RESUMEN

La Diabetes del adulto de inicio juvenil, es un subtipo hereditario poco común que se manifiesta a una edad temprana, relacionado con mutaciones en genes específicos que principalmente afectan la función de las células beta pancreática. Un diagnóstico preciso es fundamental para un tratamiento efectivo, aunque puede ser desafiante debido a la variabilidad en sus características clínicas y moleculares. Esta revisión analiza la evidencia disponible sobre estas características y los métodos de diagnóstico utilizados en laboratorio. Se realizó una búsqueda exhaustiva en bases de datos científicas, seleccionando estudios relevantes según criterios específicos. Se analizaron características clínicas, hallazgos moleculares y métodos de diagnóstico, utilizando tablas, gráficos y síntesis narrativas. Se identificaron mutaciones genéticas asociadas con MODY, así como biomarcadores útiles en el laboratorio clínico. Además, se describieron métodos de diagnóstico molecular, incluyendo la secuenciación de próxima generación (NGS). Esta revisión resalta la importancia del diagnóstico preciso de MODY, subrayando la diversidad de sus características biológicas y moleculares, y la necesidad de una investigación más profunda para mejorar su identificación y manejo clínico

Maturity Onset Diabetes of the Young is a rare hereditary subtype that manifests at an early age, related to mutations in specific genes that primarily affect the function of pancreatic beta cells. An accurate diagnosis is crucial for effective treatment, though it can be challenging due to variability in clinical and molecular characteristics. This review examines available evidence on these characteristics and laboratory diagnostic methods. A comprehensive search was conducted in scientific databases, selecting relevant studies based on specific criteria. Clinical features, molecular findings, and diagnostic methods were analyzed using tables, graphs, and narrative synthesis. Genetic mutations associated with MODY were identified, as well as useful biomarkers in clinical laboratory settings. Additionally, molecular diagnostic methods were described, including next-generation sequencing (NGS). This review emphasizes the importance of precise MODY diagnosis, highlighting the diversity of its biological and molecular characteristics, and the need for further research to enhance its identification and clinical management

A diabetes adulto de início juvenil é um subtipo hereditário raro que se manifesta em uma idade precoce, relacionado a mutações em genes específicos que afetam principalmente a função das células beta do pâncreas. Um diagnóstico preciso é fundamental para um tratamento eficaz, embora possa ser desafiador devido à variabilidade em suas características clínicas e moleculares. Esta revisão analisa a evidência disponível sobre essas características e os métodos de diagnóstico utilizados em laboratório. Foi realizada uma busca abrangente em bases de dados científicas, selecionando estudos relevantes com base em critérios específicos. Características clínicas, descobertas moleculares e métodos de diagnóstico foram analisados utilizando tabelas, gráficos e síntese narrativa. Foram identificadas mutações genéticas associadas ao MODY, assim como biomarcadores úteis em laboratório clínico. Além disso, foram descritos métodos de diagnóstico molecular, incluindo a sequenciação de próxima geração (NGS). Esta revisão enfatiza a importância do diagnóstico preciso do MODY, destacando a diversidade de suas características biológicas e moleculares e a necessidade de uma pesquisa mais aprofundada para melhorar sua identificação e manejo clínico

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La Diabetes del adulto de inicio juvenil, es un subtipo hereditario poco común que se manifiesta a una edad temprana, relacionado con mutaciones en genes específicos que principalmente afectan la función de las células beta pancreática. Un diagnóstico preciso es fundamental para un tratamiento efectivo, aunque puede ser desafiante debido a la variabilidad en sus características clínicas y moleculares. Esta revisión analiza la evidencia disponible sobre estas características y los métodos de diagnóstico utilizados en laboratorio. Se realizó una búsqueda exhaustiva en bases de datos científicas, seleccionando estudios relevantes según criterios específicos. Se analizaron características clínicas, hallazgos moleculares y métodos de diagnóstico, utilizando tablas, gráficos y síntesis narrativas. Se identificaron mutaciones genéticas asociadas con MODY, así como biomarcadores útiles en el laboratorio clínico. Además, se describieron métodos de diagnóstico molecular, incluyendo la secuenciación de próxima generación (NGS). Esta revisión resalta la importancia del diagnóstico preciso de MODY, subrayando la diversidad de sus características biológicas y moleculares, y la necesidad de una investigación más profunda para mejorar su identificación y manejo clínico.

Maturity Onset Diabetes of the Young is a rare hereditary subtype that manifests at an early age, related to mutations in specific genes that primarily affect the function of pancreatic beta cells. An accurate diagnosis is crucial for effective treatment, though it can be challenging due to variability in clinical and molecular characteristics. This review examines available evidence on these characteristics and laboratory diagnostic methods. A comprehensive search was conducted in scientific databases, selecting relevant studies based on specific criteria. Clinical features, molecular findings, and diagnostic methods were analyzed using tables, graphs, and narrative synthesis. Genetic mutations associated with MODY were identified, as well as useful biomarkers in clinical laboratory settings. Additionally, molecular diagnostic methods were described, including next-generation sequencing (NGS). This review emphasizes the importance of precise MODY diagnosis, highlighting the diversity of its biological and molecular characteristics, and the need for further research to enhance its identification and clinical management.

A diabetes adulto de início juvenil é um subtipo hereditário raro que se manifesta em uma idade precoce, relacionado a mutações em genes específicos que afetam principalmente a função das células beta do pâncreas. Um diagnóstico preciso é fundamental para um tratamento eficaz, embora possa ser desafiador devido à variabilidade em suas características clínicas e moleculares. Esta revisão analisa a evidência disponível sobre essas características e os métodos de diagnóstico utilizados em laboratório. Foi realizada uma busca abrangente em bases de dados científicas, selecionando estudos relevantes com base em critérios específicos. Características clínicas, descobertas moleculares e métodos de diagnóstico foram analisados utilizando tabelas, gráficos e síntese narrativa. Foram identificadas mutações genéticas associadas ao MODY, assim como biomarcadores úteis em laboratório clínico. Além disso, foram descritos métodos de diagnóstico molecular, incluindo a sequenciação de próxima geração (NGS). Esta revisão enfatiza a importância do diagnóstico preciso do MODY, destacando a diversidade de suas características biológicas e moleculares e a necessidade de uma pesquisa mais aprofundada para melhorar sua identificação e manejo clínico.

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La tuberculosis es una enfermedad infecciosa respiratoria que afecta a un tercio de la población mundial y es una amenaza significativa para la salud global. La detección de la tuberculosis de manera temprana es crucial para un tratamiento eficaz y prevenir su propagación. Una solución para mejorar el diagnóstico y abordar la resistencia a los medicamentos antituberculosos es el uso de pruebas moleculares de alto rendimiento para la identificación del Mycobacterium tuberculosis y su susceptibilidad. Este estudio de revisión narrativa busca describir las generalidades, la eficacia, la sensibilidad, las ventajas y las limitaciones de las principales pruebas moleculares; Truenat® MTB, MTB plus y MTB-RIF, Abbott RealTime MTB y MTB RIF/INH en el sistema m2000sp y m2000rt y FluoroType MTBDR, además, de compararlas con GeneXpert MTB/RIF o Xpert Ultra, utilizadas para la detección del patógeno resistente a medicamentos tuberculosos. Estas pruebas utilizan diversas técnicas para la detección del ADN del Mycobacterium tuberculosis y la cuantificación de la carga bacteriana con alta sensibilidad y especificidad, resultados rápidos, reducción de los errores humanos, así como la detección temprana de cepas drogo-resistentes. A pesar de que requieren infraestructura especializada y competencias profesionales para su implementación, representan avances significativos con el potencial de mejorar la atención sanitaria y la gestión de la tuberculosis. Estas pruebas moleculares, comparadas con el GeneXpert, son una alternativa viable, aunque esta última tecnología sigue siendo la preferida en áreas con recursos limitados

Tuberculosis is a respiratory infectious disease that affects one third of the world's population and is a significant threat to global health. Detecting tuberculosis early is crucial for effective treatment and preventing its spread. One solution to improve diagnosis and address antituberculosis drug resistance is the use of high-throughput molecular tests for the identification of Mycobacterium tuberculosis and its susceptibility. This narrative review study seeks to describe the generalities, efficacy, sensitivity, advantages and limitations of the main molecular tests: Truenat® MTB, MTB plus and MTB-RIF, Abbott RealTime MTB and MTB RIF/INH on the m2000sp and m2000rt system and FluoroType MTBDR, and to compare them with GeneXpert MTB/RIF or Xpert Ultra, used for the detection of the tuberculosis drug-resistant pathogen. These tests use various techniques for the detection of Mycobacterium tuberculosis DNA and quantification of bacterial load with high sensitivity and specificity, rapid results, reduction of human error, as well as early detection of drug-resistant strains

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Introducción: La implementación de un método diagnóstico adecuado y eficiente es crucial para la detección temprana de la tuberculosis. Esto no solo permite un control efectivo de la enfermedad para evitar su transmisión y progresión hacia estadios más graves, además previene el desarrollo de resistencia a los fármacos en los pacientes.Objetivo: Evaluar la utilidad de la prueba molecular GeneXpert MTB/RIF en el diag-nóstico de Mycobacterium tuberculosis complex, en comparación con la bacilos-copia, utilizando el cultivo como referencia.Material y Métodos: Se realizó un estudio descriptivo, observacional y no expe-rimental de corte transversal, se incluyeron 253 muestras de pacientes de ambos sexos y de variados rangos de edad, que fueron evaluadas mediante baciloscopia, GeneXpert MTB/RIF y cultivo. El estudio se centró en muestras procesadas en un Hospital público de la ciudad de Quito durante el período de enero de 2021 a mayo de 2022Resultados: La prueba molecular GeneXpert MTB/RIF mostró una sensibilidad del 94,7% y una especificidad del 93,9% para el diagnóstico de Mycobacterium tu-berculosis complex. Además, se identificó un caso de resistencia a la rifampicina.Conclusión: Este estudio confirma la eficacia de la prueba molecular GeneXpert MTB/RIF sobre la baciloscopia para el diagnóstico oportuno de Mycobacterium tu-berculosis complex. Sin embargo, es esencial considerar las diversas condiciones de las muestras y pacientes para optimizar la precisión diagnóstica

Introduction: Implementing an appropriate and efficient diagnostic method is cru-cial for the early detection of tuberculosis. This not only allows for effective control of the disease to prevent its transmission and progression to more severe stages but also prevents the development of drug resistance in patients.Objective: To evaluate the utility of the GeneXpert MTB/RIF molecular test in diag-nosing Mycobacterium tuberculosis complex, compared to sputum smear micros-copy, using culture as the reference. Material and Methods: A descriptive, observational, and non-experimental cross-sectional study was conducted, including 253 samples from patients of both sexes and various age ranges, which were assessed using sputum smear micros-copy, GeneXpert MTB/RIF, and culture. The study focused on samples processed at a Quito ́s Public Hospital during the period from January 2021 to May 2022.Results: The GeneXpert MTB/RIF molecular test showed a sensitivity of 94.7% and a specificity of 93.9% for the diagnosis of Mycobacterium tuberculosis com-plex. Additionally, a case of resistance to rifampicin was identified.Conclusion: This study confirms the effectiveness of the GeneXpert MTB/RIF mo-lecular test over sputum smear microscopy for the timely diagnosis of tuberculosis. However, it is essential to consider the diverse conditions of the samples and pa-tients to optimize diagnostic accuracy

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Resumen La participación en programas de evaluación externa de la calidad (PEEC) dirigidos al diagnóstico de enfermedades genéticas permite obtener una medida objetiva del desempeño técnico y analítico de los laboratorios y es un requisito para la acreditación de los laboratorios clínicos bajo la norma ISO 15189. El objetivo de este estudio fue evaluar retrospectivamente el desempeño en los esquemas EMQN (European Molecular Genetics Quality Network) y CF Network (Cystic Fibrosis European Network) en el período 2014-2022. Se participó en un total de 88 esquemas. Se recolectó la información de nuestros puntajes y las medias de los laboratorios participantes en las categorías genotipificación, interpretación y exactitud de la información del paciente/informe. Se informó en forma completa el 90,9% (n=80) de los esquemas. El desempeño en genotipificación mostró puntajes superiores a la media en el 89,3% de los esquemas; 0,8% de los informes correspondieron a falsos negativos. En interpretación, el 66,7% de los esquemas evidenció un desempeño superior a la media y el 33,3% debajo de la media. La exactitud de la información del paciente/informe presentó puntajes superiores a la media en el 97,6% de los esquemas. Se observó una diferencia estadísticamente significativa en el porcentaje de esquemas con puntaje por encima de la media en el año 2022 (10/12 esquemas) respecto al año 2014 (1/6 esquemas) en la categoría interpretación (p=0,0128). En conclusión, la participación regular en PEEC tuvo impacto positivo en la calidad de los estudios y permite realizar mejoras continuas a partir de las recomendaciones sugeridas por estos programas.

Abstract Participation in external quality assessment programmes focused on rare genetic diseases makes it possible to assess the laboratory technical and analytical performance and it is a prerequisite for accreditation according to ISO 15189. The objective of this study was to perform a retrospective evaluation of our performance in the EMQN (European Molecular Genetics Quality Network) and the CF Network (Cystic Fibrosis European Network) programmes in the 2014-2022 period. The laboratory performance on genotyping, interpretation and clerical accuracy and patient identifiers in a total of 88 schemes were assessed. The information of our scores and the mean scores of all participating laboratories in the three categories were collected. A total of 90.9% of the schemes were fully completed. The performance in genotyping showed scores above the mean scores in 89.3% of the schemes; 0.8% of the reports correspond to false negative results. Regarding interpretation category, 66.7% of the schemes presented scores above the mean scores and 33.3% below the mean scores. The clerical accuracy and patient identifiers were above the mean scores in 97.6% of the schemes. A statistically significant difference in the percentage of schemes with a score above the mean for the interpretation category in the year 2022 (10/12 schemes) was observed compared to the year 2014 (1/6 schemes) (p=0.0128). In conclusion, regular participation in external quality assessment programmes had a positive impact on the quality of the studies and allows for continuous improvements based on the recommendations suggested by these programmes.

Resumo A participação em programas de avaliação externa da qualidade (PEECs) voltados para o diagnóstico de doenças genéticas permite obter uma mensuração objetiva do desempenho técnico e analítico dos laboratórios e é requisito para a acreditação dos laboratórios clínicos sob a norma ISO 15189. O objetivo desse estudo foi avaliar retrospectivamente o desempenho nos esquemas EMQN (European Molecular Genetics Quality Network) e CF Network (Cystic Fibrosis European Network) no período 2014-2022. Participou-se em um total de 88 esquemas. Foram coletadas informações de nossos escores e das médias dos laboratórios participantes nas categorias genotipagem, interpretação e precisão da informação do paciente/laudo. 90,9% (n=80) dos esquemas foram informados em sua totalidade. O desempenho na genotipagem apresentou escores acima da média em 89,3% dos esquemas; 0,8% dos laudos corresponderam a falsos negativos. Na interpretação, 66,7% dos esquemas apresentaram desempenho acima da média e 33,3% abaixo da média. A precisão das informações do paciente/laudo apresentou escores acima da média em 97,6% dos esquemas. Observou-se diferença estatisticamente significativa no percentual de esquemas com pontuação acima da média no ano de 2022 (10/12 esquemas) em relação ao ano de 2014 (1/6 esquemas) na categoria interpretação (p=0,0128). Em conclusão, a participação regular em PEECs teve um impacto positivo na qualidade dos estudos e permite fazer melhorias contínuas com base nas recomendações sugeridas por esses programas.

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Resumo: O objetivo deste estudo foi conhecer a opinião dos profissionais participantes da implantação-piloto de testes moleculares para detecção de Chlamydia trachomatis e Neisseria gonorrhoeae no Sistema Único de Saúde (SUS). Determinou-se a taxa de detecção de C. trachomatis e/ou N. gonorrhoeae e os fatores associados à infecção. A estratégia contou com laboratórios pertencentes à rede de carga viral de HIV e hepatites virais. A testagem teve como público-alvo pessoas mais vulnerabilizadas às infecções sexualmente transmissíveis, com coleta de amostras de urina e/ou swabs vaginal, endocervical e/ou uretral masculino. Questionários foram enviados aos gestores estaduais e profissionais de laboratório sobre a implantação-piloto. De maneira geral, as avaliações foram positivas. Entre as fraquezas, citou-se dificuldades na mudança do processo de trabalho, carência de recursos humanos, pouca sensibilidade de profissionais da assistência e ausência de tubo primário de urina, único insumo não fornecido. Como fortaleza, destaca-se aquisição centralizada de testes, compartilhamento de equipamentos e armazenamento de amostras à temperatura ambiente. Das 16.177 pessoas testadas, 1.004 (6,21%) foram positivas para C. trachomatis, 1.036 (6,4%) para N. gonorrhoeae e 239 (1,48%) para C. trachomatis/N. gonorrhoeae. A detecção de infecção ocorreu mais em pessoas jovens (≤ 24 vs. > 24 anos) (aOR = 2,65; IC95%: 2,38-2,96), do sexo masculino (aOR = 1,95; IC95%: 1,72-2,21), pardas/pretas (aOR = 1,06; IC95%: 1,05-1,11), na Região Sudeste (aOR = 1,08; IC95%: 1,02-1,13) e em amostras de secreção uretral (aOR = 1,46; IC95%: 1,41-1,52). Os resultados deste estudo demonstraram a importância da disponibilização da testagem em âmbito nacional, os quais subsidiaram a implantação da rede definitiva para detecção de C. trachomatis/N. gonorrhoeae no SUS.

Abstract: This study aimed to know the opinion of professionals participating in an experiment to implement a pilot for molecular tests to detect Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae at the Brazilian Unified National Health System (SUS). The detection rate of C. trachomatis and/or N. gonorrhoeae and the factors associated with infection were determined. The strategy included laboratories belonging to the HIV and viral hepatitis viral load network. Testing targeted people who are more vulnerable to sexually transmitted infections and collected urine samples and/or vaginal, endocervical, and/or male urethral swabs. Questionnaires were sent to state managers and laboratory professionals about the implementation of the pilot. Reviews were overall positive. Weaknesses included difficulties changing work processes, lack of human resources, poorly sensitized care professionals, and absence of primary urine tubes, the only input not provided. Strengths included the centralized acquisition of tests, sharing of equipment, and storage of samples at room temperature. Of the 16,177 people who were tested, 1,004 (6.21%) were positive for C. trachomatis; 1,036 (6.4%), for N. gonorrhoeae; and 239 (1.48%), for C. trachomatis/N. gonorrhoeae . Detection of any infection occurred more frequently in young people (≤ 24 vs. > 24 years) (adjOR = 2.65; 95%CI: 2.38-2.96), men (adjOR = 1.95; 95%CI: 1.72-2.21), brown/black individuals (adjOR = 1.06; 95%CI: 1.05-1.11), those in Southeastern Brazil (adjOR = 1.08; 95%CI: 1.02-1.13), and in urethral secretion samples (adjOR = 1.46; 95%CI: 1.41-1.52). Results show the importance of making testing available nationwide, which supported the implementation of a definitive network to detection C. trachomatis/N. gonorrhoeae in SUS.

Resumen: El objetivo de este estudio fue conocer la opinión de los profesionales participantes de la implantación piloto de pruebas moleculares para la detección de Chlamydia trachomatis y Neisseria gonorrhoeae en el Sistema Único de Salud brasileño (SUS). Se determinó la tasa de detección de C. trachomatis y/o N. gonorrhoeae y los factores asociados con la infección. En la estrategia participaron laboratorios pertenecientes a la red de carga viral de VIH y hepatitis virales. La prueba tuvo como público objetivo a personas más vulnerables a las infecciones de transmisión sexual, con recolección de muestras de orina y/o swabs vaginal, endocervicales y/o uretral masculino. Se enviaron cuestionarios a los gestores estatales y a los profesionales de laboratorio sobre la implementación piloto. En general, las evaluaciones fueron positivas. Entre las debilidades, se citó las dificultades en el cambio del proceso de trabajo, la falta de recursos humanos, los profesionales de la asistencia poco sensibilizados y la ausencia del contenedor de orina primaria, el único insumo no suministrado. Como fortalezas, se destaca la adquisición centralizada de pruebas, el intercambio de equipos y el almacenamiento de muestras a temperatura ambiente. De las 16.177 personas evaluadas, 1.004 (6,21%) fueron positivas para C. trachomatis, 1.036 (6,4%) para N. gonorrhoeae y 239 (1,48%) para C. trachomatis/N. gonorrhoeae. La detección de alguna infección ocurrió más en personas jóvenes (≤ 24 vs. > 24 años) (aOR = 2,65; IC95%: 2,38-2,96), del sexo masculino (aOR = 1,95; IC95%: 1,72-2,21), parda/negra (aOR = 1,06; IC95%: 1,05-1,11), localizadas en la región Sudeste (aOR = 1,08; IC95%: 1,02-1,13) y en muestras de secreción uretral (aOR = 1,46; IC95%: 1,41-1,52). Los resultados de este estudio demostraron la importancia de la disponibilidad de la prueba a nivel nacional, los cuales subsidiaron la implantación de la red definitiva para detección de C. trachomatis/N. gonorrhoeae en el SUS.

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Abstract Objective: To evaluate the correlation between multidetector computed tomography (MDCT) findings and laboratory test results in patients with pulmonary tuberculosis (PTB). Materials and Methods: A total of 57 patients were evaluated. Patients with suspected PTB were divided into groups according to the final diagnosis (confirmed or excluded), and the groups were compared in terms of sociodemographic variables, clinical symptoms, tomography findings, and laboratory test results. Results: Among the patients with a confirmed diagnosis of PTB, small pulmonary nodules with a peribronchovascular distribution were significantly more common in the patients with a positive sputum smear microscopy result (47.4% vs. 8.3%; p = 0.046), as were a miliary pattern (36.8% vs. 0.0%; p = 0.026), septal thickening (84.2% vs. 41.7%; p = 0.021), and lymph node enlargement (52.6% vs. 8.3%; p = 0.020). Small pulmonary nodules with a centrilobular distribution were significantly more common among the culture-positive patients (75.0% vs. 35.7%; p = 0.045), as was a tree-in-bud pattern (91.7% vs. 42.9%; p = 0.014). A tree-in-bud pattern, one of the main tomography findings characteristic of PTB, had a sensitivity, specificity, positive predictive value, and negative predictive value of 71.0%, 73.1%, 75.9%, and 67.9%, respectively. Conclusion: MDCT presented reliable predictive values for the main tomography findings in the diagnosis of PTB, being a safe tool for the diagnosis of PTB in patients with clinical suspicion of the disease. It also appears to be a suitable tool for the selection of patients who are candidates for more complex, invasive examinations from among those with high clinical suspicion of PTB and a negative sputum smear microscopy result.

Resumo Objetivo: Avaliar a correlação entre os achados na tomografia computadorizada multidetectores (TCMD) comparativamente aos resultados laboratoriais em pacientes com tuberculose pulmonar (TBP). Materiais e Métodos: Amostra de 57 pacientes foi avaliada. Pacientes com suspeita clínica de TBP foram divididos de acordo com a positividade do diagnóstico, e as variáveis sociodemográficas, sintomas clínicos e achados tomográficos e laboratoriais foram comparados. Resultados: Nos pacientes com TBP e baciloscopia positiva, foram verificadas frequências significativas para pequenos nódulos pulmonares com distribuição peribroncovascular (47,4% vs. 8,3%; p = 0,046) e miliar (36,8% vs. 0,0%; p = 0,026), espessamento septal (84,2% vs. 41,7%; p = 0,021) e linfonodomegalias (52,6% vs. 8,3%; p = 0,020). Em relação à cultura, os pequenos nódulos pulmonares com distribuição centrolobular (75,0% vs. 35,7%; p = 0,045) e opacidades em árvore em brotamento (91,7% vs. 42,9%; p = 0,014) apresentaram frequências significativamente superiores. Medidas de sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo e valor preditivo negativo para árvore em brotamento, um dos principais achados tomográficos característicos da TBP, foram, respectivamente, 71.0%, 73,1%, 75,9% e 67,9%. Conclusão: A TCMD apresentou medidas preditivas confiáveis para os principais achados tomográficos no diagnóstico de TBP, sendo uma ferramenta segura para o diagnóstico da doença em pacientes com suspeita clínica. Também se mostrou adequada para selecionar os pacientes para exames mais complexos e invasivos entre os com alta suspeita clínica de TBP e baciloscopia negativa.

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ABSTRACT Objective: to map the repercussions of using the rapid molecular test for diagnosing tuberculosis among people deprived of liberty in the scientific literature. Method: this is a scoping review following the recommendations of the Joanna Briggs Institute and PRISMA for Scoping Reviews. The search was conducted using controlled and free vocabulary in the following databases: EMBASE, Scopus, MEDLINE, Cinahl, Academic Search Premier, LILACS and Web of Science, in the Brazilian Digital Library of Theses and Dissertations and Google Scholar. The materials which answered the review question were selected by two independent reviewers based on reading the titles, abstracts and publications. All types of studies and publications were included. The extracted data was subjected to narrative synthesis and presented graphically. Results: a total of 13 among the 461 publications found were included in the review. The studies pointed out the following repercussions of using the rapid molecular test in the prison population: increase in the diagnosis of cases compared to sputum smear microscopy; reduction in diagnosis time, initiating treatment and isolation; identification of strains resistant to antibiotic therapy; reducing the prevalence and occurrence of tuberculosis; high agreement of test results with culture results; lower cost of the test when carried out in groups of samples or when screening is carried out by radiography. Conclusion: the literature indicated that the rapid molecular test is relevant for combating tuberculosis in prison units, so its use should be considered by authorities and managers as a strategic tool for controlling the disease.

RESUMEN Objetivo: mapear las repercusiones del uso de la prueba molecular rápida para el diagnóstico de tuberculosis en personas privadas de libertad en la literatura científica. Método: scoping review, siguiendo las recomendaciones del Joanna Briggs Institute y PRISMA for Scoping Reviews. La búsqueda se realizó utilizando vocabularios controlados y libres en las siguientes bases de datos: EMBASE, Scopus, MEDLINE, Cinahl, Academic Search Premier, LILACS y Web of Science, en la Biblioteca Digital Brasileña de Tesis y Disertaciones y en Google Scholar. Los materiales que respondieron a la pregunta de revisión fueron seleccionados por dos revisores independientes, basándose en la lectura de títulos, resúmenes y publicaciones. Se incluyeron todo tipo de estudios y publicaciones. Los datos extraídos fueron sometidos a síntesis narrativa y presentados gráficamente. Resultados: entre las 461 publicaciones encontradas, 13 fueron incluidas en la revisión. Los estudios señalaron las siguientes repercusiones del uso de la prueba molecular rápida en la población penitenciaria: aumento del diagnóstico de casos en comparación con la baciloscopia de esputo; reducción del tiempo de diagnóstico, inicio de tratamiento y aislamiento; identificación de cepas resistentes a la terapia con antibióticos; reducir la prevalencia y aparición de la tuberculosis; alta concordancia de los resultados de las pruebas con los resultados del cultivo; menor coste de la prueba cuando se realiza en grupos de muestras o cuando el cribado se realiza mediante radiografía. Conclusión: la literatura indicó que la prueba molecular rápida es relevante para el combate a la tuberculosis en las unidades penitenciarias, por lo que su uso debe ser considerado por autoridades y gestores como una herramienta estratégica para el control de la enfermedad.

RESUMO Objetivo: mapear as repercussões da utilização do teste rápido molecular para o diagnóstico de tuberculose entre as pessoas privadas de liberdade junto à literatura científica. Método: revisão de escopo seguiram-se as recomendações do Joanna Briggs Institute e do PRISMA for Scoping Reviews. A busca foi realizada com vocabulários controlados e livres nas bases de dados: EMBASE, Scopus, MEDLINE, Cinahl, Academic Search Premier, LILACS e Web of Science, na Biblioteca Digital Brasileira de Teses e Dissertações e no Google Scholar. Foram selecionados por dois revisores independentes, os materiais que respondiam à pergunta da revisão, a partir da leitura dos títulos, resumos e publicações. Foram incluídos todos os tipos de estudo e publicações. Os dados extraídos foram submetidos à síntese narrativa e apresentados graficamente. Resultados: entre as 461 publicações encontradas, 13 foram incluídas na revisão. Os estudos apontaram as seguintes repercussões da utilização do teste rápido molecular na população prisional: aumento no diagnóstico de casos comparado à baciloscopia; redução no tempo de diagnóstico, início do tratamento e isolamento; identificação de cepas resistentes à antibioticoterapia; redução da prevalência e ocorrência da tuberculose; alta concordância dos resultados do teste com os da cultura; menor custo do teste quando realizado em grupos de amostras ou quando o rastreamento é realizado por radiografia. Conclusão: a literatura apontou que o teste rápido molecular é relevante para o enfrentamento da tuberculose nas unidades prisionais, de modo que a sua utilização deve ser considerada pelas autoridades e gestores como uma ferramenta estratégica para o controle da doença.

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RESUMEN En el presente estudio se estimó el rendimiento diagnóstico de la prueba Xpert®Xpress SARS-CoV-2 en comparación con la RT PCR en tiempo real-protocolo Charité, para la detección de SARS-CoV-2 en pacientes peruanos. Se trató de un diseño de prueba diagnóstica que incluyó 100 muestras de hisopado nasal y faríngeo. Se obtuvo una concordancia global de 98,70% (IC95%: 92,98-99,97), con un coeficiente kappa de 0,97 (IC95%: 0,86-1.00); se estimó una sensibilidad y especificad relativa de 100% y 96,15%, respectivamente. Adicionalmente, el porcentaje del área bajo la curva ROC fue 98,08% en ambos casos y se obtuvo una especificidad analítica del 100% para los diferentes virus respiratorios evaluados. En conclusión, la prueba Xpert®Xpress SARS-CoV-2 a partir de muestras de hisopado nasal y faríngeo fue altamente sensible y específica, así mismo el coeficiente kappa mostró una excelente correlación, al compararla con la prueba de referencia.

ABSTRACT The present study assessed the diagnostic performance of the Xpert®Xpress SARS-CoV-2 test in comparison with the Charité protocol real-time RT PCR for the detection of SARS-CoV-2 in Peruvian patients. This was a diagnostic test study that included 100 nasal and pharyngeal swab samples. We obtained an overall concordance of 98.70% (95%CI: 92.98-99.97), with a kappa coefficient of 0.97 (95%CI: 0.86-1.00) and sensitivity and relative specificity rates of 100% and 96.15%, respectively. Additionally, the percentage of the area under the ROC curve was 98.08% in both cases, and an analytical specificity rate of 100% was obtained for the different respiratory viruses evaluated. In conclusion, the Xpert®Xpress SARS-CoV-2 test, by using nasal and pharyngeal swab samples, was highly sensitive and specific, and the kappa coefficient showed an excellent correlation when compared to the reference test.

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El Hospital Garrahan ha sido pionero en el diagnóstico molecular de patologías pediátricas en Argentina. Los avances tecnológicos de las últimas décadas en el área de la biología molecular, sentaron las bases para la optimización y ampliación del diagnóstico molecular a partir de la secuenciación masiva en paralelo de múltiples genes. El presente trabajo describe el proceso de implementación de los estudios de secuenciación de nueva generación y el desarrollo de la Unidad de Genómica en un hospital público pediátrico de alta complejidad, así como su impacto en las capacidades diagnósticas de enfermedades poco frecuentes de origen genético. La creación del Grupo Interdisciplinario de Estudios Genómicos constituyó la vía institucional para la toma de decisiones que implican la implementación de nuevos estudios genómicos y el establecimiento de prioridades diagnósticas, extendiendo la disponibilidad del diagnóstico molecular a más disciplinas. La Unidad de Genómica trabaja en diseñar las estrategias que permitan la mayor optimización de los recursos con los que cuenta el hospital, teniendo en cuenta el equipamiento disponible, las prioridades establecidas y la frecuencia de las distintas patologías. Se demuestra el salto significativo operado en nuestras capacidades diagnósticas, tanto en la variedad de enfermedades como en el número de genes analizados, habiendo estudiado a la fecha alrededor de 2.000 pacientes, muchos de los cuales ven de este modo finalizada su odisea diagnóstica. Los estudios de NGS se han convertido en una herramienta de la práctica diaria para la atención de un número importante de pacientes de nuestro hospital. Continuaremos trabajando para ampliar su aplicación a la mayor cantidad de patologías, a través de los mecanismos institucionales ya existentes (AU)

The Garrahan Hospital has been a pioneer in the molecular diagnosis of pediatric diseases in Argentina. The technological advances of the last decades in the area of molecular biology have laid the foundations for the optimization and expansion of molecular diagnostics through massive parallel sequencing of multiple genes. This study describes the process of implementation of next-generation sequencing studies and the development of the Genomics Unit in a public pediatric tertiary hospital, and its impact on the capacity to diagnose rare diseases of genetic origin. The creation of the Interdisciplinary Group of Genomic Studies constituted the institutional pathway for decision-making involving the implementation of new genomic studies and the establishment of diagnostic priorities, extending the availability of molecular diagnostics to additional disciplines. The Genomics Unit is working to design strategies that allow for optimization of the resources available to the hospital, taking into account the equipment available, the priorities established, and the frequency of the different diseases. It demonstrates the significant leap in our diagnostic capabilities, both in the variety of diseases and in the number of genes analyzed. To date, around 2,000 patients have been studies, many of whom have thus completed their diagnostic odyssey. NGS studies have become a tool in daily practice for the care of a significant number of patients in our hospital. We will continue working to expand its application to as many diseases as possible, through the existing institutional mechanisms (AU)

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Introducción: La enfermedad de Pompe (EP) o glucogenosis tipo II es una enfermedad autosómica recesiva causada por mutaciones en el gen GAA que codifica para la proteína alfa-1,4-glucosidasa. Su deficiencia lleva a un almacenamiento anormal de glucógeno en los lisosomas de varias células, a través de los diferentes tejidos, lo que causa un compromiso musculoesquelético predominante. Contenidos: Los fenotipos de la enfermedad dependen de las variantes genéticas y de los niveles de la actividad enzimática residual. La enfermedad se presenta como EP de inicio infantil, EP de inicio tardío y EP intermedio, por lo que es de suma importancia su diagnóstico temprano, por medio de estudios moleculares como la secuenciación de Sanger y la secuenciación de nueva generación. Conclusiones: Se ha demostrado, mediante diferentes estudios, que las variaciones genéticas pueden diferir entre etnias, y es importante su caracterización molecular para determinar el tratamiento más adecuado, de acuerdo con el estado del material inmunológico de reacción cruzada (CRIM).

Introduction: Pompe disease (PD) or Glycogenosis Type II is a rare autosomal recessive disease caused by mutations in the GAA gene that codes for the alpha-1,4-glucosidase protein. Its deficiency leads to abnormal glycogen storage in the lysosomes of various cells throughout the different tissues causing a predominant musculoskeletal compromise. Contents: The phenotypes of the disease depend on the genetic variants and the levels of residual enzyme activity, presenting as infantile-onset PD, late-onset PD, and intermediate PD; Therefore, early diagnosis of the disease through molecular studies such as Sanger sequencing and new generation sequencing is of utmost importance. Conclusions: It has been shown through different studies that genetic variations can vary between ethnic groups and the molecular characterization of the variants is important to determine the most appropriate treatment depending on the state of the cross-reactive immunological material (CRIM)

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The aim of this manuscript is to describe a hybrid care model to paediatricpatients on a virtual basis for dental treatment before conducting an in-person surveillance by using combined nasal/oral swabbing (NOS).This longitudinal study used a convenience sample of paediatric patients and members of the dental team from an undergraduate paediatric dentistry clinic at the University of São Paulo School of Dentistry during the COVID-19 pandemic. Firstly, parents werecontacted and teledentistry was used for screening children who need dental treatment. Appointments were scheduled once a week for two months, in which a pre-COVID-19 screening was performed. Dental team and children's parents completed a questionnaire addressing COVID-19-related symptoms. Members of the dental team and children were tested for COVID-19 before entering the dental clinic, by NOS and RT-PCR screening.Ninety-three individuals were enrolled and all of them completed the electronic questionnaire on symptoms and had NOS collected weekly, totalising 241 pairs of swabs. No participant reported COVID-19 symptomsbefore entering the clinic for treatment. Only one child tested positive in the third week of sampling. The hybrid care model associated with molecular testing for asymptomatics provided a safe clinical environment regarding the transmission of SARS-CoV-2 (AU).

El propósito de este manuscrito es describir un modelo híbrido de atención odontológica, a través de una plataforma virtual que precede a la realización de vigilancia molecular presencial mediante hisopado nasal/oral combinado, en pacientes pediátricos. Eneste estudio longitudinal se utilizó una muestra de conveniencia de pacientes pediátricos y miembros del equipo odontológico en la clínica de pregrado de la Facultad de Odontología de la Universidade de São Paulo durante la pandemia de COVID-19. En primerlugar, se contactó con los padres y se utilizó la consulta virtual para seleccionar a los niños que requerían tratamiento odontológico. Se programaron citas una vez a la semana durante dos meses, en las que se realizó el cribado previo a COVID-19. El equipo dental y los padres de los niños rellenaron un cuestionario en el que se abordaban los síntomas relacionados con la COVID-19. A continuación, los miembros del equipo dental y los niños fueron sometidos a pruebas de detección de COVID-19 antes de entrar en la clínica para atendimiento mediante cribado con hisopo nasal/oral y RT-PCR. Se inscribieron 93 personas, todas las cuales cumplimentaron el cuestionario electrónico sobre síntomas y se les recogieron muestras semanalmente, con un total de 241 pares dehisopos. Ningún participante declaró síntomas de COVID-19 antes de entrar en la clínica para recibir tratamiento. Sólo un niño dio positivo en la tercera semana de toma de muestras. El modelo de tratamiento híbrido unido a las pruebas moleculares para asintomáticos proporcionó un entorno clínico seguro con respecto a la transmisión del SARS-CoV-2 (AU).

O objetivo deste manuscrito é descrever um modelo de atendimento odontológico híbrido, por meio de uma plataforma virtual anterior a realização de uma vigilância molecular presencial usando esfregaço combinado nasal/oral, em pacientes pediátricos. Este estudo longitudinal utilizou uma amostra de conveniência de pacientes pediátricos e membros da equipe odontológica na clínica de graduação da Faculdade de Odontologia da Universidade de São Paulo durante a pandemia COVID-19. Primeiro, os pais foram contactados e a consulta virtual foi utilizada para o rastreio de crianças que necessitavam de tratamento odontológico. Foram agendadas consultas uma vez por semana durante dois meses, nas quais foi realizado um rastreio pré-COVID-19. A equipe odontológica e os pais das crianças preencheram um questionário que abordava os sintomas relacionados com a COVID-19. Em sequência, os membros da equipe odontológica e as crianças foram testados para o COVID-19 antes de entrarem na clínica para atendimento, através do rastreio com esfregaço nasal/oral e RT-PCR. Noventa e três indivíduos foram inscritos e todos eles preencheram o questionário eletrônico sobre os sintomas e tiveram amostras coletadas semanalmente, totalizando 241 pares de cotonetes. Nenhum participante comunicou sintomas de COVID-19 antes de entrar na clínica para tratamento. Apenas uma criança testou positivo na terceira semana de amostragem. O modelo de tratamento híbrido associado a testes moleculares para assintomática proporcionou um ambiente clínico seguro no que diz respeito à transmissão da SARS-CoV-2 (AU).

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Pancreatic cancer and biliary tract cancer have a poor prognosis. In recent years, the development of new diagnostic techniques has enabled the identification of the main genetic alterations involved in the development of these tumours. Multiple studies have assessed the ability to predict response to treatment of certain biomarkers, such as BRCA in pancreatic cancer, IDH1 or FGFR2 in biliary tract cancer and microsatellite instability or NTRK fusions in an agnostic tumour fashion. In this consensus, a group of experts selected by the Spanish Society of Medical Oncology (SEOM) and the Spanish Society of Pathology (SEAP) reviewed the role played by these mutations in the process of carcinogenesis and their clinical implications. Based on their results, a series of recommendations are made to optimize the determination of these biomarkers and thus help standardize the diagnosis and treatment of these tumours.

El cáncer de páncreas y el de vías biliares son tumores de mal pronóstico. En los últimos años, el desarrollo de nuevas técnicas diagnósticas de biología molecular ha permitido conocer las principales alteraciones génicas implicadas en el desarrollo de estos tumores. Múltiples estudios han evaluado el carácter predictivo de respuesta a tratamiento de determinados biomarcadores, como BRCA en cáncer de páncreas, IDH1 y FGFR2 en tumores de vía biliar; y la inestabilidad de microsatélites y las fusiones de NTRK, para predecir la respuesta al tratamiento. En este consenso, un grupo de expertos seleccionado por la Sociedad Española de Oncología Médica (SEOM) y la Sociedad Española de Anatomía Patológica (SEAP) ha revisado el papel que desempeñan estas mutaciones en el proceso de carcinogénesis y sus implicaciones clínicas. Como resultado, en este artículo se proponen una serie de recomendaciones para optimizar la determinación de estos biomarcadores, con el fin de fomentar la estandarización en el diagnóstico y el tratamiento de estos tumores.(AU)

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Pancreatic cancer and biliary tract cancer have a poor prognosis. In recent years, the development of new diagnostic techniques has enabled the identification of the main genetic alterations involved in the development of these tumours. Multiple studies have assessed the ability to predict response to treatment of certain biomarkers, such as BRCA in pancreatic cancer, IDH1 or FGFR2 in biliary tract cancer and microsatellite instability or NTRK fusions in an agnostic tumour fashion. In this consensus, a group of experts selected by the Spanish Society of Medical Oncology (SEOM) and the Spanish Society of Pathology (SEAP) reviewed the role played by these mutations in the process of carcinogenesis and their clinical implications. Based on their results, a series of recommendations are made to optimize the determination of these biomarkers and thus help standardize the diagnosis and treatment of these tumours.

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Several agents can cause hemoparasitic diseases in dogs, and blood-sucking arthropods transmit these diseases. These agents can cause several clinical manifestations and, in some cases, can kill the host. Because these agents are essential in animal health, this study aims to detect the frequency of Ehrlichia canis, Rickettsia rickettsii, Anaplasma platys, and Rangelia vitalii by real-time PCR and Babesia vogeli in dogs in the southern region of the city of São Paulo, São Paulo. Of the 98 dog samples, 18 (18.4%) tested positive with real-time polymerase chain reaction for at least one studied agent. Of these 18 samples, 17 tested positive for a single agent (11.2% for B. canis vogeli, 1.02% for R. vitalii, and 5.1% for E. canis), and one showed co-infection with B. canis vogeli and R. vitalii. The results demonstrate the presence of hemoparasites in the studied animals, which can influence the quality and life expectancy of these animals. The Rangeliadetection warns small animal clinicians to include it as a differential diagnosis for hemoparasitosis.(AU)

As hemoparasitoses em cães podem ser causadas por diversos agentes, sendo essas doenças transmitidas por artrópodes hematófagos. Esses agentes podem causar diversas manifestações clínicas e, em alguns casos, podem matar o hospedeiro. Este estudo teve como objetivo detectar por PCR em tempo real a frequência de Ehrlichia canis, Rickettsia rickettsii, Anaplasma platys, Rangelia vitalii e Babesia canis vogeli em amostras de cães da zona sul da cidade de São Paulo, Brasil. Das 98 amostras de cães, 18 (18,4%) testaram positivo com reação em cadeia da polimerase em tempo real para pelo menos um agente estudado. Destas 18 amostras, 17 testaram positivo para um único agente (11,2% para B. canis vogeli, 1,02% para R. vitalii e 5,1% para E. canis), e uma apresentou coinfecção com B. canis vogeli e R. vitalii. Os resultados demonstram a presença de hemoparasitas nos animais estudados, o que pode influenciar a qualidade e a expectativa de vida desses animais. Além disso, é o primeiro relato da detecção de R. vitalli na zona sul de São Paulo e serve de alerta para os clínicos de pequenos animais incluírem esse agente como diagnóstico diferencial para as hemoparasitoses.(AU)

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Introducción. Las infecciones de transmisión sexual (ITS) son y seguirán siendo un serio problema de salud pública en todo el mundo según los datos de la OMS, con el agravante que la mayoría de los casos son asintomáticos y, además, no existe otro reservorio distinto al humano. El diagnóstico se puede realizar con pruebas tradicionales y moleculares, estas últimas incluyen la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), de las cuales existen varios tipos, entre ellas, la PCR múltiple que tiene la capacidad de detectar ITS polimicrobianas a partir de una sola muestra. El objetivo de este estudio fue establecer cuáles fueron las infecciones de transmisión sexual más frecuentes en diferentes grupos de pacientes, así como determinar la utilidad del uso de la técnica de PCR múltiple en el diagnóstico de las ITS. Metodología. Se trata de un estudio observacional de corte transversal realizado entre los años 2021 y 2022 con pacientes que acudieron al servicio de diagnóstico del Laboratorio Clínico VID por sospecha de ITS. Las muestras recolectadas fueron evaluadas utilizando una prueba comercial basada en la técnica de PCR múltiple e hibridación. Las muestras procesadas fueron: orina e hisopados de endocérvix, uretra, recto, faringe y úlceras. Resultados. Se estudiaron 1.027 pacientes, de estos, 228 (22,2 %) fueron positivos para diferentes agentes de trasmisión sexual, distribuidos así: 50 (21,9 %) mujeres, 129 (56,6 %) hombres heterosexuales y 49 (21,5 %) hombres que tenían sexo con hombres (HSH). La edad promedio de las mujeres fue 30 años, y la de ambos grupos de hombres fue 36 años. Los microorganismos más frecuentemente identificados en mujeres fueron: C. trachomatis (A-K) en 28,6 %, seguido de virus herpes simplex tipo 2 (VHS-2) en 26,8 % y N. gonorrhoeae en 17,9 %. En hombres heterosexuales fueron C. trachomatis (A-K) en 37,5 %, N. gonorrhoeae en 21,5 % y VHS-2 en 18,7 %. En HSH fueron C. trachomatis (L1-L3) en 32,7 %, seguido de N. gonorrhoeae en 27,6 %, y de C. trachomatis (A-K) y VHS-2, ambos en 13,8 %. En 11 hombres heterosexuales, 8 HSH y en 6 mujeres, se identificó infección polimicrobiana. Conclusiones. C. trachomatis (A-K) fue el microorganismo más prevalente causante de ITS, seguido de N. gonorrhoeae en ambos grupos de hombres, y de VHS-2 en las mujeres, muy similar a lo reportado a nivel mundial. La prueba de PCR múltiple permite la detección de infecciones polimicrobianas comúnmente asociadas a ITS y el diagnóstico es preciso y confiable, incluso en pacientes asintomáticos

Sexually transmitted infections (STIs) are and will continue to be a serious public health problem throughout the world according to WHO data, with the aggravating factor that most cases are asymptomatic and, furthermore, there is no other reservoir other than humans. The diagnosis can be made with traditional and molecular tests, the latter include the polymerase chain reaction (PCR), of which there are several types, among them, multiplex PCR that has the capacity to detect polymicrobial STIs from a single sample. The objective of this study was to establish which were the most frequent sexually transmitted infections in different groups of patients, as well as to determine the usefulness of the multiplex PCR technique in the diagnosis of STIs. Methodology. This is an observational, cross-sectional study carried out between 2021 and 2022 with patients who attended the VID Clinical Laboratory for suspected STIs. The collected samples were evaluated using a commercial test based on the multiplex PCR technique and hybridization. The samples processed were: urine and swabs from endocervix, urethra, rectum, pharynx, and ulcers. Results. The study included 1,027 patients, of these, 228 (22.2%) were positive for different sexually transmitted agents, distributed as follows: 50 (21.9%) women, 129 (56.6%) heterosexual men and 49 (21.5%) men who had sex with men (MSM). The average age of the women was 30 years, and that of both groups of men was 36 years. The microorganisms most frequently identified in women were: C. trachomatis (A-K) in 28.6%, followed by herpes simplex virus type 2 (HSV-2) in 26.8% and N. gonorrhoeae in 17.9%. In heterosexual men they were C. trachomatis (A-K) in 37.5%, N. gonorrhoeae in 21.5% and HSV-2 in 18.7%. In MSM they were C. trachomatis (L1-L3) in 32.7%, followed by N. gonorrhoeae in 27.6%, and C. trachomatis (A-K) and HSV-2, both in 13.8%. Polymicrobial infection was identified in 11 heterosexual men, 8 MSM, and 6 women. Conclusions. C. trachomatis (A-K) was the most prevalent STI-causing microorganism, followed by N. gonorrhoeae in both groups of men, and HSV-2 in women, very similar to that reported worldwide. The multiplex PCR test allows the detection of polymicrobial infections commonly associated with STIs and the diagnosis is accurate and reliable, even in asymptomatic patients

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Introducción: la muerte súbita se trata de un evento fatal e imprevisible. Realizada la autopsia y estudios complementarios, en ausencia de otros hallazgos que expliquen la causa de muerte, se clasifica como muerte súbita inexplicada. Siendo recomendable en estos casos realizar análisis genéticos, especialmente con metodologías de secuenciación de siguiente generación, las que permiten explicar un porcentaje importante de estos casos. Objetivo: analizar las publicaciones más relevantes sobre secuenciación de siguiente generación, aplicada a la autopsia molecular, para determinar aquellas muertes súbitas inexplicables relacionadas a cardiomiopatías y canalopatías. Metodología: se realizó la búsqueda en PubMed del Instituto Nacional de Salud usando palabras clave en inglés y español: NGS, muerte súbita, autopsia molecular y sus combinaciones. Además, se realizaron búsquedas en OMIN y ClinVar relacionada a las diferentes afecciones cardiacas relacionadas a muerte súbita. Los criterios de inclusión: artículos completos en español e inglés de libre acceso, con antigüedad máxima de diez años, realizados en cualquier área geográfica y que trataran sobre la temática. Resultados: para secuenciación de siguiente generación, muerte súbita se encontraron más de 22000 y 65000 publicaciones, respectivamente. En cambio, al combinar las palabras clave se recuperaron 74 trabajos, según los criterios de inclusión y objetivo del trabajo se revisaron 67 artículos. La aplicación de las plataformas de secuenciación en la investigación de casos de muerte súbita tomo auge en el 2014 y en poco tiempo, demostraron su versatilidad para el análisis de una gran cantidad de genes simultáneamente, de forma rápida y a bajo costo. Conclusiones: las patologías asociadas a muerte súbita son múltiples, complejas y pueden generar fenotipos variables que dificultan el análisis genético de las mismas. Las plataformas de secuenciación de siguiente generación son sumamente útiles en los casos de muerte súbita inexplicada, además permiten la identificación de variantes genéticas en familiares para la implementación de medidas preventivas...(AU)

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Introducción. La paracoccidioidomicosis es una micosis sistémica y endémica en Latinoamérica. El cambio climático y el movimiento migratorio del huésped enfatizan la necesidad de optimizar el diagnóstico de esta infección. Objetivo. Evaluar la implementación de la detección de ADN de Paracoccidioides spp. al diagnóstico micológico de pacientes con sospecha de paracoccidioidomicosis. Materiales y métodos. Estudio retrospectivo con datos de laboratorio de pacientes con sospecha de paracoccidioidomicosis en un hospital de área no endémica. Resultados. Se analizaron los resultados de las muestras de 19 pacientes con sospecha clínica de paracoccidioidomicosis. El 90 % de los pacientes había nacido o visitado un área endémica de esta micosis en Latinoamérica. En 14 pacientes varones adultos se confirmó paracoccidioidomicosis por diagnóstico convencional. El examen directo fue positivo en 12 pacientes con enfermedad comprobada y en 4 de ellos se obtuvo crecimiento del hongo. Se detectaron anticuerpos contra Paracoccidioides spp. en ocho pacientes con la enfermedad. Se realizó PCR anidada con muestras de 14 pacientes para detectar ADN de Paracoccidioides spp. En 9 de los 10 pacientes con diagnóstico convencional de paracoccidioidomicosis se obtuvo una prueba de PCR positiva. Conclusiones. La implementación de técnicas moleculares para detectar ADN de Paracoccidioides spp. complementa el diagnóstico convencional de paracoccidioidomicosis y permite instaurar el tratamiento antifúngico, sobre todo en los casos clínicos donde no se observa la presencia del hongo en las muestras clínicas. La migración actual de poblaciones humanas dificulta el diagnóstico de paracoccidioidiomicosis y otras infecciones endémicas, por lo que se requiere optimizar el diagnostico micológico en los laboratorios clínicos para tratar pacientes con este tipo micosis desatendida.

Introduction. Paracoccidioidomycosis is a systemic mycosis endemic in Latin America. Climate change and host migration emphasize the need to optimize this infection diagnosis. Objective. To evaluate the implementation of Paracoccidioides spp. DNA detection in the mycological diagnosis of patients with suspected paracoccidioidomycosis. Materials and methods. It is a retrospective study with laboratory data from patients with clinical suspicion of paracoccidioidomycosis, who consulted a university hospital from a non-endemic area. Results. We analyzed the laboratory results of samples from 19 patients with suspected paracoccidioidomycosis. Seventeen out of 19 patients were born in or had visited an endemic area in Latin America. Fourteen adult male patients were confirmed to have paracoccidioidomycosis by conventional diagnosis: the direct examination was positive in 12 samples while fungal growth was found only in 4. Anti-Paracoccidioides spp. antibodies were detected in 10 patients, 8 of them with proven paracoccidioidomycosis. Nested PCR for Paracoccidioides spp. detection was performed on clinical samples from 14 patients, and positive results were obtained for 9 out of 10 patients with the conventional diagnosis of paracoccidioidomycosis. Conclusions. The incorporation of molecular techniques to detect Paracoccidioides spp. DNA complements the conventional diagnosis of paracoccidioidomycosis. This tool allows the prescription of antifungal treatment in those cases where the fungus is not observed in the clinical samples. Current human migrations difficult the mycological diagnosis of paracoccidioidomycosis and other fungal infections. For this reason, it is necessary to improve mycological diagnosis in clinical laboratories to adequately treat patients with this neglected mycosis.

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Resumen Introducción: La tomografía por emisión de positrones (PET) con antígeno de membrana específico de próstata (PSMA) mejora la estadificación del cáncer de próstata. Además, la intensidad de captación intraprostática del PSMA puede predecir resultados oncológicos clínicamente relevantes. Nuestro objetivo fue evaluar si la intensidad de captación de PSMA se asocia con el cáncer de próstata clínicamente significativo y poder conocer qué valor de captación de PSMA discrimina mejor esta relación. Métodos: Se realizó un estudio de cohorte de 40 pacientes con cáncer de próstata comprobado por biopsia previo a la realización de radioterapia externa. Se evaluó correlación entre intensidad de captación del PSMA intraprostático y los resulta dos patológicos adversos en la biopsia prostática. Se estudió qué valor de captación de PSMA discrimina mejor el cáncer de próstata clínicamente significativo utilizando curvas ROC. Resultados: El 40% de los pacientes tuvieron un cáncer de próstata clínicamente significativo, el maximum standardized uptake value (SUV max) tuvo una media de 11.5 (DE ± 7). La muestra arrojó un coeficiente de correlación Spearman de 0.4 (p = 0.007). El área bajo la curva (AUC) fue de 0.73, mostrando el punto de corte un SUV max ≥ 9.5, sensibilidad 0.81 y especificidad 0.71 en la detección de cáncer de próstata clínicamente significativo. Conclusión: la intensidad de captación del PSMA intraprostático puede ser una nueva herramienta diagnóstica en la detección del cáncer de próstata clínicamente significativo. Una intensidad de captación ≥ 9.5 tuvo una buena correlación con el cáncer de próstata clínicamente significativo.

Abstract Introduction: Positron emission tomography (PET) with prostate-specific membrane antigen (PSMA) improves prostate cancer staging. Furthermore, the intensity of intraprostatic uptake of PSMA can predict clinically relevant oncologic outcomes. The objective of this study is to evaluate whether the intensity of PSMA uptake is associated with clinically significant prostate cancer and to determine which value of PSMA uptake best dis criminates this relationship. Methods: A cohort study of 40 patients with biopsy-proven prostate cancer prior to external radiotherapy was conducted. The correlation between intraprostatic PSMA uptake intensity and adverse pathological findings in prostate biopsy was evaluated. Which PSMA uptake value better discriminates clinically significant prostate cancer was assessed using ROC curves. Results: Forty percent of the patients had a clinically significant prostate cancer and the maximum standardized uptake value (SUV max) had a mean of 11.5 (SD ± 7). The sample showed a Spearman correlation coefficient of 0.4 (p = 0.007). The area under the curve (AUC) was 0.73 and a SUV max ≥ 9.5 showed a sensitivity of 0.81 and a specificity of 0.71 in the detection of clinically significant prostate cancer. Conclusion: Intraprostatic PSMA uptake intensity can be a new diagnostic tool in the detection of clinically significant prostate cancer. An uptake intensity equal or greater than 9.5 is correlated with clinically significant prostate cancer.

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Abstract Introduction: The aim of this study was to extend our knowledge of the genetic background of Argentinean pediatric patients with developmental and epileptic encephalopathy (DEE) applying a next generation sequencing (NGS) panel. Methods: Thirty one patients with DEE were studied, including these phenotypes: Dravet syndrome (n:7), Dravet like syndrome (n:3), West syndrome (WS) (n:6), WS that evolved to Lennox-Gastaut syndrome (LGS) (n:4), epilepsy of infancy with migrating focal seizures (n:2), continuous spikes and waves during slow sleep evolving to LGS (n:1), LGS (n:1), myoclonic status in non-progressive encephalopathy (n:1), myoclonic atonic epilepsy (n:1), epileptic encephalopathy with multifocal spikes (n:1) and unclassified epileptic encephalopathy (n:4). Fifty-two genes frequently associated with DEE were studied by NGS in genomic DNA from peripheral blood. Results: Relevant variants were detected in 12 cases; 6 novel pathogenic or likely pathogenic variants, 6 previously reported as pathogenic and 1 variant of unknown sig nificance. Single-nucleotide heterozygous variants were identified in the SCN1A (5), GABRG2 (1), STXBP1 (2) genes, a mosaic variant in SCN2A (1) and a homozygous variant in SCN1B (1). Additionally, a heterozygous deletion involving the SCN1A, SCN2A and SCN3A genes (1), and the most frequent triplet repeat expansion in the ARX gene (1) were detected. Discussion: Genetic diagnosis was made in 39% of patients. We emphasize the importance of considering mosaic variants, copy number variants and hereditary forms when designing and interpreting molecular studies, to optimize diagnosis and management of patients. Approximately 42% of the de tected variants were novel, expanding the knowledge of the molecular basis of DEEs in Latin-American patients.

Resumen Introducción: El objetivo del estudio fue ampliar el conocimiento de las bases moleculares de las encefalopatías epilépticas y del desarrollo (EED) en pacientes pediátricos argentinos aplicando un panel de secuenciación de nueva generación (NGS). Métodos: Se analizaron 31 pacientes con los fenotipos clínicos de síndrome de Dra vet (n:7), síndrome símil Dravet (n:3), síndrome de West (SW) (n:6), SW que evoluciona a síndrome de Lennox Gastaut (SLG)(N:4), epilepsia de la infancia con crisis focales migratorias (n:2), actividad de punta onda continua durante el sueño que evolucionan a SLG (n:1), SLG (n:1), encefalopatía no progresiva con estatus mioclónico (n:1), epilepsia mioclónica atónica (n:1), encefalopatía epiléptica con espigas multifocales (n:1) y encefalopatía epiléptica indeterminada (n:4). Se estudiaron los 52 genes más frecuentemente asociados a EED a través de NGS, en ADN extraído de sangre periférica. Resultados: Se identificaron variantes relevantes en 12 casos, de las cuales 5 fueron nuevas y 6 previamente reportadas como patogénicas o posiblemente patogénicas, mien tras que una variante fue clasificada como de significado incierto. Variantes heterocigotas, de nucleótido único, se identificaron en los genes SCN1A (5), GABRG2 (1), STXBP1 (2), una variante en mosaico en SCN2A (1) y otra homocigota en SCN1B (1). Además, se detectó una deleción que involucra a los genes SCN1A, SCN2A y SCN3A (1) y la expansión de repeticiones de tripletes más frecuente en el gen ARX (1). Discusión: Se alcanzó el diagnóstico molecular en el 39% de los pacientes. Remarcamos la importancia de considerar variantes en mosaico, variantes en el número de copias y formas heredadas al momento de diseñar e interpretar los estudios moleculares, de tal forma de optimizar el diagnóstico y seguimiento de los pacientes con EED. Cabe destacar, que el 42% de las variantes detectadas fueron nuevas, ampliando nuestro conocimiento sobre las bases mole culares de las EED en población latino americana.