RESUMEN
The novel KIR2DL1*00308 allele differs from the closest allele KIR2DL1*00302 by a single sense mutation.
Asunto(s)
Alelos , Pueblo Asiatico , Exones , Receptores KIR2DL1 , Humanos , Pueblo Asiatico/genética , Receptores KIR2DL1/genética , Secuencia de Bases , Análisis de Secuencia de ADN , China , Alineación de Secuencia , Prueba de Histocompatibilidad , Pueblos del Este de AsiaRESUMEN
The HLA-A*23:140 allele differs from HLA-A*23:01:01 by one nucleotide substitution (G > A), position 1968 in exon 5.
Asunto(s)
Alelos , Exones , Antígenos HLA-A , Donantes de Tejidos , Humanos , Brasil , Antígenos HLA-A/genética , Prueba de Histocompatibilidad , Secuencia de Bases , Análisis de Secuencia de ADN/métodos , Polimorfismo de Nucleótido Simple , Médula Ósea , Trasplante de Médula ÓseaRESUMEN
HLA-DPA1*01:12:03 differs from HLA-DPA1*01:12:01 by one nucleotide substitution in codon 204 in exon 4.
Asunto(s)
Alelos , Secuencia de Bases , Exones , Cadenas alfa de HLA-DP , Prueba de Histocompatibilidad , Análisis de Secuencia de ADN , Humanos , Cadenas alfa de HLA-DP/genética , Cadenas alfa de HLA-DP/inmunología , Prueba de Histocompatibilidad/métodos , Análisis de Secuencia de ADN/métodos , Codón , Alineación de SecuenciaRESUMEN
HLA-C*07:02:81 differs from HLA-C*07:02:01:01 by one nucleotide substitution at position 465 (CâA) in exon 3.
Asunto(s)
Alelos , Secuencia de Bases , Exones , Antígenos HLA-C , Prueba de Histocompatibilidad , Humanos , Antígenos HLA-C/genética , Análisis de Secuencia de ADN , Mutación Silenciosa , Alineación de Secuencia , CodónRESUMEN
Two novel Class I HLA-B alleles HLA-B*13:194 and HLA-B*15:694 are described.
Asunto(s)
Alelos , Exones , Humanos , Lituania , Secuencia de Bases , Prueba de Histocompatibilidad , Análisis de Secuencia de ADN , Antígeno HLA-B13/genética , Antígeno HLA-B13/inmunología , Antígeno HLA-B15/genética , Antígeno HLA-B15/inmunología , Antígenos HLA-B/genética , Alineación de Secuencia , CodónRESUMEN
Identification of seven new HLA alleles by next-generation sequencing.
Asunto(s)
Alelos , Antígenos HLA , Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento , Prueba de Histocompatibilidad , Humanos , Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos , Antígenos HLA/genética , Prueba de Histocompatibilidad/métodos , Exones , Análisis de Secuencia de ADN/métodos , Secuencia de BasesRESUMEN
The ability to transform matter between numerous physical states or shapes without wires or external devices is a major challenge for robotics and materials design. Organisms can transform their shapes using biomolecules carrying specific information and localize at sites where transitions occur. Here, we introduce gel automata, which likewise can transform between a large number of prescribed shapes in response to a combinatorial library of biomolecular instructions. Gel automata are centimeter-scale materials consisting of multiple micro-segments. A library of DNA activator sequences can each reversibly grow or shrink different micro-segments by polymerizing or depolymerizing within them. We develop DNA activator designs that maximize the extent of growth and shrinking, and a photolithography process for precisely fabricating gel automata with elaborate segmentation patterns. Guided by simulations of shape change and neural networks that evaluate gel automata designs, we create gel automata that reversibly transform between multiple, wholly distinct shapes: four different letters and every even or every odd numeral. The sequential and repeated metamorphosis of gel automata demonstrates how soft materials and robots can be digitally programmed and reprogrammed with information-bearing chemical signals.
Asunto(s)
Resinas Acrílicas , ADN , Geles , Geles/química , ADN/química , Resinas Acrílicas/química , Redes Neurales de la Computación , Algoritmos , Fenómenos Químicos , Secuencia de BasesRESUMEN
HLA-DQA1*01:02:24 differs from HLA-DQA1*01:02:01:03 by one nucleotide substitution in codon 167 in exon 3.
Asunto(s)
Alelos , Secuencia de Bases , Exones , Cadenas alfa de HLA-DQ , Prueba de Histocompatibilidad , Análisis de Secuencia de ADN , Humanos , Cadenas alfa de HLA-DQ/genética , Análisis de Secuencia de ADN/métodos , Codón , Alineación de SecuenciaRESUMEN
HLA-B*49:01:01:22 differs from HLA-B*49:01:01:01 by a single nucleotide C->G change in intron 5 at gDNA 2451.
Asunto(s)
Alelos , Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento , Prueba de Histocompatibilidad , Intrones , Trasplante de Riñón , Donantes de Tejidos , Humanos , Prueba de Histocompatibilidad/métodos , India , Exones , Secuencia de Bases , Polimorfismo de Nucleótido Simple , Análisis de Secuencia de ADN/métodos , Antígeno HLA-B39/genéticaRESUMEN
Mycoviruses with an unprecedented genome organization, featuring the RNA-directed RNA polymerase (RdRp) palm domain coding sequence being split into two distinct genome segments, have been found recently in a few fungi and oomycetes of different lineages and have been proposed to be named "splipalmiviruses". One of these, Oidiodendron maius splipalmivirus 1 (OmSPV1), has been detected in the ericoid mycorrhizal fungus Oidiodendron maius, and it has been proposed to be bisegmented. Here, we complete the genome sequence of this virus by describing a third RNA segment, which is 2000 nt long and whose terminal sequences are identical to those of the other two segments of OmSPV1. This segment contains a single open reading frame that codes for a protein with unknown function and has a low level of sequence identity (47%) to the putative protein encoded by the third segment of another splipalmivirus from Magnaporthe oryzae: Magnaporthe oryzae narnavirus virus 1 (MoNV1). Based on these features, we propose the RNA segment to be the third segment of the OmSPV1 genome.
Asunto(s)
Virus Fúngicos , Genoma Viral , Sistemas de Lectura Abierta , Filogenia , ARN Viral , Virus Fúngicos/genética , Virus Fúngicos/clasificación , Virus Fúngicos/aislamiento & purificación , ARN Viral/genética , Virus ARN/genética , Virus ARN/clasificación , Virus ARN/aislamiento & purificación , Proteínas Virales/genética , Secuencia de Bases , Basidiomycota/virología , Basidiomycota/genéticaRESUMEN
HLA-DPB1*04:02:24 differs from HLA-DPB1*04:02:01:01 by a single synonmous nucleotide substitution at position 639 G>A.
Asunto(s)
Alelos , Cadenas beta de HLA-DP , Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento , Prueba de Histocompatibilidad , Humanos , Cadenas beta de HLA-DP/genética , Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos , Prueba de Histocompatibilidad/métodos , Exones , Secuencia de Bases , Polimorfismo de Nucleótido Simple , Análisis de Secuencia de ADN/métodos , CodónRESUMEN
One nucleotide deletion in codon 15 of HLA-B*40:01:02:01 results in a novel null allele, HLA-B*40:510N.
Asunto(s)
Alelos , Exones , Prueba de Histocompatibilidad , Eliminación de Secuencia , Humanos , Secuencia de Bases , Análisis de Secuencia de ADN/métodos , Antígeno HLA-B40/genética , Codón , Antígenos HLA-B/genéticaRESUMEN
HLA-C*08:291, a novel HLA class I allele detected by next-generation sequencing.
Asunto(s)
Alelos , Exones , Antígenos HLA-C , Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento , Prueba de Histocompatibilidad , Humanos , Antígenos HLA-C/genética , Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos , Prueba de Histocompatibilidad/métodos , Secuencia de Bases , Codón , Análisis de Secuencia de ADN/métodos , Alineación de SecuenciaRESUMEN
HLA-DPB1*21:01:02 differs from HLA-DPB1*21:01:01 by one single nucleotide substitution at position 435 C>T in exon 3.
Asunto(s)
Alelos , Exones , Cadenas beta de HLA-DP , Prueba de Histocompatibilidad , Secuenciación de Nanoporos , Humanos , Cadenas beta de HLA-DP/genética , Prueba de Histocompatibilidad/métodos , Secuenciación de Nanoporos/métodos , Polimorfismo de Nucleótido Simple , Secuencia de Bases , Análisis de Secuencia de ADN/métodos , Donantes de Tejidos , Alineación de SecuenciaRESUMEN
Xenobiotic response element (XRE) to flavone was the cis- regulatory elements that mediates the induction of the allelochemical-metabolizing CYP321A1 gene from Helicoverpa zea. However, it was unknown whether the XRE-Fla element existed in other species. Recently we have identified and cloned the CYP321A1 gene with promoter region in a related species, Helicoverpa armigera. Sequence similarity of two orthologous CYP321A1 genes was 97.27%, but the promoter sequence similarity was only 56.32%. Sequence alignment showed the XRE-Fla like element owns three mutations in H. armigera compared with H. zea. Progressive 5' deletions and internal mutation indicated that H. armigera XRE-Fla was the essential element of CYP321A1 gene in response to flavone. XRE-Fla mutations and EMSA analysis confirmed that the H. armigera XRE-Fla element binding factor was stronger than H. zea. The findings indicate the XRE element mutations mainly contribute to the differences between the flavone-induced expressions of two CYP321A1 genes, which improve the flexibility and adaptability for allelochemical response of H. armigera.
Asunto(s)
Sistema Enzimático del Citocromo P-450 , Flavonas , Mariposas Nocturnas , Animales , Mariposas Nocturnas/genética , Mariposas Nocturnas/efectos de los fármacos , Sistema Enzimático del Citocromo P-450/genética , Sistema Enzimático del Citocromo P-450/metabolismo , Flavonas/farmacología , Proteínas de Insectos/genética , Proteínas de Insectos/metabolismo , Regiones Promotoras Genéticas , Secuencia de Bases , Elementos de Respuesta , Helicoverpa armigeraRESUMEN
The novel HLA-B*18:37:03 allele, first described in a potential bone marrow donor from Brazil.
Asunto(s)
Alelos , Exones , Humanos , Secuencia de Bases , Trasplante de Médula Ósea , Brasil , Prueba de Histocompatibilidad , Antígeno HLA-B18/genética , Antígeno HLA-B18/inmunología , Alineación de Secuencia , Análisis de Secuencia de ADN , Donantes de TejidosRESUMEN
HLA-DQB1*05:305 shows one single nucleotide substitution at position 664 compared with HLA-DQB1*05:03:01:01.
Asunto(s)
Alelos , Exones , Cadenas beta de HLA-DQ , Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento , Humanos , Secuencia de Bases , Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos , Prueba de Histocompatibilidad/métodos , Cadenas beta de HLA-DQ/genética , Polimorfismo de Nucleótido Simple , Análisis de Secuencia de ADN/métodosRESUMEN
HLA-DRB3*02:202 differs from DRB3*02:112 by one nucleotide substitution in codon 51 in exon 2.
Asunto(s)
Alelos , Secuencia de Bases , Exones , Cadenas HLA-DRB3 , Prueba de Histocompatibilidad , Análisis de Secuencia de ADN , Humanos , Codón , Prueba de Histocompatibilidad/métodos , Cadenas HLA-DRB3/genética , Alineación de Secuencia , Análisis de Secuencia de ADN/métodosRESUMEN
HLA-A*26:247 differs from HLA-A*26:01:01:01 by one nucleotide substitution in codon 245 in exon 4.
Asunto(s)
Alelos , Secuencia de Bases , Exones , Antígenos HLA-A , Prueba de Histocompatibilidad , Análisis de Secuencia de ADN , Humanos , Codón , Prueba de Histocompatibilidad/métodos , Antígenos HLA-A/genética , Alineación de Secuencia , Análisis de Secuencia de ADN/métodosRESUMEN
HLA-B*51:411 differs from HLA-B*51:01:01:01 by one nucleotide substitution in codon 235 in exon 4.