RESUMO
Salar de Ascotán is a high-altitude arsenic-rich salt flat exposed to high ultraviolet radiation in the Atacama Desert, Chile. It hosts unique endemic flora and fauna and is an essential habitat for migratory birds, making it an important site for conservation and protection. However, there is limited information on the resident microbiota's diversity, genomic features, metabolic potential, and molecular mechanisms that enable it to thrive in this extreme environment. We used long- and short-read metagenomics to investigate the microbial communities in Ascotán's water, sediment, and soil. Bacteria predominated, mainly Pseudomonadota, Acidobacteriota, and Bacteroidota, with a remarkable diversity of archaea in the soil. Following hybrid assembly, we recovered high-quality bacterial (101) and archaeal (6) metagenome-assembled genomes (MAGs), including representatives of two putative novel families of Patescibacteria and Pseudomonadota and two novel orders from the archaeal classes Halobacteriota and Thermoplasmata. We found different metabolic capabilities across distinct lineages and a widespread presence of genes related to stress response, DNA repair, and resistance to arsenic and other metals. These results highlight the remarkable diversity and taxonomic novelty of the Salar de Ascotán microbiota and its rich functional repertoire, making it able to resist different harsh conditions. The highly complete MAGs described here could serve future studies and bioprospection efforts focused on salt flat extremophiles, and contribute to enriching databases with microbial genome data from underrepresented regions of our planet.
RESUMO
Multidrug- and carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CR-Kp) are critical threats to global health and key traffickers of resistance genes to other pathogens. Despite the sustained increase in CR-Kp infections in Chile, few strains have been described at the genomic level, lacking details of their resistance and virulence determinants and the mobile elements mediating their dissemination. In this work, we studied the antimicrobial susceptibility and performed a comparative genomic analysis of 10 CR-Kp isolates from the Chilean surveillance of carbapenem-resistant Enterobacteriaceae. High resistance was observed among the isolates (five ST25, three ST11, one ST45, and one ST505), which harbored 44 plasmids, most carrying genes for conjugation and resistance to several antibiotics and biocides. Ten plasmids encoding carbapenemases were characterized, including novel plasmids or variants with additional resistance genes, a novel genetic environment for blaKPC-2, and plasmids widely disseminated in South America. ST25 K2 isolates belonging to CG10224, a clone traced back to 2012 in Chile, which recently acquired blaNDM-1, blaNDM-7, or blaKPC-2 plasmids stood out as high-risk clones. Moreover, this corresponds to the first report of ST25 and ST45 Kp producing NDM-7 in South America and ST505 CR-Kp producing both NDM-7 and KPC-2 worldwide. Also, we characterized a variety of genomic islands carrying virulence and fitness factors. These results provide baseline knowledge for a detailed understanding of molecular and genetic determinants behind antibiotic resistance and virulence of CR-Kp in Chile and South America. IMPORTANCE In the ongoing antimicrobial resistance crisis, carbapenem-resistant strains of Klebsiella pneumoniae are critical threats to public health. Besides globally disseminated clones, the burden of local problem clones remains substantial. Although genomic analysis is a powerful tool for improving pathogen and antimicrobial resistance surveillance, it is still restricted in low- to middle-income countries, including Chile, causing them to be underrepresented in genomic databases and epidemiology surveys. This study provided the first 10 complete genomes of the Chilean surveillance for carbapenem-resistant K. pneumoniae in healthcare settings, unveiling their resistance and virulence determinants and the mobile genetic elements mediating their dissemination, placed in the South American and global K. pneumoniae epidemiological context. We found ST25 with K2 capsule as an emerging high-risk clone, along with other lineages producing two carbapenemases and several other resistance and virulence genes encoded in novel plasmids and genomic islands.
Assuntos
Humanos , Cirurgia Colorretal , Fístula Retal/cirurgia , Fístula Retal/complicações , Fístula Retal/diagnóstico , Fístula Retal/epidemiologia , Fístula Retal/etiologia , Fístula Retal/fisiopatologia , Fístula Retal/mortalidade , Fístula Retal/terapia , Fístula Retal , Abscesso , Diagnóstico Diferencial , Incontinência Fecal , Dor , Complicações Pós-Operatórias , Recidiva , Supuração/diagnósticoAssuntos
Humanos , Fístula Retal/diagnóstico , Fístula Retal/etiologia , Fístula Retal/fisiopatologia , Fístula Retal/epidemiologia , Fístula Retal/diagnóstico por imagem , Fístula Retal/terapia , Fístula Retal/cirurgia , Fístula Retal/complicações , Fístula Retal/mortalidade , Cirurgia Colorretal , Abscesso/cirurgia , Abscesso/diagnóstico , Abscesso/diagnóstico por imagem , Dor , Diagnóstico Diferencial , Supuração/diagnóstico , Complicações Pós-Operatórias , Recidiva , Incontinência Fecal/terapiaRESUMO
Manual que guia al cirujano en los principios básicos en los desarollo de la cirugia laparascópica, enseña trucos que hacen su desarollo más facil y seguro, sus capitulos contienen todo lo que hay que saber de la práctica de la cirugia laparascópica
Assuntos
Cirurgia Vídeoassistida/instrumentação , Cirurgia Vídeoassistida/normas , Cirurgia Vídeoassistida , Laparoscopia , ParaguaiRESUMO
Manual que guia al cirujano en los principios básicos en los desarollo de la cirugia laparascópica, enseña trucos que hacen su desarollo más facil y seguro, sus capitulos contienen todo lo que hay que saber de la práctica de la cirugia laparascópica
Assuntos
Cirurgia Vídeoassistida/instrumentação , Cirurgia Vídeoassistida/normas , Cirurgia Vídeoassistida , Laparoscopia/métodos , ParaguaiRESUMO
Introducción: La invaginación intestinal en el adulto es poco frecuente y en general, secundaria a procesos tumorales. En esta revisión se pretende analizar las características de presentación y establecer alguno, pauta, de orientación diagnóstica. Material y métodos: Se revisaron las historias clínicas de diecisiete pacientes tratados en la II Cátedra de Clínica Quirúrgica del Hospital de Clínicas de la Facultad de Ciencias Médicas de la Universidad Nacional de Asunción, en el período entre 1956 y 1996. Se analizaron antecedentes, formas de presentación, estudios realizados, diagnósticos preoperatorios, tratamiento, evolución hasta el alta y los estudios histopatológicos. Resultados: diez paciente, fueron del sexo femenino (58,8 por ciento) y siete varones (41,2 por ciento). La edad promedio fue de 46 años. Los hallazgos clínicos más frecuentes fueron el dolor (100 por ciento) y la palpación de un tumor (76,4 por ciento). El 41,2 por ciento de los pacientes cursaron en forma crónica, 23,5 por ciento en forma subaguda y el 35,3 por ciento en forma aguda. Se practicaron radiografía simple en trece pacientes, enema opaco en cuatro y ecografía en tres. El diagnostico preoperatorio correcto se hizo en cuatro casos (23,5 por ciento). La variedad ileo-ceco-cólica se constato en seis casos (35,3 por cineto), ileo-ileal en cuatro, colo-cólica en cuatro, ileo-yeyunal en dos y yeyuno-yeyunal en uno. El tratamiento fue quirúrgico en todos los casos. Practicandose la resección intestinal en quince pacientes (88,2 por ciento) y la simple desinvaginación en dos (11, 8 por ciento). La histopatología informó una causa orgánica en 92,8 por ciento de los pacientes. Conclusión: A pesar de una clínica sugerente, el diagnóstico preoperatorio fue infrecuente. Este aspecto puede mejorarse pensando en ella y utilizando los medios de diagnóstico disponibles(AU)
RESUMO
En el presente trabajo se revisan 115 casos de fístulas anales recidivantes sobre un total de 398 pacientes operados por fístulas anales criptoglandulares en la 2º Cátedra de Clínica Quirúrgica del Hospital de Clínicas de la Facultad de Ciencias Médicas de Asunción y en el Hospital Regional de San Lorenzo, Paraguay, en un período comprendido entre agosto de 1986 a marzo de 1995. El promedio de operaciones previas fue de tres intervenciones, realizadas en 89 por ciento por cirujanos no especializados. La causa más común de recidiva fue la intervención incompleta, particularmente la falta de tratamiento del orificio primario. La mayoría de las recurrencias aparecieron entre los seis meses a dos años y fueron más frecuentes en las fístulas altas. Las fístulas anales recidivantes fueron tratadas por la puesta a plano por etapas. Presentaron nueva recidiva tres pacientes (2,6 por ciento) y hubo trastornos leves de la continencia en 22 pacientes (19,1 por ciento)(AU)