RESUMEN
Bacterial wilt caused by Ralstonia spp., soil-borne Gram-negative bacteria, is considered one of the most important plant diseases in tropical and subtropical regions of the world. A large number of bacteriophages capable of lysing or physiologically reprogramming cells of Ralstonia spp. have been reported in Asia. Despite the potential use of these organisms in the management of bacterial wilt, information on viruses that infect Ralstonia spp. is nonexistent in the Americas. We isolated a virus that infects Ralstonia spp. from a soil sample in the state of Minas Gerais, Brazil. Microscopy and genomic and phylogenetic analysis allowed us to classify the virus as a member of the family Podoviridae, genus Phikmvvirus. In spite of its relationship to Ralstonia virus RSB3, an Asian isolate, genomic and biological characteristics showed that the virus isolated in Brazil, tentatively named "Ralstonia virus phiAP1" (phiAP1), belongs to a new species. phiAP1 has EPS depolymerase activity and contains two putative virion-associated peptidoglycan hydrolases (VAPGHs), which reveals a robust mechanism of pathogenesis. Furthermore, phiAP1 specifically infects Ralstonia solanacearum, R. pseudosolanacearum and R. syzygii, causing cell lysis, but it was not able to infect thirteen other bacteria that were tested. Together, these characteristics highlight the biotechnological potential of this virus for the management of bacterial wilt.
Asunto(s)
Bacteriófagos/genética , Podoviridae/genética , Podoviridae/aislamiento & purificación , Ralstonia/virología , Secuencia de Aminoácidos , Bacteriófagos/clasificación , Bacteriófagos/aislamiento & purificación , Bacteriófagos/fisiología , Genoma Viral , Genómica , Datos de Secuencia Molecular , Filogenia , Enfermedades de las Plantas/microbiología , Podoviridae/clasificación , Podoviridae/fisiología , Ralstonia/clasificación , Ralstonia/genética , Alineación de Secuencia , Proteínas Virales/química , Proteínas Virales/genéticaRESUMEN
Ralstonia mannitolilytica junto con Ralstonia pickettii han sido asociadas con brotes hospitalarios relacionados con la contaminación de algún dispositivo o fluido. El objetivo de este trabajo fue describir un brote por R. mannitolilytica a partir de bacteriemias asociadas a catéteres implantables y semiimplantables ocurrido en un hospital pediátrico de alta complejidad y evaluar la utilidad del empleo de métodos moleculares para su investigación.Se detectó la presencia de bacilos gram negativos no fermentadores, con igual antibiotipo, en hemocultivos y retrocultivos a partir de dos pacientes que tenían catéteres implantables y estaban atendidos en una misma área del hospital. Se realizaron estudios microbiológicos de muestras de frascos de heparina, soluciones de dextrosa y soluciones antisépticas con resultado negativo. Algunos pacientes tuvieron signos y/o síntomas clínicos de bacteriemia al habilitar los catéteres para su uso. Se citaron para su estudio a todos los pacientes que habían tenido un procedimiento de apertura y cierre de catéter durante las fechas cercanas a los hallazgos en hemocultivos (N expuestos = 45). Ocurrieron 17 casos (infectados), a partir de los cuales se analizaron 23 aislamientos, en los que se pudo documentar la presencia de R. mannitolilytica (23 aislamientos). Por métodos moleculares se determinó que los aislamientos provenientes de muestras de pacientes involucrados en el brote se encontraban estrechamente relacionados y podrían representar una misma cepa o clon. Por evidencia circunstancial se consideró a la "solución heparínica de cierre" como fuente posible del brote (AU)
Both Ralstonia mannitolilytica and Ralstonia pickettii have been associated with hospital outbreaks due to device or fluid contamination. The aim of this study was to describe an implantable- or semi-implantable-catheter-related bacteremia outbreak by R. mannitolilytica in a tertiary-care hospital and to assess the usefulness of molecular analysis for the identification of the organism. Non-fermenting gram-negative bacilli, with identical antibiotypes, were detected in hemocultures of two patients with implantable catheters in the same hospital area. Microbiological studies of heparin and dextrose and antiseptic solution vials were negative. Some of the patients had clinical signs and/or symptoms of bacteremia when the catheter was prepared for use. All patients who underwent a procedure of accessing or locking the port of the catheter around the time of the positive hemoculture findings were contacted (N exposed = 45). Seventeen infections were detected, of which 23 isolates were analyzed. The presence of R. mannitolilytica was recorded in 23 isolates. Molecular analysis showed that the isolates from the samples of the patients involved in the outbreak were closely related and might represent the same strain or clone. Circumstantial evidence suggested that the heparin-lock solution may have been the source of the outbreak (AU)
Asunto(s)
Humanos , Lactante , Preescolar , Niño , Adolescente , Heparina/administración & dosificación , Catéteres de Permanencia/efectos adversos , Infección Hospitalaria , Brotes de Enfermedades , Bacteriemia/microbiología , Bacteriemia/epidemiología , Ralstonia/aislamiento & purificación , Ralstonia/clasificación , Infecciones por Bacterias Gramnegativas/microbiología , Infecciones por Bacterias Gramnegativas/epidemiologíaAsunto(s)
Bacteriemia/epidemiología , Brotes de Enfermedades , Servicio de Urgencia en Hospital/estadística & datos numéricos , Infecciones por Bacterias Gramnegativas/epidemiología , Hospitales Pediátricos/estadística & datos numéricos , Ralstonia/aislamiento & purificación , Accidentes , Bacteriemia/microbiología , Sangre/microbiología , Niño , Preescolar , Medios de Cultivo , Infecciones por Bacterias Gramnegativas/microbiología , Departamentos de Hospitales , Humanos , Lactante , Unidades de Cuidado Intensivo Neonatal , México/epidemiología , Ralstonia/clasificación , Ralstonia/genéticaRESUMEN
Ralstonia pickettii and Burkholderia cepacia complex isolates are causes of healthcare-associated infection related to contamination of intravenously administered products. Based on microbiological and epidemiological data and molecular typing by pulsed-field gel electrophoresis, we report the occurrence of two outbreaks of R. pickettii and B. cepacia complex bloodstream infections. The first outbreak occurred from August 1995 to September 1996, and the second outbreak occurred from 28 March to 8 April 1998, affecting adults and neonates, respectively. Infusion of contaminated water for injection was the source of infection.