RESUMEN
In this work, 25,806 potentially amplifiable microsatellite loci (PAL) were identified in pejerrey, (Odontesthes humensis), with 21% of dinucleotide, 22% trinucleotide, 37% tetranucleotide, 13% pentanucleotide and 7% hexanucleotide. Of the total loci, 167 were classified as "Best PAL", more likely to be variables in populations. The results show that with a small coverage of the genome it was possible to identify a large number of microsatellite loci...
Asunto(s)
Animales , Genoma/genética , Sitios Genéticos/genética , Peces/genética , Acuicultura , Mejoramiento Genético , Repeticiones de Microsatélite/genéticaRESUMEN
Foram identificadas a divergência e a variabilidade genética, por meio do polimorfismo de seis marcadores microssatélites, de duas populações de Odontesthes bonariensis, utilizadas em manejos de cultivo e com potencial para fornecimento de reprodutores para programas de melhoramento genético. Do total de seis loci, cinco demonstraram eficiência para análise genética nas duas populações de O. bonariensis. A diferenciação genética significante nas populações analisadas pode fornecer a base para futuros programas de melhoramentos genéticos, através da combinação de material das populações divergentes para o desenvolvimento de linhagens ou execução de um programa de seleção.
Asunto(s)
Animales , Mejoramiento Genético , Variación Genética , Repeticiones de Microsatélite , Peces/crecimiento & desarrollo , Peces/genética , Adaptación Biológica , GenomaRESUMEN
Rhamdia quelen is an important Neotropical catfish species for fisheries and aquaculture in southern Brazil, where it is called Jandia. Like other native Brazilian species of economic importance, R. quelen genetics needs more attention for animal breeding programs. The growth hormone gene is known to be linked to a number of molecular markers and quantitative trait loci. We sequenced the coding region of the growth hormone gene with the primer walking technique. As in other Siluriformes, the R. quelen growth hormone gene has four introns and five exons, in a 1465-bp coding region. The tertiary structure of the encoded protein was predicted by bioinformatics; it has four α-helix structures connected by loops, which form a compressed complex maintained by two disulfide bridges.
Asunto(s)
Bagres/genética , Hormona del Crecimiento/genética , Animales , Hormona del Crecimiento/clasificación , América del SurRESUMEN
The goal of this research was to evaluate the ability of the genotyping information available in the Brazilian Criollo Horse Stud Book to describe the genetic variability of the breed and the exclusion probability determined in comparative tests. Altogether, two softwares were used in the analyses of the available genotypes: Cervus 3.0.3 and Genepop 4.0. Eight microsatellite markers totaled 109 alleles, with an average of 13.6 +/- 0.6 alleles per locus. Large differences between expected and observed heterozygosity were ubiquitous (0.821 +/- 0.07 and 0.470 +/- 0.17, respectively). Although the estimated null allele frequency caused initial concern (0.284 +/- 0.199), it is likely that it was a reflection of the inbreeding coefficients found (0.432 +/- 0.184). All loci showed significant deviation from Hardy-Weinberg equilibrium, with heterozygote deficit (P < 0.0001) and genotypic linkage disequilibrium with at least one marker. The high polymorphic information content (0.798 +/- 0.088) could not warrant exclusion power for three loci (HMS7, HMS6 and HTG4) above 50% (0.491 +/- 0.158). However, combined exclusion probability reached 99.61%, a level close to ideal. The results demonstrate the excellent performance of the markers assessed in describing the genetic status of the breed and suggest the considerable ability to establish parentage.
Asunto(s)
Caballos/genética , Animales , Brasil , Genotipo , Desequilibrio de Ligamiento/genéticaRESUMEN
A aqüicultura é atualmente uma importante fonte de proteína animal em várias regiões do mundo. A tilápia é mais resistente às doenças bacterianas, parasitárias e viróticas do que a maioria dos peixes cultivados. No entanto a ocorrência de parasitoses pode preocupar, principalmente sob condições de estresse e altas densidades de cultivo. Os platelmintos da classe Monogenea estão entre os principais ectoparasitas de água doce. A identificação das espécies de monogenéticos em peixes está baseada, principalmente, em aspectos morfológicos. Atualmente, a Biologia Molecular desempenha um importante papel em estudos ligados à sistemática e filogenia. A técnica por RAPD pode desempenhar um papel importante nesse sentido. A correta identificação dos parasitas é fundamental para sua melhor sistematização e compreensão das relações filogenéticas, o que pode ser relevante na separação de organismos próximos. A clara distinção entre espécies ou cepas pode ser fundamental para a identificação de diferentes características bioquímicas, ecológicas, etológicas, padrões de dispersão, patogenia, resistência a medicamentos, dentre outras. O caminho mais plausível a ser seguido parece ser a somatória dos enfoques morfológico com o refinamento das análises, por meio de métodos moleculares.
The aquaculture is currently an important source of animal protein in several areas of the world. The tilapia is more resistant to the bacterial, parasitic, and viral diseases than most of the farm-raised fish. However, parasitizes occurrence may worry, mainly under stress conditions and high cultivation densities. The platyhelminthes of the Monogenean class are among the main ectoparasites of freshwater. The identification of the monogenic species in fish is mainly based on morphological aspects. Nowadays, the molecular biology plays an important role in studies related to both systematic and phylogeny. The RAPD technique may support this important role, as well. The correct identification of the parasites is fundamental for the better systemization and understanding of the phylogenetic relationships, which can be relevant to the separation of close organisms. The clear distinction among the species or strains can be fundamental for the identification of different biochemical, ecological, and ethological characteristics, as well as for the dispersion patterns, pathogen, and the resistance to medicines, among others. The most plausible way to proceed seems to be the effort of the morphologic focuses together with the refinement of the analyses by molecular methods.
Actualmente la acuicultura es una importante fuente de proteína animal en varias regiones del mundo. La tilapia es más resistente a las enfermedades bacterianas, parasitárias y viróticas que la mayoría de los peces cultivados. Sin embargo, la incidencia de parasitosis puede preocupar, principalmente en condiciones de estrés y con altas densidades de cultivo. Los platelmintos de la clase Monogenea se encuentran entre los principales ectoparásitos de agua dulce. La identificación de las espécies de monogenéticos en peces se basa, principalmente, en aspectos morfológicos. Actualmente, la biologia molecular tiene un papel importante en estudios sobre sistemática y filogenía. La técnica RAPD puede representar un importante papel, en este sentido. La correcta identificación de los parásitos es fundamental para una mejor sistematización y comprensión de las relaciones filogenéticas, lo que puede ser importante en la separación de organismos próximos. La clara distinción entre espécies o cepas puede ser fundamental para la identificación de diferentes características bioquímicas, ecológicas, etológicas, padrones de dispersión, patogenía, resistencia a medicamentos, entre otras. El camino más lógico a seguir parece ser la suma de los enfoques morfológicos con la precisión de los análisis, por médio de métodos moleculares.