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1.
Biomedica ; 44(2): 182-190, 2024 05 30.
Artículo en Inglés, Español | MEDLINE | ID: mdl-39088528

RESUMEN

Introduction: The Mycobacterium chelonae species and the M. avium and M. abscessus complexes are emerging pathogens that cause mycobacteriosis. Treatment depends on the species and subspecies identified. The drugs of choice are macrolides and aminoglycosides. However, due to the resistance identified to these drugs, determining the microbe's sensitivity profile will allow clinicians to improve the understanding of the prognosis and evolution of these pathologies. Objective: To describe the macrolide and aminoglycoside susceptibility profile of cultures identified by Colombia's Laboratorio Nacional de Referencia de Mycobacteria from 2018 to 2022, as Mycobacterium avium complex, M. abscessus complex, and M. chelonae. Materials and methods. This descriptive study exposes the susceptibility profile to macrolides and aminoglycosides of cultures identified as M. avium complex, M. abscessus complex, and M. chelonae using the GenoType® NTM-DR method. Materials and methods: This descriptive study exposes the susceptibility profile to macrolides and aminoglycosides of cultures identified as M. avium complex, M. abscessus complex, and M. chelonae using the GenoType® NTM-DR method. Results: We identified 159 (47.3 %) cultures as M. avium complex, of which 154 (96.9 %) were sensitive to macrolides, and 5 (3.1 %) were resistant; all were sensitive to aminoglycosides. From the 125 (37.2 %) cultures identified as M. abscessus complex, 68 (54.4 %) were sensitive to macrolides, 57 (45.6 %) were resistant to aminoglycosides, and just one (0.8 %) showed resistance to aminoglycosides. The 52 cultures (15.5 %) identified as M. chelonae were sensitive to macrolides and aminoglycosides. Conclusions: The three studied species of mycobacteria have the least resistance to Amikacin. Subspecies identification and their susceptibility profiles allow the establishment of appropriate treatment schemes, especially against M. abscessus.


Introducción. Mycobacterium chelonae y los complejos Mycobacterium avium y M. abscessus, son agentes patógenos emergentes causantes de micobacteriosis. El tratamiento de esta infección depende de la especie y la subespecie identificadas. Los fármacos de elección son los macrólidos y aminoglucósidos, contra los cuales se ha reportado resistencia; por esta razón, el determinar el perfil de sensibilidad le permite al médico tratante comprender mejor el pronóstico y la evolución de estas infecciones. Objetivo. Describir los perfiles de sensibilidad ante macrólidos y aminoglucósidos, de los cultivos identificados como complejo Mycobacterium avium, complejo M. abscessus o especie M. chelonae, en el Laboratorio Nacional de Referencia de Micobacterias durante los años 2018 a 2022. Materiales y métodos. Se llevó a cabo un estudio descriptivo del perfil de sensibilidad a macrólidos y aminoglucósidos, de los cultivos identificados como complejo M. avium, complejo M. abscessus o M. chelonae, mediante la metodología GenoType® NTM-DR. Resultados. Los cultivos del complejo M. avium fueron 159 (47,3 %), de los cuales, 154 (96,9 %) fueron sensibles y 5 (3,1 %) resistentes a los macrólidos; todos fueron sensibles a los aminoglucósidos. Del complejo M. abscessus se estudiaron 125 (37,2 %) cultivos, 68 (54,4 %) resultaron sensibles y 57 (45,6 %) resistentes a los macrólidos; solo un cultivo (0,8 %) fue resistente a los aminoglucósidos. De M. chelonae se analizaron 52 cultivos (15,5 %), todos sensibles a los macrólidos y aminoglucósidos. Conclusiones. En las tres especies de micobacterias estudiadas, la resistencia contra la amikacina fue la menos frecuente. La identificación de las subespecies y los perfiles de sensibilidad permiten instaurar esquemas de tratamiento adecuados, especialmente en las micobacteriosis causadas por M. abscessus.


Asunto(s)
Aminoglicósidos , Macrólidos , Pruebas de Sensibilidad Microbiana , Infecciones por Mycobacterium no Tuberculosas , Mycobacterium abscessus , Complejo Mycobacterium avium , Mycobacterium chelonae , Macrólidos/farmacología , Mycobacterium abscessus/efectos de los fármacos , Mycobacterium abscessus/genética , Mycobacterium abscessus/aislamiento & purificación , Colombia/epidemiología , Mycobacterium chelonae/efectos de los fármacos , Mycobacterium chelonae/genética , Mycobacterium chelonae/aislamiento & purificación , Aminoglicósidos/farmacología , Humanos , Complejo Mycobacterium avium/efectos de los fármacos , Complejo Mycobacterium avium/genética , Complejo Mycobacterium avium/aislamiento & purificación , Infecciones por Mycobacterium no Tuberculosas/microbiología , Infecciones por Mycobacterium no Tuberculosas/epidemiología , Infecciones por Mycobacterium no Tuberculosas/tratamiento farmacológico , Antibacterianos/farmacología , Farmacorresistencia Bacteriana , Prevalencia , Farmacorresistencia Bacteriana Múltiple
2.
Biomedica ; 39(2): 330-338, 2019 06 15.
Artículo en Inglés, Español | MEDLINE | ID: mdl-31529820

RESUMEN

Introduction: Tuberculosis in children is a recent transmission reflection in the community. It is estimated that every year one million children get sick in the world because of this. In Colombia, 291 cases were notified in 2015. Objective: To update the information obtained from the surveillance activities of the drugresistance laboratory in children younger than 15 years of age in Colombia between 2010 and 2015. Materials and methods: This was a cross-sectional retrospective study. We studied the variables of origin, gender, age, type of tuberculosis, and HIV status in sensitive and resistant cases. We classified them according to their treatment background between new and previously treated to analyze their first and second line drug resistance profile. Results: From the notified cases, 16.4 % had a sensitivity test. 50.6 % were women, the pulmonary form was present in 70.6% cases, and 1.4 % presented with tuberculosis/HIV coinfection. We studied 565 cases, from which 503 (89.1 %) were new, presenting with multidrug-resistant tuberculosis, and a global resistance of 3.9 % and 9.5 %, respectively. From them, 62 had been previously treated (10.9 %), with 4.8 % and 19.3 % multidrug resistance and global resistance, respectively. There was no evidence of statistically significant differences during the studied years. Extremely resistant tuberculosis in new cases was 9.0 %. Conclusions: It is necessary for the Ministerio de Salud y Protección Social and the Instituto Nacional de Salud to promote the use of faster and more sensitive diagnostic tests such as the molecular ones recommended by the World Health Organization.


Introducción. La tuberculosis en los niños es un reflejo de transmisión reciente en la comunidad. Se estima que en el mundo cada año un millón de niños enferma por esta causa; en Colombia se notificaron 291 casos en el 2015. Objetivo. Actualizar la información obtenida de las actividades de vigilancia por el laboratorio de la farmacorresistencia del bacilo Mycobacterium tuberculosis en menores de 15 años en Colombia entre el 2010 y el 2015. Materiales y métodos. Se llevó a cabo un estudio retrospectivo de corte transversal. Se estudiaron las variables de procedencia, sexo, edad, tipo de tuberculosis y estado de HIV en los casos sensibles y resistentes. Estos se clasificaron como caso nuevo sin tratamiento o caso previamente tratado para analizar el perfil de resistencia a fármacos de primera y segunda línea. Resultados. De los 3.440 casos notificados, en el 16,4 % se practicó la prueba de sensibilidad. El 50,6 % eran mujeres, la forma pulmonar se presentó en el 70,6 % y el 1,4 % presentó coinfección de tuberculosis y HIV. Se estudiaron 565 casos, de los cuales 503 (89,0 %) eran nuevos: el 3,9 % con tuberculosis multirresistente y el 9,5 % con resistencia global. Los previamente tratados fueron 62 (10,9 %), 4,8 % con multirresistencia y 19,3 % con resistencia global. No se evidenciaron diferencias estadísticamente significativas en los años estudiados. La proporción de tuberculosis extremadamente resistente en los casos nuevos evaluados fue de 9,0 %. Conclusiones. Es necesario que el Ministerio de Salud y Protección Social y el Instituto Nacional de Salud promuevan el uso de pruebas diagnósticas rápidas y muy sensibles, como las moleculares recomendadas por la Organización Mundial de la Salud.


Asunto(s)
Tuberculosis Resistente a Múltiples Medicamentos/epidemiología , Adolescente , Distribución por Edad , Antituberculosos/farmacología , Antituberculosos/uso terapéutico , Niño , Preescolar , Colombia/epidemiología , Comorbilidad , Estudios Transversales , Femenino , Infecciones por VIH/epidemiología , Humanos , Lactante , Masculino , Pruebas de Sensibilidad Microbiana , Mycobacterium tuberculosis/efectos de los fármacos , Mycobacterium tuberculosis/aislamiento & purificación , Utilización de Procedimientos y Técnicas , Estudios Retrospectivos , Tuberculosis Resistente a Múltiples Medicamentos/tratamiento farmacológico , Tuberculosis Resistente a Múltiples Medicamentos/microbiología
3.
Biomedica ; 38(0): 87-94, 2018 08 01.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30184369

RESUMEN

Introduction: In recent years, there has been an increase in the prevalence of mycobacterioses caused by non-tuberculous mycobacteria, which are considered as emerging pathogens. Their presence depends on several factors such as the clinical history, the health status of the affected person, and the presence of these microorganisms in the water, the soil, and the animals, among others. Objective: To describe the mycobacteria and the etiological agent identified in isolates received at the Laboratorio Nacional de Referencia de Micobacterias of the Instituto Nacional de Salud between 2012 and 2016. Materials and methods: We conducted a retrospective analysis of samples from 273 patients with mycobacterioses. We analyzed the following variables: mycobacteriosis type, etiological agent, and associated predisposing factors. Results: 57.1% of the cases presented pulmonary mycobacteriosis; 26%, cutaneous; 10.6%, disseminated, and 2.6%, lymphatic. We found the Mycobacterium avium complex more frequently in pulmonary mycobacteriosis, while M. abscessus was more frequent in the extrapulmonary types of the disease. Patients with pulmonary mycobacteriosis had a history of tuberculosis more frequently than those with extrapulmonary forms. Conclusion: These findings highlight the importance of the differential diagnosis between M. tuberculosis complex species and non-tuberculous mycobacteria since the latter are genetically resistant to conventional antituberculosis drugs.


Asunto(s)
Infecciones por Mycobacterium no Tuberculosas/microbiología , Micobacterias no Tuberculosas/aislamiento & purificación , Colombia/epidemiología , Diagnóstico Diferencial , Susceptibilidad a Enfermedades , Genotipo , Humanos , Laboratorios , Infecciones por Mycobacterium no Tuberculosas/diagnóstico , Infecciones por Mycobacterium no Tuberculosas/epidemiología , Micobacterias no Tuberculosas/clasificación , Estudios Retrospectivos , Tuberculosis/diagnóstico
4.
Biomédica (Bogotá) ; 38(supl.2): 87-94, ago. 2018. tab
Artículo en Español | LILACS | ID: biblio-974010

RESUMEN

Introducción. En los últimos años se ha observado un aumento en la prevalencia de micobacteriosis ocasionadas por micobacterias no tuberculosas, las cuales hoy se consideran como agentes patógenos emergentes. Su presencia depende de varios factores, como los antecedentes clínicos, el estado de salud de la persona afectada y la presencia de estos microorganismos en el agua, el suelo y los animales, entre otros. Objetivo. Describir las micobacteriosis identificadas en el Laboratorio Nacional de Referencia de Micobacterias del Instituto Nacional de Salud, entre 2012 y 2016. Materiales y métodos. Se hizo un análisis retrospectivo que incluyó 273 pacientes con micobacteriosis. Las variables analizadas fueron el tipo de micobacteriosis, el agente etiológico y los factores de riesgo asociados. Resultados. El 57,1 % de los casos presentó micobacteriosis pulmonar, el 26 %, cutánea, el 10,6 %, diseminada, y el 2,6 %, linfática. La comparación entre la forma pulmonar y la extrapulmonar evidenció que el complejo Mycobacterium avium se presenta con mayor frecuencia en las micobacteriosis pulmonares, en tanto que M. abscessus fue más frecuente en las extrapulmonares. Los pacientes con micobacteriosis pulmonar presentaban antecedentes de tuberculosis con mayor frecuencia que aquellos con las formas extrapulmonares. Conclusión. Estos hallazgos resaltan la importancia del diagnóstico diferencial entre las especies del complejo M. tuberculosis y las micobacterias no tuberculosas, ya que estas últimas son resistentes genéticamente a los fármacos convencionales contra la tuberculosis.


Introduction: In recent years, there has been an increase in the prevalence of mycobacterioses caused by non-tuberculous mycobacteria, which are considered as emerging pathogens. Their presence depends on several factors such as the clinical history, the health status of the affected person, and the presence of these microorganisms in the water, the soil, and the animals, among others. Objective: To describe the mycobacteria and the etiological agent identified in isolates received at the Laboratorio Nacional de Referencia de Micobacterias of the Instituto Nacional de Salud between 2012 and 2016. Materials and methods: We conducted a retrospective analysis of samples from 273 patients with mycobacterioses. We analyzed the following variables: mycobacteriosis type, etiological agent, and associated predisposing factors. Results: 57.1% of the cases presented pulmonary mycobacteriosis; 26%, cutaneous; 10.6%, disseminated, and 2.6%, lymphatic. We found the Mycobacterium avium complex more frequently in pulmonary mycobacteriosis, while M. abscessus was more frequent in the extrapulmonary types of the disease. Patients with pulmonary mycobacteriosis had a history of tuberculosis more frequently than those with extrapulmonary forms. Conclusion: These findings highlight the importance of the differential diagnosis between M. tuberculosis complex species and non-tuberculous mycobacteria since the latter are genetically resistant to conventional antituberculosis drugs.


Asunto(s)
Mycobacterium , Micobacterias no Tuberculosas , Infecciones Oportunistas , Factores de Riesgo , Colombia , Coinfección
5.
Acta méd. colomb ; 42(1): 26-29, ene.-mar. 2017. tab
Artículo en Español | LILACS, COLNAL | ID: biblio-886335

RESUMEN

Resumen Introducción: después del complejo Mycobacterium tuberculosis, las principales especies de micobacterias causando enfermedad pulmonar son el complejo Mycobacterium avium (MAC) y Mycobacterium abscessus, el tratamiento es prolongado, presentan un amplio perfil de resistencia y algunas veces es necesaria la resección quirúrgica del tejido, dificultando la curación de algunos casos. Objetivo: realizar un análisis de los casos a los que se les aisló de muestras pulmonares MAC y M. abscessus en el periodo de 2012-2014 en el Laboratorio Nacional de Referencia de Colombia. Material y métodos: se realizó un estudio de serie de casos de 42 personas a las que se les aisló de muestras pulmonares MAC y M. abscessus, los cuales fueron identificados mediante pruebas fenotípicas y genotípicas. La fuente de información fue el Formato Único de Vigilancia de las Micobacterias que se recibe con cada uno de los aislados que llegan al INS. Se analizaron las variables edad, sexo, tipo de muestra y presencia de factores de riesgo. Resultados: en 32 de los casos se identificó MAC y en 10 M. abscessus como agente etiológico causante de enfermedad pulmonar, 26 (61.9%) de los casos tenían entre 51 y 86 años. Los principales factores de riesgo fueron: antecedente de tratamiento antituberculosis 16 (38.1%) y persona con VIH 7 (16.7%) y sin factor de riesgo 9 (21.2%) casos. Discusión: este trabajo reporta como agente etiológico MAC y M. abscessus en personas mayores de 50 años sin factores de riesgo, con antecedentes de tuberculosis, indicando que se debe fortalecer la realización de cultivo e identificación de especie en éstas para que tengan un adecuado diagnóstico y tratamiento.


Abstract Introduction: after the Mycobacterium tuberculosis complex, the main species of mycobacteria causing lung disease are Mycobacterium avium complex and Mycobacterium abscessus. The treatment is prolonged; they present a broad resistance profile and sometimes the surgical resection of the tissue is necessary, making healing difficult in some cases. Objective: to perform an analysis of the cases to which MAC and M. abscessus were isolated from pulmonary samples in the period from 2012 to 2014 in the National Reference Laboratory of Colombia. Materials and Methods: a case series study of 42 individuals to whom Mac and M. abcessus were isolated from pulmonary samples that were identified by phenotypic and genotypic tests, was carried out. The source of information was the unique format of surveillance of mycobacteria that is received with each of the isolates that come to the National Health Institute. The variables age, sex, type of sample and presence of risk factors were analyzed. Results: in 32 patients MAC was identified as etiological agent causing pulmonary disease and in 10 cases, M. abscessus was the agent. 26 (61.9%) of the patients were between 51 and 86 years of age. The main risk factors were: antecedent of anti-tuberculosis treatment in16 (38.1%),7 with HIV (16.7%) and without risk factor 9 cases (21.2%).


Asunto(s)
Humanos , Masculino , Femenino , Micobacterias no Tuberculosas , Complejo Mycobacterium avium , Mycobacterium abscessus , Enfermedades Pulmonares
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