RESUMEN
Wild birds carry a number of infectious agents, some of which may have pathogenic potential for the host and others species, including humans. Domestic pigeons (Columba livia) are important targets of study since these increasingly cohabit urban spaces, being possible spillover sources of pathogens to humans. In the present study, two genomes (PiGyV_Tq/RS/Br and PiGyV_RG/RS/Br), representative of Gyrovirus genus, family Anelloviridae, were detected in sera of free-living pigeons collected in Southern Brazil. The genomes exhibit less than 50% identity to previously described members of Gyrovirus genus, suggesting that they constitute a new viral species circulating in pigeons, to which the name "pigeon gyrovirus (PiGyV)" is proposed. The current study characterizes these two PiGyV genomes which, to date, are the first gyrovirus species identified in domestic pigeons.
Asunto(s)
Animales Salvajes/virología , Enfermedades de las Aves/virología , Columbidae/virología , Gyrovirus/aislamiento & purificación , Animales , Brasil , Genoma Viral , Gyrovirus/clasificación , Gyrovirus/genéticaRESUMEN
Unfortunately, the word "evolution" was found missing in title of the original article which is corrected here by this erratum. The original article has been corrected.
RESUMEN
Pigeon circovirus (PiCV) is taxonomically classified as a member of the Circovirus genus, family Circoviridae. The virus contains a single stranded DNA genome of approximately 2 kb, with minor length variations among different isolates. The occurrence of PiCV infections in pigeons (Columba livia) has been documented worldwide over the past 20 years; however, in Brazil there were still no reports on PiCV detection. This study identifies seven PiCV genomes recovered from domestic pigeons of South Brazil through high-throughput sequencing and shows a high frequency of PiCV infection, through quantitative real-time PCR. Phylogenetic classification was performed by maximum likelihood analysis of the full genomes, ORF V1 (Rep) and ORF C1 (Cap). The results show that either full genome or Cap based analysis allowed PiCV classification into five major clades (groups A to E), where Brazilian sequences were classified as A, C or D. Recombination analyses were carried out with Simplot and RDP4 and the results show that both Rep and Cap ORFs contain several recombination hotspots, pointing to an important role for such events in PiCV evolution.
Asunto(s)
Enfermedades de las Aves/virología , Infecciones por Circoviridae/veterinaria , Circovirus/aislamiento & purificación , Columbidae/virología , Evolución Molecular , Animales , Brasil , Infecciones por Circoviridae/virología , Circovirus/clasificación , Circovirus/genética , Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento , Sistemas de Lectura Abierta , FilogeniaRESUMEN
Two full-genome sequences of porcine circovirus type 3 (PCV3) are reported. The genomes were recovered from pooled serum samples from sows who had just delivered litters with variable numbers of stillbirths. The two circular genomes (PCV3-BR/RS/6 and PCV3-BR/RS/8) are 2,000 nucleotides long and contain two open reading frames (ORFs) oriented in opposite directions that encode the putative capsid (Cap) and replicase (Rep) proteins. The intergenic region contains a stem-loop motif, as reported for other circoviruses. Rolling circle replication motifs and putative helicase domains were identified in the Rep coding region. The degree of overall nucleotide similarity between the genomes reported here and those available at GenBank was higher than 97%. No PCV3 sequence was detected in pooled serum samples from sows which had no stillbirths on the same farms. However, further studies are necessary to confirm the association between PCV3 and the occurrence of stillbirths.
Asunto(s)
Infecciones por Circoviridae/virología , Circovirus/genética , Genoma Viral/genética , Mortinato/veterinaria , Enfermedades de los Porcinos/virología , Secuencias de Aminoácidos , Secuencia de Aminoácidos , Animales , Brasil , Proteínas de la Cápside/genética , Circovirus/aislamiento & purificación , Femenino , Sistemas de Lectura Abierta/genética , Filogenia , Embarazo , Porcinos , Replicación ViralRESUMEN
The Enzootic bovine leucosis is a chronic disease that causes economic losses to cattle. The detection of infected animals is an important step to control the disease. Therefore, this study aimed to investigate the prevalence of the virus in the Alto Uruguai Catarinense (Brazil) region and in parallel develop an enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) able to discriminate serologically positive and negative animals for bovine leukemia virus (BLV). For ELISA standardization, antigen and serum controls block titrations were performed. Then, 289 bovine serum samples collected from 42 dairy herds were analyzed. The results obtained were compared with Agar Gel Immunodiffusion (AGID). The comparative analysis concluded that the developed ELISA showed a satisfactory performance and was able to discriminate between infected and uninfected animals. Although the sensitivity (80.2%) and specificity (71.2%) of the test showed lower values than those found in previous studies using commercial kits or in-house assays, the ELISA developed can be associated with IDGA as a screening test, in order to reduce the number of false negatives. The prevalence of antibodies against BLV found was 31% for AGID and 45% for ELISA. From 42 properties, 47.6% had at least one positive animal in the ELISA. These results indicate that bovine leukosis is widespread in dairy herds of the region analyzed. Therefore, the test developed could be used as an initial screening tool, thus contributing to the serological monitoring of the herd.
A leucose enzoótica bovina é uma enfermidade crônica que acarreta prejuízos econômicos ao produtor. Detectar a presença de animais infectados é uma etapa importante no controle desta doença. Portanto, neste trabalho procurou-se investigar a prevalência do vírus na região do Alto Uruguai Catarinense e, paralelamente, desenvolver um ensaio imunoenzimático (ELISA) capaz de discriminar animais sorologicamente positivos e negativos para o vírus da leucose bovina (BLV). Para a padronização do ELISA foram realizadas titulações em bloco do antígeno e de amostras de soros controles. Em seguida, foram analisadas 289 amostras de soro bovino, colhidas em 42 rebanhos leiteiros. Os resultados obtidos foram comparados aos da imunodifusão em gel de ágar (IDGA). A análise dos critérios de comparação permitiu concluir que o ELISA desenvolvido apresentou um desempenho satisfatório e foi capaz de discriminar animais infectados e não infectados. Embora os valores de sensibilidade (80,2%) e especificidade (71,2%) do teste tenham sido menores aos relatados em estudos utilizando kits comerciais ou testes in house, o ELISA desenvolvido pode ser associado à IDGA como teste de triagem, visando diminuir o número de falso-negativos. A prevalência de anticorpos contra o BLV na população amostrada foi de 31% para a IDGA e 45% para o ELISA. Das propriedades, 20 (47,6%) possuíam ao menos um animal positivo no ELISA. Estes dados indicam que a leucose enzoótica bovina (LEB) está amplamente disseminada nos rebanhos leiteiros da região. Portanto, o teste desenvolvido pode servir como uma ferramenta de triagem inicial, contribuindo desta maneira para o monitoramento sorológico do rebanho.
Asunto(s)
Animales , Bovinos , Ensayo de Inmunoadsorción Enzimática/métodos , Ensayo de Inmunoadsorción Enzimática/veterinaria , Leucosis Bovina Enzoótica/sangre , Inmunodifusión/veterinaria , Inmunoensayo/veterinariaRESUMEN
The Enzootic bovine leucosis is a chronic disease that causes economic losses to cattle. The detection of infected animals is an important step to control the disease. Therefore, this study aimed to investigate the prevalence of the virus in the Alto Uruguai Catarinense (Brazil) region and in parallel develop an enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) able to discriminate serologically positive and negative animals for bovine leukemia virus (BLV). For ELISA standardization, antigen and serum controls block titrations were performed. Then, 289 bovine serum samples collected from 42 dairy herds were analyzed. The results obtained were compared with Agar Gel Immunodiffusion (AGID). The comparative analysis concluded that the developed ELISA showed a satisfactory performance and was able to discriminate between infected and uninfected animals. Although the sensitivity (80.2%) and specificity (71.2%) of the test showed lower values than those found in previous studies using commercial kits or in-house assays, the ELISA developed can be associated with IDGA as a screening test, in order to reduce the number of false negatives. The prevalence of antibodies against BLV found was 31% for AGID and 45% for ELISA. From 42 properties, 47.6% had at least one positive animal in the ELISA. These results indicate that bovine leukosis is widespread in dairy herds of the region analyzed. Therefore, the test developed could be used as an initial screening tool, thus contributing to the serological monitoring of the herd.(AU)
A leucose enzoótica bovina é uma enfermidade crônica que acarreta prejuízos econômicos ao produtor. Detectar a presença de animais infectados é uma etapa importante no controle desta doença. Portanto, neste trabalho procurou-se investigar a prevalência do vírus na região do Alto Uruguai Catarinense e, paralelamente, desenvolver um ensaio imunoenzimático (ELISA) capaz de discriminar animais sorologicamente positivos e negativos para o vírus da leucose bovina (BLV). Para a padronização do ELISA foram realizadas titulações em bloco do antígeno e de amostras de soros controles. Em seguida, foram analisadas 289 amostras de soro bovino, colhidas em 42 rebanhos leiteiros. Os resultados obtidos foram comparados aos da imunodifusão em gel de ágar (IDGA). A análise dos critérios de comparação permitiu concluir que o ELISA desenvolvido apresentou um desempenho satisfatório e foi capaz de discriminar animais infectados e não infectados. Embora os valores de sensibilidade (80,2%) e especificidade (71,2%) do teste tenham sido menores aos relatados em estudos utilizando kits comerciais ou testes in house, o ELISA desenvolvido pode ser associado à IDGA como teste de triagem, visando diminuir o número de falso-negativos. A prevalência de anticorpos contra o BLV na população amostrada foi de 31% para a IDGA e 45% para o ELISA. Das propriedades, 20 (47,6%) possuíam ao menos um animal positivo no ELISA. Estes dados indicam que a leucose enzoótica bovina (LEB) está amplamente disseminada nos rebanhos leiteiros da região. Portanto, o teste desenvolvido pode servir como uma ferramenta de triagem inicial, contribuindo desta maneira para o monitoramento sorológico do rebanho.(AU)
Asunto(s)
Animales , Bovinos , Ensayo de Inmunoadsorción Enzimática/métodos , Ensayo de Inmunoadsorción Enzimática/veterinaria , Leucosis Bovina Enzoótica/sangre , Inmunodifusión/veterinaria , Inmunoensayo/veterinariaRESUMEN
A leucose enzoótica bovina é uma enfermidade crônica que acarreta prejuízos econômicos ao produtor. Detectar a presença de animais infectados é uma etapa importante no controle desta doença. Portanto, neste trabalho procurou-se investigar a prevalência do vírus na região do Alto Uruguai Catarinense e, paralelamente, desenvolver um ensaio imunoenzimático (ELISA) capaz de discriminar animais sorologicamente positivos e negativos para o vírus da leucose bovina (BLV). Para a padronização do ELISA foram realizadas titulações em bloco do antígeno e de amostras de soros controles. Em seguida, foram analisadas 289 amostras de soro bovino, colhidas em 42 rebanhos leiteiros. Os resultados obtidos foram comparados aos da imunodifusão em gel de ágar (IDGA). A análise dos critérios de comparação permitiu concluir que o ELISA desenvolvido apresentou um desempenho satisfatório e foi capaz de discriminar animais infectados e não infectados. Embora os valores de sensibilidade (80,2%) e especificidade (71,2%) do teste tenham sido menores aos relatados em estudos utilizando kits comerciais ou testes in house, o ELISA desenvolvido pode ser associado à IDGA como teste de triagem, visando diminuir o número de falso-negativos. A prevalência de anticorpos contra o BLV na população amostrada foi de 31% para a IDGA e 45% para o ELISA. Das propriedades, 20 (47,6%) possuíam ao menos um animal positivo no