótipo-ambiente; com a inclusão dos efeitos de interação genótipo-ambiente, em que se considerou o efeito de touro-ano, touro-rebanho e ambos os efeitos. De modo geral, verifica-se que a inclusão da interação genótipo-ambiente na análise genética para o peso ao desmame, tende a alterar as estimativas de (co)variâncias genéticas e ambientais. As correlações de Spearman entre os valores genéticos foram acima de 97%, indicando que, praticamente, não houve mudança na classificação dos animais avaliados. Pode se inferir que os efeitos de interação touro-ano e touro-rebanho não alteram as classificações dos animais, e a não-inclusão destes efeitos na avaliação genética, não afetam a seleção baseada nas predições dos valores genéticos para o peso ao desmame.
RESUMO
Objetivou-se avaliar os efeitos das interações genótipo-ambiente sobre as estimativas de componentes de (co)variâncias e predição dos valores genéticos para o peso ao desmame de bovinos Nelore, sob enfoque bayesiano. Foram utilizados 16.644 registros de pesos ao desmame de bovinos provenientes de dez rebanhos participantes do Programa Nelore Brasil. Os parâmetros genéticos foram estimados sob modelo animal, considerando a estatística bayesiana. Para verificar o efeito da interação genótipo-ambiente, foram analisados os seguintes modelos matriciais: sem a inclusão dos efeitos de interação genótipoambiente; com a inclusão dos efeitos de interação genótipo-ambiente, em que se considerou o efeito de touro-ano, touro-rebanho e ambos os efeitos. De modo geral, verifica-se que a inclusão da interação genótipo-ambiente na análise genética para o peso ao desmame, tende a alterar as estimativas de (co)variâncias genéticas e ambientais. As correlações de Spearman entre os valores genéticos foram acima de 97%, indicando que, praticamente, não houve mudança na classificação dos animais avaliados. Pode se inferir que os efeitos de interação touro-ano e touro-rebanho não alteram as classificações dos animais, e a não-inclusão destes efeitos na avaliação genética, não afetam a seleção baseada nas predições dos valores genéticos para o peso ao desmame.
The objective was to evaluate the interactions of genotype-environment effects on the components of (co)variance estimates and the prediction of breeding values for weaning weight in Nelore cattle, using a Bayesian approach. Records of 16,644 weaning weights were used from cattle distributed in ten ranches across six Brazilian states. The genetic parameters were estimated under an animal model considering Bayesian statistics. To verify genotype-environment interaction effects, we analyzed the following matrix model: without the inclusion of genotype-environment interaction effects, and with the inclusion of genotype-environment interaction effects, which considered the effect of sire-year, sire-herd, and both effects. In general, the results suggest that the inclusion of genotype-environment interaction in genetic analysis for weight at weaning tends to alter the estimates of genetic and environment (co)variances. The Spearman correlations between the breeding values were above 97%, indicating practically no change in the classification of animals evaluated. It can be inferred that the interaction effects of sire-year and sire-herd do not change the animals rank, and if not included in the genetic evaluation, the selection based on predictions of breeding values for weaning weight will not be affected.